65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2248 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2248  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 		 647 aa  1335    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.082562  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0856  M16 family metallopeptidase  30.56 
 
 		 577 aa  121  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04540  cytoplasm protein, putative  30.72 
 
 		 1054 aa  72.4  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0121322  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84931  predicted protein  28.5 
 
 		 1049 aa  70.5  0.00000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_09434  zinc metalloprotease, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07610)  28.31 
 
 		 1057 aa  69.7  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.169282 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1565  Peptidase M16C associated domain protein  29.27 
 
 		 968 aa  61.6  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0498145  normal  0.0547201 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1130  peptidase M16-like  26.37 
 
 		 970 aa  60.8  0.00000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.827511  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0158  peptidase M16C associated domain-containing protein  27.27 
 
 		 968 aa  57.4  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471453 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32286  predicted protein  24.54 
 
 		 1034 aa  57.4  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.414837  normal  0.522406 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1661  peptidase M16C associated domain-containing protein  27.6 
 
 		 976 aa  56.2  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.902377 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0695  peptidase M16C associated domain-containing protein  28.64 
 
 		 968 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00570537  decreased coverage  0.000127809 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0673  metalloprotease  25.41 
 
 		 985 aa  55.5  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223334  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5316  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  23.3 
 
 		 942 aa  55.1  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0197  Peptidase M16C associated domain protein  25.24 
 
 		 949 aa  55.1  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0345  Peptidase M16C associated domain protein  26.29 
 
 		 970 aa  55.1  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0396626  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2677  PreP peptidase  26.87 
 
 		 1046 aa  54.7  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0490  Peptidase M16C associated domain protein  26.42 
 
 		 969 aa  54.3  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76282  predicted protein  23.78 
 
 		 1046 aa  54.3  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.967871  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7875  processing peptidase  30 
 
 		 439 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0597317 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2936  peptidase M16C associated domain-containing protein  26.49 
 
 		 967 aa  52.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0337172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1780  Peptidase M16C associated domain protein  27.62 
 
 		 969 aa  53.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.126781  normal  0.432438 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2480  processing peptidase  28.42 
 
 		 409 aa  52  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.116238  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2447  peptidase M16 domain protein  25.15 
 
 		 1137 aa  51.6  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2732  peptidase M16 domain protein  25.13 
 
 		 408 aa  51.2  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2188  peptidase M16 domain protein  28.21 
 
 		 424 aa  50.8  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.344972  normal  0.666529 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1365  Peptidase M16C associated domain protein  25.95 
 
 		 968 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2044  peptidase M16C associated domain-containing protein  25.6 
 
 		 964 aa  50.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0190  insulinase family metalloprotease  29.86 
 
 		 939 aa  50.1  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.645084  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04570  predicted Zn-dependent peptidase, insulinase  24.4 
 
 		 985 aa  50.4  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1842  peptidase M16 familiy  23.69 
 
 		 1024 aa  50.1  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.284572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5911  peptidase M16-like protein, possible Zn-dependent  23 
 
 		 957 aa  49.3  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2129  peptidase M16-like  23.89 
 
 		 1025 aa  49.3  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0211  insulinase family metalloprotease  27.19 
 
 		 975 aa  49.3  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0645  peptidase M16C associated domain-containing protein  24.86 
 
 		 992 aa  49.3  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141412  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0378  Peptidase M16C associated domain protein  28.24 
 
 		 1010 aa  48.5  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.858415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1656  putative peptidase  25.44 
 
 		 973 aa  48.1  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0884161  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2871  peptidase M16C associated domain-containing protein  23.41 
 
 		 987 aa  48.1  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000230302  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1616  peptidase M16 domain protein  24.21 
 
 		 421 aa  47.8  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03853  Mitochondrial presequence protease Precursor (EC 3.4.24.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B6H7]  23.08 
 
 		 1049 aa  47.8  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.901124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1395  peptidase, putative  25.14 
 
 		 973 aa  48.1  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.131852  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4588  processing peptidase  23.38 
 
 		 417 aa  47.8  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.322038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  26.42 
 
 		 896 aa  47.4  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0233  peptidase M16 inactive domain protein  21.43 
 
 		 971 aa  47.4  0.0009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.312549  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1478  Peptidase M16C associated domain protein  25.24 
 
 		 970 aa  47  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1843  peptidase M16C associated domain-containing protein  25.74 
 
 		 1032 aa  47  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000453364  unclonable  0.00000000218752 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2076  peptidase M16-like  25.27 
 
 		 983 aa  47  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1179  peptidase M16C associated  25 
 
 		 987 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0156529 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1562  Zn-dependent peptidase  28.12 
 
 		 419 aa  45.8  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000390885  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1419  processing peptidase  24 
 
 		 424 aa  45.8  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1237  peptidase M16 domain-containing protein  27.88 
 
 		 419 aa  45.8  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1637  processing peptidase  26.9 
 
 		 418 aa  45.4  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2133  peptidase M16 domain protein  23.56 
 
 		 436 aa  45.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.765752 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1857  putative metalloprotease  26.2 
 
 		 983 aa  45.8  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.263954  normal  0.471387 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1885  peptidase M16C associated domain-containing protein  23.86 
 
 		 974 aa  45.4  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4245  peptidase M16C associated domain-containing protein  24.18 
 
 		 973 aa  45.4  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0157444  hitchhiker  0.0000000002425 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1643  peptidase M16C associated  21.39 
 
 		 972 aa  45.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.765117  normal  0.901695 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0936  peptidase M16 domain-containing protein  22.75 
 
 		 420 aa  45.1  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.891405  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2620  peptidase M16 domain-containing protein  24.5 
 
 		 422 aa  44.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136175  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08071  Zn-dependent peptidase  27.04 
 
 		 416 aa  44.3  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.786648  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1069  peptidase M16 domain-containing protein  28.76 
 
 		 435 aa  44.7  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.421262  hitchhiker  0.00357472 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10390  predicted Zn-dependent peptidase  26.6 
 
 		 446 aa  44.3  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0193865  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2253  peptidase M16 domain-containing protein  23.33 
 
 		 912 aa  44.3  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.890772  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1429  M16 family peptidase  27.88 
 
 		 419 aa  43.9  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.400029  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1462  peptidase M16 domain protein  29.91 
 
 		 413 aa  43.9  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.287908  normal  0.0135177 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1211  peptidase, M16 family  27.88 
 
 		 419 aa  43.9  0.01  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.150859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>