More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_05750 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_05750  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 420 aa  842    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.101314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3868  histidine kinase  33.99 
 
 		 454 aa  238  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0154  sensor histidine kinase/response regulator  27.77 
 
 		 445 aa  169  7e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.313173 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1940  histidine kinase  30.29 
 
 		 478 aa  155  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.208818  normal  0.0947013 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2329  histidine kinase  30.96 
 
 		 470 aa  99.4  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0907  sensor histidine kinase  20.68 
 
 		 464 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0924  sensor histidine kinase; MrsK2 protein  20.26 
 
 		 464 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.115841  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0644  histidine kinase  22.16 
 
 		 430 aa  87.8  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00287376  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1987  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.95 
 
 		 468 aa  87.4  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.905736  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22040  signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 		 428 aa  86.3  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 438 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.592748 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3785  histidine kinase  32.75 
 
 		 438 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2092  histidine kinase  25.42 
 
 		 555 aa  80.5  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00961022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  27.76 
 
 		 468 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 		 476 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.763592  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 		 446 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0126885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2232  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 		 433 aa  77.8  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 		 446 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000501512  normal  0.872654 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0036  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 340 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1518  sensor histidine kinase  29 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250734  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  28.28 
 
 		 1407 aa  75.5  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1145  sensor histidine kinase  29 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0095  sensor histidine kinase  29 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1383  histidine kinase  33.62 
 
 		 471 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141813  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 468 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1018  sensor histidine kinase  29 
 
 		 442 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0933  sensor histidine kinase  29 
 
 		 442 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141795  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2258  sensor kinase protein  29 
 
 		 442 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4520  ATPase domain-containing protein  30.29 
 
 		 471 aa  74.7  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320419  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3568  sensor histidine kinase  28.45 
 
 		 430 aa  74.3  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1924  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.95 
 
 		 901 aa  74.3  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 446 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.704889  hitchhiker  0.0000182562 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1659  histidine kinase  27.46 
 
 		 594 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350157  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0277  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.26 
 
 		 957 aa  74.3  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105373  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1131  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.05 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2914  phosphate regulon sensor protein  28.14 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1042  phosphate regulon sensor protein  28.57 
 
 		 438 aa  73.9  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.230284 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3839  two-component sensor PhoR  23.5 
 
 		 434 aa  73.9  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000175105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0840  histidine kinase  30.89 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133727 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04120  signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 601 aa  73.9  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427723  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1022  histidine kinase  24.47 
 
 		 580 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1920  putative two-component sensor  29.44 
 
 		 445 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3105  phosphate regulon sensor protein  26.84 
 
 		 440 aa  73.2  0.000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2643  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 434 aa  72.8  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 		 331 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0968  histidine kinase  24.02 
 
 		 455 aa  72.4  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1507  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 		 488 aa  72.4  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22730  putative two-component sensor  28.21 
 
 		 445 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172157  normal  0.0503129 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1035  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.45 
 
 		 1041 aa  72.8  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73134 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4169  sensor histidine kinase  23.31 
 
 		 580 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1740  sensor histidine kinase  29.44 
 
 		 442 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187783  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1172  sensor histidine kinase  23.31 
 
 		 580 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0874083  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3301  phosphate regulon sensor protein  27.27 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.790712  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2767  histidine protein kinase PhoR  28.39 
 
 		 436 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0684991  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0544  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 		 487 aa  71.2  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.46 
 
 		 585 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 456 aa  70.9  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0083  histidine kinase  29.09 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1217  sensor histidine kinase  22.98 
 
 		 580 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0786  histidine protein kinase PhoR  28.39 
 
 		 436 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0029  sensory histidine kinase CreC  28.19 
 
 		 478 aa  70.1  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0571  histidine protein kinase PhoR  28.39 
 
 		 448 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0483305  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.89 
 
 		 487 aa  70.1  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0580  histidine protein kinase PhoR  28.39 
 
 		 436 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211794  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0133  histidine kinase  30.93 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1297  histidine protein kinase PhoR  28.39 
 
 		 436 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 		 473 aa  70.5  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1491  phosphate regulon sensor protein PhoR  28.39 
 
 		 436 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.690525  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1009  phosphate regulon sensor protein  26.84 
 
 		 440 aa  70.1  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1099  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.45 
 
 		 430 aa  70.1  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000024984 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1625  phosphate regulon sensor protein phoR  28.39 
 
 		 436 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5549  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 498 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.961003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3239  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 491 aa  70.1  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.204488  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1522  phosphate regulon sensor protein PhoR  28.39 
 
 		 436 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1409  Signal transduction histidine kinase-like  23.89 
 
 		 685 aa  69.7  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5784  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 497 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.321286 
 
 
-
 
NC_003296  RS02109  transmembrane two-component sensor kinase transcription regulator protein  31.3 
 
 		 438 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1274  sensor histidine kinase  22.98 
 
 		 580 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4762  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 850 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.400421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01027  phosphate regulon sensor protein  26.07 
 
 		 432 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.42 
 
 		 637 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0708  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 		 344 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.651662  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0722  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 		 344 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0142895 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0702  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 		 344 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.305923 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.04 
 
 		 449 aa  68.9  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0247  ATPase domain-containing protein  28.24 
 
 		 628 aa  68.9  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1039  sensor histidine kinase  22.88 
 
 		 580 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.96 
 
 		 453 aa  68.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1195  histidine kinase  27.85 
 
 		 439 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.843993  normal  0.58507 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2992  histidine kinase  25 
 
 		 908 aa  68.6  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1017  sensor histidine kinase  22.98 
 
 		 580 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479121  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1277  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 		 439 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1118  sensor histidine kinase  22.88 
 
 		 580 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3285  phosphate regulon sensor protein  25.22 
 
 		 438 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0522706 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1197  sensor histidine kinase  22.98 
 
 		 580 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.970095 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0825  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 		 439 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1560  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 		 504 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1183  histidine kinase  27.85 
 
 		 439 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.965515  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1306  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 		 439 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.935955  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6269  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 		 504 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.131733  normal  0.543189 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>