238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2044 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1565  Peptidase M16C associated domain protein  51.8 
 
 
968 aa  921    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0498145  normal  0.0547201 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0695  peptidase M16C associated domain-containing protein  50.36 
 
 
968 aa  939    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00570537  decreased coverage  0.000127809 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2677  PreP peptidase  61.94 
 
 
1046 aa  1192    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0345  Peptidase M16C associated domain protein  57.86 
 
 
970 aa  1136    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0396626  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_232  predicted protein  41.84 
 
 
986 aa  764    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0490  Peptidase M16C associated domain protein  52.49 
 
 
969 aa  958    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0158  peptidase M16C associated domain-containing protein  49.9 
 
 
968 aa  944    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471453 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1780  Peptidase M16C associated domain protein  50.37 
 
 
969 aa  904    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.126781  normal  0.432438 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1661  peptidase M16C associated domain-containing protein  55.03 
 
 
976 aa  1038    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.902377 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2044  peptidase M16C associated domain-containing protein  100 
 
 
964 aa  1957    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1365  Peptidase M16C associated domain protein  70.39 
 
 
968 aa  1335    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41654  predicted protein  49.47 
 
 
979 aa  938    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00193617  normal  0.306826 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1656  putative peptidase  34.98 
 
 
973 aa  634  1e-180  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0884161  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1395  peptidase, putative  35.12 
 
 
973 aa  634  1e-180  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.131852  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0645  peptidase M16C associated domain-containing protein  34.06 
 
 
992 aa  609  1e-173  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141412  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0673  metalloprotease  36.34 
 
 
985 aa  559  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223334  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4245  peptidase M16C associated domain-containing protein  34.5 
 
 
973 aa  519  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0157444  hitchhiker  0.0000000002425 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1179  peptidase M16C associated  32.19 
 
 
987 aa  506  9.999999999999999e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0156529 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2871  peptidase M16C associated domain-containing protein  35.12 
 
 
987 aa  500  1e-140  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000230302  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1478  Peptidase M16C associated domain protein  34.94 
 
 
970 aa  498  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1130  peptidase M16-like  32.26 
 
 
970 aa  489  1e-136  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.827511  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1857  putative metalloprotease  32.1 
 
 
983 aa  484  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.263954  normal  0.471387 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1643  peptidase M16C associated  34.58 
 
 
972 aa  468  9.999999999999999e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.765117  normal  0.901695 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04570  predicted Zn-dependent peptidase, insulinase  33.06 
 
 
985 aa  466  9.999999999999999e-131  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1217  Peptidase M16C associated domain protein  34.31 
 
 
999 aa  465  1e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00171078  normal  0.0476077 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1865  M16 family peptidase  31.21 
 
 
1017 aa  459  9.999999999999999e-129  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000469623  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20700  predicted Zn-dependent peptidase, insulinase  32.68 
 
 
972 aa  459  1e-127  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0378  Peptidase M16C associated domain protein  32.78 
 
 
1010 aa  458  1e-127  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.858415  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2076  peptidase M16-like  33.33 
 
 
983 aa  456  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1885  peptidase M16C associated domain-containing protein  32.91 
 
 
974 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32286  predicted protein  32.51 
 
 
1034 aa  446  1e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.414837  normal  0.522406 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2936  peptidase M16C associated domain-containing protein  33.51 
 
 
967 aa  437  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0337172  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0211  insulinase family metalloprotease  30.93 
 
 
975 aa  426  1e-117  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0197  Peptidase M16C associated domain protein  30.24 
 
 
949 aa  422  1e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03853  Mitochondrial presequence protease Precursor (EC 3.4.24.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B6H7]  30 
 
 
1049 aa  399  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.901124  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0233  peptidase M16 inactive domain protein  26.21 
 
 
971 aa  387  1e-106  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.312549  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2129  peptidase M16-like  28.78 
 
 
1025 aa  362  2e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1842  peptidase M16 familiy  28.54 
 
 
1024 aa  358  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.284572  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1843  peptidase M16C associated domain-containing protein  28.8 
 
 
1032 aa  350  9e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000453364  unclonable  0.00000000218752 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2447  peptidase M16 domain protein  24.17 
 
 
1137 aa  296  1e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76282  predicted protein  25.2 
 
 
1046 aa  289  2e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.967871  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84931  predicted protein  27.65 
 
 
1049 aa  109  3e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND04540  cytoplasm protein, putative  21.49 
 
 
1054 aa  108  6e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0121322  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_09434  zinc metalloprotease, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07610)  28.62 
 
 
1057 aa  92  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.169282 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  26.72 
 
 
945 aa  90.1  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  26.01 
 
 
937 aa  87  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6664  peptidase M16 domain protein  25.29 
 
 
452 aa  66.6  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  23.4 
 
 
919 aa  65.5  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  23.8 
 
 
896 aa  65.1  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1070  peptidase M16 domain protein  31.82 
 
 
878 aa  64.7  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2217  peptidase M16 domain-containing protein  27.11 
 
 
454 aa  61.6  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.800004  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5316  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  27.97 
 
 
942 aa  61.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  26.87 
 
 
461 aa  60.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_002620  TC0190  insulinase family metalloprotease  24.64 
 
 
939 aa  58.9  0.0000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.645084  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0240  peptidase M16 domain protein  27.84 
 
 
948 aa  58.5  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.239759  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0775  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  23.67 
 
 
421 aa  58.2  0.0000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1462  peptidase M16 domain protein  24.77 
 
 
413 aa  57.4  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.287908  normal  0.0135177 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3947  peptidase M16 domain-containing protein  30.52 
 
 
481 aa  57.8  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2605  peptidase M16 domain protein  30.56 
 
 
460 aa  56.2  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.204595 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  24.63 
 
 
464 aa  56.2  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2328  peptidase M16 domain-containing protein  30.56 
 
 
460 aa  56.2  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.977171  normal  0.638567 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4342  peptidase M16-like  29.48 
 
 
431 aa  55.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472968  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2620  peptidase M16 domain-containing protein  22.63 
 
 
422 aa  56.2  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136175  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1429  M16 family peptidase  24.05 
 
 
419 aa  55.8  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.400029  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2341  peptidase M16-like  28.11 
 
 
426 aa  55.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  26.43 
 
 
484 aa  55.8  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0394  peptidase M16 domain protein  25.75 
 
 
459 aa  55.1  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0405646  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3177  peptidase M16 domain protein  25.29 
 
 
422 aa  55.1  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.56337  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  29.71 
 
 
463 aa  54.7  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2480  processing peptidase  28.75 
 
 
409 aa  54.7  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.116238  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2283  peptidase M16 domain protein  30 
 
 
460 aa  54.7  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366903  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1801  peptidase M16 domain-containing protein  26.81 
 
 
469 aa  54.7  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0496  processing peptidase  25.24 
 
 
903 aa  53.9  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000425054  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  28 
 
 
461 aa  54.3  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2253  peptidase M16 domain-containing protein  23.18 
 
 
912 aa  54.3  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.890772  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1315  peptidase M16 domain protein  26.04 
 
 
418 aa  54.3  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1365  peptidase M16 domain-containing protein  25.28 
 
 
428 aa  53.5  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.481367  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19030  predicted Zn-dependent peptidase  27.33 
 
 
427 aa  53.1  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.498908  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0895  peptidase M16 domain protein  26.9 
 
 
427 aa  53.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0921  peptidase M16 domain protein  26.9 
 
 
427 aa  53.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0782213  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1211  peptidase, M16 family  22.12 
 
 
419 aa  53.5  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.150859  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1835  peptidase M16 domain protein  24.91 
 
 
949 aa  53.5  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300051  normal  0.619696 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1382  peptidase M16 domain-containing protein  25.69 
 
 
466 aa  53.5  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.975318  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  28.34 
 
 
448 aa  53.5  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  23.54 
 
 
947 aa  53.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1340  peptidase M16 domain-containing protein  25 
 
 
462 aa  53.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000321073 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1339  peptidase M16 domain-containing protein  25.28 
 
 
428 aa  53.5  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2153  M16 family peptidase  21.9 
 
 
427 aa  52.8  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.197397  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4194  peptidase M16 domain protein  23.48 
 
 
424 aa  53.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1097  putative zinc protease  30 
 
 
448 aa  52.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4233  peptidase M16 domain protein  23.48 
 
 
424 aa  53.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00835158 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2119  putative zinc protease  25.12 
 
 
921 aa  52.8  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  30 
 
 
448 aa  52.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1977  peptidase M16-like protein  26.85 
 
 
928 aa  52.8  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.794367  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1348  peptidase M16 domain protein  24.04 
 
 
439 aa  52.4  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.387051  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3596  pseudouridine synthase, Rsu  22.49 
 
 
912 aa  52.4  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1272  peptidase M16 domain protein  28.11 
 
 
470 aa  52  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720642  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1147  peptidase M16 domain-containing protein  23.05 
 
 
431 aa  52  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3129  peptidase M16 domain-containing protein  25.97 
 
 
967 aa  52.4  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1947  peptidase M16 domain-containing protein  26.04 
 
 
422 aa  52  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>