163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0345 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2677  PreP peptidase  54.03 
 
 
1046 aa  1050    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0490  Peptidase M16C associated domain protein  48.72 
 
 
969 aa  902    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_232  predicted protein  40.41 
 
 
986 aa  724    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1661  peptidase M16C associated domain-containing protein  50.1 
 
 
976 aa  920    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.902377 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2044  peptidase M16C associated domain-containing protein  57.86 
 
 
964 aa  1136    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1565  Peptidase M16C associated domain protein  49.79 
 
 
968 aa  878    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0498145  normal  0.0547201 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0345  Peptidase M16C associated domain protein  100 
 
 
970 aa  1985    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0396626  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41654  predicted protein  46.58 
 
 
979 aa  884    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00193617  normal  0.306826 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0158  peptidase M16C associated domain-containing protein  45.64 
 
 
968 aa  837    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471453 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0695  peptidase M16C associated domain-containing protein  46.77 
 
 
968 aa  867    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00570537  decreased coverage  0.000127809 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1365  Peptidase M16C associated domain protein  58.27 
 
 
968 aa  1098    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1780  Peptidase M16C associated domain protein  47.15 
 
 
969 aa  816    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.126781  normal  0.432438 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0645  peptidase M16C associated domain-containing protein  35.88 
 
 
992 aa  627  1e-178  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141412  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1656  putative peptidase  34.31 
 
 
973 aa  615  1e-175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0884161  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1395  peptidase, putative  34.41 
 
 
973 aa  615  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.131852  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0673  metalloprotease  34.58 
 
 
985 aa  507  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223334  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1179  peptidase M16C associated  32.32 
 
 
987 aa  496  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0156529 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2871  peptidase M16C associated domain-containing protein  34.29 
 
 
987 aa  496  1e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000230302  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1478  Peptidase M16C associated domain protein  33.26 
 
 
970 aa  482  1e-134  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1217  Peptidase M16C associated domain protein  34.43 
 
 
999 aa  477  1e-133  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00171078  normal  0.0476077 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1130  peptidase M16-like  31.34 
 
 
970 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.827511  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20700  predicted Zn-dependent peptidase, insulinase  33.67 
 
 
972 aa  462  9.999999999999999e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04570  predicted Zn-dependent peptidase, insulinase  31.74 
 
 
985 aa  451  1e-125  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4245  peptidase M16C associated domain-containing protein  31.69 
 
 
973 aa  450  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0157444  hitchhiker  0.0000000002425 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1865  M16 family peptidase  30.68 
 
 
1017 aa  440  9.999999999999999e-123  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000469623  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1857  putative metalloprotease  30.44 
 
 
983 aa  439  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.263954  normal  0.471387 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2076  peptidase M16-like  32.42 
 
 
983 aa  431  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0378  Peptidase M16C associated domain protein  30.97 
 
 
1010 aa  430  1e-119  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.858415  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1643  peptidase M16C associated  33.41 
 
 
972 aa  419  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.765117  normal  0.901695 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32286  predicted protein  30.69 
 
 
1034 aa  415  1e-114  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.414837  normal  0.522406 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2936  peptidase M16C associated domain-containing protein  31.41 
 
 
967 aa  408  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0337172  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1885  peptidase M16C associated domain-containing protein  31.39 
 
 
974 aa  404  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03853  Mitochondrial presequence protease Precursor (EC 3.4.24.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B6H7]  30.55 
 
 
1049 aa  401  9.999999999999999e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.901124  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0197  Peptidase M16C associated domain protein  29.21 
 
 
949 aa  398  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0233  peptidase M16 inactive domain protein  27.43 
 
 
971 aa  390  1e-107  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.312549  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0211  insulinase family metalloprotease  30.89 
 
 
975 aa  385  1e-105  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1843  peptidase M16C associated domain-containing protein  30.19 
 
 
1032 aa  363  1e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000453364  unclonable  0.00000000218752 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1842  peptidase M16 familiy  28.36 
 
 
1024 aa  356  1e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.284572  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2129  peptidase M16-like  28.74 
 
 
1025 aa  355  2e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76282  predicted protein  25.97 
 
 
1046 aa  296  1e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.967871  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2447  peptidase M16 domain protein  23.72 
 
 
1137 aa  280  9e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04540  cytoplasm protein, putative  24.76 
 
 
1054 aa  126  3e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0121322  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84931  predicted protein  25.54 
 
 
1049 aa  107  9e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_09434  zinc metalloprotease, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07610)  21.69 
 
 
1057 aa  85.5  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.169282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  24.71 
 
 
896 aa  71.2  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  26.22 
 
 
937 aa  69.7  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  25.15 
 
 
945 aa  68.9  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1653  peptidase M16 domain protein  23.36 
 
 
418 aa  59.7  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1315  peptidase M16 domain protein  24.32 
 
 
418 aa  59.3  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1429  M16 family peptidase  24.31 
 
 
419 aa  58.2  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.400029  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1070  peptidase M16 domain protein  29.38 
 
 
878 aa  57.8  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0190  insulinase family metalloprotease  32.32 
 
 
939 aa  55.5  0.000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.645084  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0775  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  24.62 
 
 
421 aa  55.5  0.000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3613  peptidase M16 domain protein  21.63 
 
 
431 aa  55.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.406758 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4342  peptidase M16-like  25.71 
 
 
431 aa  55.5  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472968  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0921  peptidase M16 domain protein  20.41 
 
 
427 aa  55.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0782213  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0895  peptidase M16 domain protein  20.41 
 
 
427 aa  55.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2248  peptidase M16 domain-containing protein  26.29 
 
 
647 aa  55.1  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.082562  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  26.69 
 
 
443 aa  54.7  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02669  protease III  23.5 
 
 
962 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0870  peptidase M16 domain protein  23.5 
 
 
962 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4086  protease III  23.5 
 
 
962 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.851704  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0171  peptidase M16 domain protein  29.63 
 
 
462 aa  53.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0696206  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3041  protease III  23.5 
 
 
962 aa  53.5  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  24.05 
 
 
461 aa  53.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2967  protease III  23.5 
 
 
962 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3141  protease III  23.5 
 
 
962 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0894  peptidase M16 domain-containing protein  23.5 
 
 
962 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2968  protease III  23.5 
 
 
962 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.436713 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02630  hypothetical protein  23.5 
 
 
962 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0761  peptidase M16 domain protein  25.25 
 
 
924 aa  52.4  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2217  peptidase M16 domain-containing protein  25.67 
 
 
454 aa  51.6  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.800004  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1453  peptidase M16 domain protein  22.29 
 
 
417 aa  51.2  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.093065 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0235  M16 family peptidase  22.96 
 
 
421 aa  50.4  0.0001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  27.04 
 
 
484 aa  50.8  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1947  peptidase M16 domain-containing protein  22.09 
 
 
422 aa  50.8  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141516  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  27.68 
 
 
513 aa  50.8  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1211  peptidase, M16 family  25 
 
 
419 aa  51.2  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.150859  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2620  peptidase M16 domain-containing protein  23.39 
 
 
422 aa  50.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136175  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  23.72 
 
 
919 aa  50.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0892  zinc protease  25.42 
 
 
927 aa  50.1  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283708  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  24.93 
 
 
443 aa  50.1  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0846  M16 family peptidase  22.44 
 
 
429 aa  49.7  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.573539  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1977  peptidase M16-like protein  26.32 
 
 
928 aa  49.7  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.794367  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2253  peptidase M16 domain-containing protein  23.53 
 
 
912 aa  49.7  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.890772  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1237  peptidase M16 domain-containing protein  24.23 
 
 
419 aa  49.3  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  23.34 
 
 
514 aa  49.3  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2215  M16 family peptidase  27.84 
 
 
912 aa  49.3  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0240  peptidase M16 domain protein  24.1 
 
 
948 aa  48.9  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.239759  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  24.8 
 
 
461 aa  49.3  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3177  peptidase M16 domain protein  24.56 
 
 
422 aa  48.9  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.56337  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2761  peptidase M16 domain-containing protein  22.75 
 
 
456 aa  48.9  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0063  M16 family peptidase  25.7 
 
 
459 aa  48.5  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261125  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0394  peptidase M16 domain protein  24.84 
 
 
459 aa  48.9  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0405646  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  24.42 
 
 
499 aa  48.9  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0028  peptidase M16 domain protein  21.59 
 
 
423 aa  48.9  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1312  peptidase M16 domain protein  26.77 
 
 
840 aa  48.5  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  24.93 
 
 
469 aa  48.5  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3321  protease 3  25.48 
 
 
962 aa  48.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.328834 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2328  peptidase M16 domain-containing protein  26.07 
 
 
460 aa  48.1  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.977171  normal  0.638567 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>