94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0378 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1217  Peptidase M16C associated domain protein  45.74 
 
 
999 aa  837    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00171078  normal  0.0476077 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20700  predicted Zn-dependent peptidase, insulinase  44.51 
 
 
972 aa  824    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04570  predicted Zn-dependent peptidase, insulinase  43.76 
 
 
985 aa  795    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0378  Peptidase M16C associated domain protein  100 
 
 
1010 aa  2090    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.858415  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1656  putative peptidase  33.57 
 
 
973 aa  533  1e-150  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0884161  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1395  peptidase, putative  33.96 
 
 
973 aa  532  1e-149  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.131852  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0645  peptidase M16C associated domain-containing protein  32.27 
 
 
992 aa  514  1e-144  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141412  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41654  predicted protein  34.4 
 
 
979 aa  494  9.999999999999999e-139  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00193617  normal  0.306826 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0695  peptidase M16C associated domain-containing protein  32.47 
 
 
968 aa  471  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00570537  decreased coverage  0.000127809 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0158  peptidase M16C associated domain-containing protein  32.51 
 
 
968 aa  469  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471453 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0490  Peptidase M16C associated domain protein  33.95 
 
 
969 aa  464  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1661  peptidase M16C associated domain-containing protein  32.48 
 
 
976 aa  464  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.902377 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1365  Peptidase M16C associated domain protein  33.96 
 
 
968 aa  457  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2677  PreP peptidase  31.54 
 
 
1046 aa  459  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2044  peptidase M16C associated domain-containing protein  32.78 
 
 
964 aa  458  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1565  Peptidase M16C associated domain protein  32.54 
 
 
968 aa  450  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0498145  normal  0.0547201 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0345  Peptidase M16C associated domain protein  30.97 
 
 
970 aa  430  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0396626  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_232  predicted protein  31.38 
 
 
986 aa  425  1e-117  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1780  Peptidase M16C associated domain protein  31.5 
 
 
969 aa  426  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.126781  normal  0.432438 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1179  peptidase M16C associated  29.82 
 
 
987 aa  366  1e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0156529 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0197  Peptidase M16C associated domain protein  27.73 
 
 
949 aa  356  1e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0673  metalloprotease  29.18 
 
 
985 aa  347  5e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223334  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1857  putative metalloprotease  28.66 
 
 
983 aa  340  9.999999999999999e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.263954  normal  0.471387 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2871  peptidase M16C associated domain-containing protein  29.6 
 
 
987 aa  329  2.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000230302  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1130  peptidase M16-like  27.37 
 
 
970 aa  318  4e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.827511  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1865  M16 family peptidase  28.16 
 
 
1017 aa  316  1.9999999999999998e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000469623  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4245  peptidase M16C associated domain-containing protein  28.27 
 
 
973 aa  311  5e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0157444  hitchhiker  0.0000000002425 
 
 
-
 
NC_002620  TC0211  insulinase family metalloprotease  27.27 
 
 
975 aa  308  3e-82  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1478  Peptidase M16C associated domain protein  29.04 
 
 
970 aa  305  4.0000000000000003e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2076  peptidase M16-like  26.38 
 
 
983 aa  288  4e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0233  peptidase M16 inactive domain protein  25.9 
 
 
971 aa  287  9e-76  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.312549  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1885  peptidase M16C associated domain-containing protein  26.59 
 
 
974 aa  286  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1643  peptidase M16C associated  29.21 
 
 
972 aa  282  2e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.765117  normal  0.901695 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2936  peptidase M16C associated domain-containing protein  26.95 
 
 
967 aa  281  3e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0337172  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2447  peptidase M16 domain protein  24.58 
 
 
1137 aa  277  6e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03853  Mitochondrial presequence protease Precursor (EC 3.4.24.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B6H7]  25.5 
 
 
1049 aa  274  5.000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.901124  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1842  peptidase M16 familiy  26.91 
 
 
1024 aa  268  5e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.284572  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2129  peptidase M16-like  25.77 
 
 
1025 aa  264  6.999999999999999e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1843  peptidase M16C associated domain-containing protein  26.6 
 
 
1032 aa  262  3e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000453364  unclonable  0.00000000218752 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32286  predicted protein  25.54 
 
 
1034 aa  259  1e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.414837  normal  0.522406 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76282  predicted protein  25.34 
 
 
1046 aa  225  3e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.967871  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84931  predicted protein  32.16 
 
 
1049 aa  85.9  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND04540  cytoplasm protein, putative  25.36 
 
 
1054 aa  80.9  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0121322  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  24.11 
 
 
896 aa  63.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1070  peptidase M16 domain protein  24.3 
 
 
878 aa  62.8  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  22.02 
 
 
937 aa  61.6  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_09434  zinc metalloprotease, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07610)  27.68 
 
 
1057 aa  57.4  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.169282 
 
 
-
 
NC_002936  DET1429  M16 family peptidase  23.32 
 
 
419 aa  55.5  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.400029  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0775  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  24.12 
 
 
421 aa  54.7  0.00001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  22.78 
 
 
945 aa  54.3  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0028  peptidase M16 domain protein  21.65 
 
 
423 aa  53.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4314  peptidase M16 domain-containing protein  24.34 
 
 
421 aa  52.8  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.518498  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  24.49 
 
 
476 aa  52.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2620  peptidase M16 domain-containing protein  23.23 
 
 
422 aa  52.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136175  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0936  peptidase M16 domain-containing protein  25 
 
 
420 aa  51.6  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.891405  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1653  peptidase M16 domain protein  24.2 
 
 
418 aa  51.6  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2119  putative zinc protease  24.46 
 
 
921 aa  51.2  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4342  peptidase M16-like  26.49 
 
 
431 aa  51.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472968  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0190  insulinase family metalloprotease  32.26 
 
 
939 aa  50.4  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.645084  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0175  M16 family peptidase  22.69 
 
 
423 aa  50.4  0.0002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0235  M16 family peptidase  21.29 
 
 
421 aa  49.7  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5911  peptidase M16-like protein, possible Zn-dependent  24.69 
 
 
957 aa  49.3  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  22.25 
 
 
461 aa  49.3  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2248  peptidase M16 domain-containing protein  28.24 
 
 
647 aa  48.5  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.082562  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0908  peptidase M16 domain protein  23.23 
 
 
429 aa  48.1  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  23.87 
 
 
464 aa  48.1  0.0009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1315  peptidase M16 domain protein  22.06 
 
 
418 aa  47.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0364  processing peptidase  22.98 
 
 
413 aa  48.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  23.08 
 
 
443 aa  47.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  24.55 
 
 
919 aa  47.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  23.02 
 
 
504 aa  47.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1237  peptidase M16 domain-containing protein  23.44 
 
 
419 aa  47.4  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4577  peptidase M16-like  22.73 
 
 
429 aa  47  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10390  predicted Zn-dependent peptidase  24.23 
 
 
446 aa  47  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0193865  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  23.17 
 
 
443 aa  47  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2480  processing peptidase  24.76 
 
 
409 aa  47  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.116238  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1988  peptidase  22.52 
 
 
425 aa  46.6  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.473993  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2190  peptidase M16 domain-containing protein  26.53 
 
 
413 aa  46.2  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5111  peptidase M16 domain-containing protein  23.27 
 
 
438 aa  46.2  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591794  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1211  peptidase, M16 family  22.05 
 
 
419 aa  46.6  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.150859  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  23.67 
 
 
463 aa  46.2  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  23.27 
 
 
489 aa  46.2  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2190  peptidase M16 domain protein  23.94 
 
 
879 aa  46.2  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3234  processing peptidase  23.98 
 
 
421 aa  46.2  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  24.5 
 
 
461 aa  46.6  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1074  peptidase family M16  21.76 
 
 
434 aa  46.2  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1069  peptidase M16 domain-containing protein  23 
 
 
435 aa  45.4  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.421262  hitchhiker  0.00357472 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  23.35 
 
 
461 aa  45.4  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2341  peptidase M16-like  25.67 
 
 
426 aa  44.7  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1835  peptidase M16 domain protein  22.78 
 
 
949 aa  44.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300051  normal  0.619696 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1147  processing peptidase  22.56 
 
 
426 aa  45.1  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  23.48 
 
 
443 aa  44.7  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0840  putative zinc protease  22.99 
 
 
429 aa  44.3  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.754247 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27040  zinc protease  25.57 
 
 
908 aa  44.7  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.883186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>