More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0133 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0133  histidine kinase  100 
 
 
375 aa  710    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759168  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8287  histidine kinase  52.6 
 
 
386 aa  311  9e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0977  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  55.21 
 
 
379 aa  285  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0722  histidine kinase  47.16 
 
 
340 aa  273  5.000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1196  ATPase domain-containing protein  59.15 
 
 
343 aa  260  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3087  histidine kinase  48.97 
 
 
392 aa  259  4e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0770082  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1089  histidine kinase  59.75 
 
 
353 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0982705 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1194  histidine kinase  60.44 
 
 
341 aa  217  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.991279 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.95 
 
 
413 aa  218  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0604808  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4664  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.27 
 
 
413 aa  195  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0036  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.58 
 
 
340 aa  192  8e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.28 
 
 
331 aa  192  9e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0708  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.9 
 
 
344 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.651662  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0722  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.9 
 
 
344 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0142895 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0702  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.9 
 
 
344 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.305923 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2016  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 
380 aa  178  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.52 
 
 
489 aa  149  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 
467 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 
639 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 
476 aa  146  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 
453 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 
639 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4691  histidine kinase  30.31 
 
 
368 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.7 
 
 
592 aa  143  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4604  sensor histidine kinase  28.57 
 
 
368 aa  143  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.1143  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 
639 aa  143  5e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 
640 aa  142  7e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5009  sensor histidine kinase  31.47 
 
 
368 aa  142  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4990  sensor histidine kinase  31.08 
 
 
368 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 
607 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.96 
 
 
581 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 
585 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 
585 aa  140  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 
621 aa  140  3e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 
600 aa  140  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 
554 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1783  PAS sensor protein  34.5 
 
 
554 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 
589 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 
385 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  36.03 
 
 
482 aa  139  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 
597 aa  139  7e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.2 
 
 
504 aa  139  8.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4744  sensor histidine kinase  31.08 
 
 
368 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4582  sensor histidine kinase  31.08 
 
 
368 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.24147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5105  sensor histidine kinase  31.08 
 
 
368 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 
468 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 
423 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 
425 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
458 aa  137  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4321  histidine kinase  38.96 
 
 
391 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5512  histidine kinase  31.92 
 
 
359 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 
597 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 
509 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 
444 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
587 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  33.04 
 
 
468 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3303  histidine kinase  35.86 
 
 
356 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000380955 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 
571 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151303  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  33.19 
 
 
565 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 
584 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  37.34 
 
 
512 aa  134  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
604 aa  134  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 
590 aa  134  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1400  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 
591 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0263941  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
487 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  35.93 
 
 
581 aa  133  5e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  40.17 
 
 
537 aa  133  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
581 aa  133  5e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1438  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 
394 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210229  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 
394 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  37.89 
 
 
486 aa  133  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 
584 aa  133  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 
596 aa  133  6.999999999999999e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  32.31 
 
 
496 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3227  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35 
 
 
890 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1623  sensor histidine kinase  27.86 
 
 
603 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  34.91 
 
 
581 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4962  sensor histidine kinase  31.47 
 
 
365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1587  sensor histidine kinase  27.48 
 
 
603 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0618595  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  30.23 
 
 
463 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1371  sensor histidine kinase  27.1 
 
 
603 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  34.48 
 
 
587 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1344  sensor histidine kinase  27.1 
 
 
603 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  34.48 
 
 
587 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1343  sensor histidine kinase  27.1 
 
 
603 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.830761  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1554  sensor histidine kinase  27.1 
 
 
603 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000192618 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  34.48 
 
 
587 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1482  sensor histidine kinase  27.1 
 
 
603 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  34.48 
 
 
587 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 
590 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  34.48 
 
 
587 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1186  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 
601 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  34.48 
 
 
587 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.85 
 
 
641 aa  130  3e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3071  histidine kinase  37.98 
 
 
369 aa  130  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000550678 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 
471 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  36.18 
 
 
518 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 
518 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 
582 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>