More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1987 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1987  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
468 aa  923    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.905736  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0924  sensor histidine kinase; MrsK2 protein  38.81 
 
 
464 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.115841  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0907  sensor histidine kinase  38.59 
 
 
464 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 
585 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1172  sensor histidine kinase  30.33 
 
 
580 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0874083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1022  histidine kinase  31.91 
 
 
580 aa  210  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4169  sensor histidine kinase  30.42 
 
 
580 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1217  sensor histidine kinase  29.21 
 
 
580 aa  204  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1039  sensor histidine kinase  28.87 
 
 
580 aa  203  5e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1017  sensor histidine kinase  28.87 
 
 
580 aa  203  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479121  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1118  sensor histidine kinase  28.87 
 
 
580 aa  203  5e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1197  sensor histidine kinase  28.87 
 
 
580 aa  203  5e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.970095 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1274  sensor histidine kinase  30.26 
 
 
580 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1016  sensor histidine kinase  29.93 
 
 
580 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.853387  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  32.14 
 
 
455 aa  150  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  32.14 
 
 
455 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0250  histidine kinase  30.32 
 
 
501 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.162679  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0295  sensor histidine kinase  30.5 
 
 
501 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1741  histidine kinase  31.86 
 
 
356 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000297787  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 
471 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0323  sensor histidine kinase  30.21 
 
 
501 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000371797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0243  sensor histidine kinase  30.29 
 
 
501 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 
597 aa  140  6e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0246  sensor histidine kinase  30.09 
 
 
501 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0304  sensor histidine kinase  30.97 
 
 
469 aa  139  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0202575  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0896  histidine kinase  30 
 
 
491 aa  138  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0297  sensor histidine kinase  29.82 
 
 
480 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0257  sensor histidine kinase  29.79 
 
 
501 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.11256  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0272  sensor histidine kinase  29.79 
 
 
501 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1402  sensor histidine kinase  32.78 
 
 
478 aa  137  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00361795  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0622  sensor histidine kinase  30.52 
 
 
484 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5020  sensor histidine kinase  30.88 
 
 
501 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.127373  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4717  sensor histidine kinase  30.52 
 
 
484 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0495  sensor histidine kinase  30.52 
 
 
487 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0640  sensor histidine kinase  30.52 
 
 
487 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0710  sensor histidine kinase  30.52 
 
 
484 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.29 
 
 
471 aa  136  7.000000000000001e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1716  sensor histidine kinase  31.86 
 
 
375 aa  136  9e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0201227  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0705  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 
432 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000747291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0497  sensor histidine kinase  30.19 
 
 
484 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 
349 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00141174  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0649  sensor histidine kinase  30.64 
 
 
481 aa  134  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3472  sensor protein VanS  31.85 
 
 
337 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.290028  hitchhiker  0.000000136839 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0498  histidine kinase  29.45 
 
 
487 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0553  sensor histidine kinase  30.19 
 
 
487 aa  134  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0584  sensor histidine kinase  30.19 
 
 
487 aa  134  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 
462 aa  133  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  30.79 
 
 
461 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0247  histidine kinase  27.36 
 
 
488 aa  133  6.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.60943  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  31.63 
 
 
310 aa  133  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1957  sensor histidine kinase, putative  31.16 
 
 
355 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.409258  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 
379 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 
379 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  30.79 
 
 
462 aa  132  9e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 
600 aa  132  9e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  31.62 
 
 
463 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1528  histidine kinase  28.89 
 
 
389 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2936  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.75 
 
 
379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1690  sensor histidine kinase  31.53 
 
 
375 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  31.62 
 
 
463 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 
513 aa  131  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  32.53 
 
 
463 aa  131  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  31.62 
 
 
463 aa  131  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 
470 aa  131  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4800  sensory transduction protein  28.91 
 
 
502 aa  131  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0181397  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  32.19 
 
 
463 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 
462 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 
639 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  31.51 
 
 
456 aa  130  6e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 
463 aa  130  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  31.55 
 
 
473 aa  130  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  30.24 
 
 
508 aa  130  7.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5253  sensory transduction protein  28.61 
 
 
481 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  31.96 
 
 
463 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 
640 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4665  histidine kinase  30.48 
 
 
502 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 
457 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 
639 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  31.62 
 
 
463 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 
597 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1870  sensor protein VanS  32.73 
 
 
291 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0256  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
459 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000440715  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 
487 aa  126  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1986  sensor protein VanS  31.39 
 
 
291 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.871173  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1913  sensory box histidine kinase  31.41 
 
 
288 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0149315 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 
612 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.12 
 
 
458 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.837767  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0985  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 
597 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0752971 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  26.89 
 
 
458 aa  125  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  27.05 
 
 
458 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3068  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 
479 aa  125  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000279575  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 
639 aa  124  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 
464 aa  124  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  27.17 
 
 
458 aa  124  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1833  sensor histidine kinase  31.17 
 
 
453 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  27.45 
 
 
458 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1807  sensor histidine kinase  31.17 
 
 
453 aa  124  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000147416  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2011  sensor histidine kinase  31.17 
 
 
459 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.62576e-42 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1976  sensor histidine kinase  31.17 
 
 
453 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00238966  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  27.45 
 
 
458 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>