280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0645 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0158  peptidase M16C associated domain-containing protein  35.34 
 
 
968 aa  642    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471453 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0645  peptidase M16C associated domain-containing protein  100 
 
 
992 aa  2056    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141412  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0695  peptidase M16C associated domain-containing protein  35.54 
 
 
968 aa  637    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00570537  decreased coverage  0.000127809 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1656  putative peptidase  44.89 
 
 
973 aa  885    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0884161  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1395  peptidase, putative  45.2 
 
 
973 aa  885    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.131852  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1661  peptidase M16C associated domain-containing protein  36.6 
 
 
976 aa  654    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.902377 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41654  predicted protein  36.08 
 
 
979 aa  641    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00193617  normal  0.306826 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0345  Peptidase M16C associated domain protein  35.88 
 
 
970 aa  627  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0396626  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2677  PreP peptidase  34.38 
 
 
1046 aa  620  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2044  peptidase M16C associated domain-containing protein  34.06 
 
 
964 aa  609  1e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0490  Peptidase M16C associated domain protein  35.28 
 
 
969 aa  600  1e-170  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1365  Peptidase M16C associated domain protein  34.62 
 
 
968 aa  592  1e-167  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1565  Peptidase M16C associated domain protein  35.06 
 
 
968 aa  590  1e-167  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0498145  normal  0.0547201 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1217  Peptidase M16C associated domain protein  34.26 
 
 
999 aa  580  1e-164  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00171078  normal  0.0476077 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_232  predicted protein  36.12 
 
 
986 aa  575  1.0000000000000001e-162  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1780  Peptidase M16C associated domain protein  34.61 
 
 
969 aa  560  1e-158  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.126781  normal  0.432438 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20700  predicted Zn-dependent peptidase, insulinase  33.64 
 
 
972 aa  539  1e-151  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04570  predicted Zn-dependent peptidase, insulinase  32.35 
 
 
985 aa  534  1e-150  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0673  metalloprotease  32.44 
 
 
985 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223334  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0378  Peptidase M16C associated domain protein  32.27 
 
 
1010 aa  514  1e-144  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.858415  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2871  peptidase M16C associated domain-containing protein  29.02 
 
 
987 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000230302  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0197  Peptidase M16C associated domain protein  31.69 
 
 
949 aa  452  1e-125  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1130  peptidase M16-like  29.22 
 
 
970 aa  420  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.827511  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1179  peptidase M16C associated  28.83 
 
 
987 aa  421  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0156529 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32286  predicted protein  30.03 
 
 
1034 aa  417  9.999999999999999e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.414837  normal  0.522406 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1865  M16 family peptidase  30.32 
 
 
1017 aa  396  1e-108  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000469623  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1478  Peptidase M16C associated domain protein  28.67 
 
 
970 aa  394  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0211  insulinase family metalloprotease  29.22 
 
 
975 aa  391  1e-107  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4245  peptidase M16C associated domain-containing protein  28.4 
 
 
973 aa  392  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0157444  hitchhiker  0.0000000002425 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1885  peptidase M16C associated domain-containing protein  29.09 
 
 
974 aa  392  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1643  peptidase M16C associated  29.34 
 
 
972 aa  388  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.765117  normal  0.901695 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1857  putative metalloprotease  29.07 
 
 
983 aa  383  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.263954  normal  0.471387 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2447  peptidase M16 domain protein  26.61 
 
 
1137 aa  385  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2076  peptidase M16-like  27.74 
 
 
983 aa  358  3.9999999999999996e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03853  Mitochondrial presequence protease Precursor (EC 3.4.24.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B6H7]  26.28 
 
 
1049 aa  349  1e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.901124  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2936  peptidase M16C associated domain-containing protein  28.05 
 
 
967 aa  342  2e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0337172  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0233  peptidase M16 inactive domain protein  28.99 
 
 
971 aa  340  9.999999999999999e-92  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.312549  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1843  peptidase M16C associated domain-containing protein  25.36 
 
 
1032 aa  320  1e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000453364  unclonable  0.00000000218752 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2129  peptidase M16-like  26.27 
 
 
1025 aa  318  2e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1842  peptidase M16 familiy  25.82 
 
 
1024 aa  317  7e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.284572  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76282  predicted protein  27.57 
 
 
1046 aa  268  2.9999999999999995e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.967871  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_006686  CND04540  cytoplasm protein, putative  21.54 
 
 
1054 aa  117  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0121322  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84931  predicted protein  23.87 
 
 
1049 aa  86.3  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  21.78 
 
 
896 aa  79.7  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  21.53 
 
 
937 aa  74.3  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  21.1 
 
 
945 aa  72.8  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_09434  zinc metalloprotease, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07610)  20.52 
 
 
1057 aa  70.9  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.169282 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0028  peptidase M16 domain protein  22.55 
 
 
423 aa  68.9  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1147  peptidase M16 domain-containing protein  22.19 
 
 
431 aa  68.6  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1429  M16 family peptidase  24.74 
 
 
419 aa  66.6  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.400029  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3177  peptidase M16 domain protein  23.42 
 
 
422 aa  65.9  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.56337  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4342  peptidase M16-like  26.49 
 
 
431 aa  65.9  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472968  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2119  putative zinc protease  20.74 
 
 
921 aa  65.5  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4630  peptidase M16 domain-containing protein  22.9 
 
 
464 aa  64.7  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1348  peptidase M16 domain protein  20.23 
 
 
439 aa  63.9  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.387051  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5316  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  21.41 
 
 
942 aa  63.5  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1977  peptidase M16-like protein  21.21 
 
 
928 aa  63.5  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.794367  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  24.34 
 
 
461 aa  63.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1237  peptidase M16 domain-containing protein  25.26 
 
 
419 aa  62.8  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1070  peptidase M16 domain protein  24.55 
 
 
878 aa  61.6  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1211  peptidase, M16 family  24.23 
 
 
419 aa  61.2  0.00000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.150859  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  21.84 
 
 
443 aa  61.2  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  21.55 
 
 
443 aa  61.2  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5911  peptidase M16-like protein, possible Zn-dependent  21.22 
 
 
957 aa  60.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0863  peptidase M16 domain protein  22.7 
 
 
428 aa  60.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.282828  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  21.91 
 
 
443 aa  60.1  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1986  processing protease  25.34 
 
 
440 aa  60.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.500047 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0895  peptidase M16 domain protein  25.41 
 
 
427 aa  59.3  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  22.16 
 
 
461 aa  58.9  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0921  peptidase M16 domain protein  25.41 
 
 
427 aa  59.3  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0782213  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0240  peptidase M16 domain protein  21.45 
 
 
948 aa  58.9  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.239759  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0276  hypothetical protein  23.47 
 
 
411 aa  58.9  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.166911 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2620  peptidase M16 domain-containing protein  24.37 
 
 
422 aa  58.5  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136175  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0397  peptidase M16 domain-containing protein  22.01 
 
 
431 aa  58.5  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3809  peptidase M16 domain-containing protein  25.64 
 
 
940 aa  58.2  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  21.77 
 
 
504 aa  57.4  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0775  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  24.12 
 
 
421 aa  57  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0519  peptidase M16 domain-containing protein  24.86 
 
 
432 aa  56.6  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2217  peptidase M16 domain-containing protein  23.72 
 
 
454 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.800004  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2215  M16 family peptidase  27.62 
 
 
912 aa  56.6  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3613  peptidase M16 domain protein  25.41 
 
 
431 aa  56.2  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.406758 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08201  peptidase, M16 family protein  25 
 
 
990 aa  56.6  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.287012  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  24.92 
 
 
461 aa  56.2  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1896  peptidase M16 domain protein  24.31 
 
 
434 aa  56.2  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  23.6 
 
 
463 aa  55.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4238  peptidase M16 domain protein  28.05 
 
 
436 aa  55.8  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.259515  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3596  pseudouridine synthase, Rsu  21.81 
 
 
912 aa  55.8  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1582  peptidase M16 domain protein  26.79 
 
 
434 aa  55.5  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.157753  normal  0.0912908 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0108  peptidase M16 domain protein  24.6 
 
 
422 aa  55.5  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3079  Pitrilysin  21.35 
 
 
946 aa  55.5  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2235  Zn-dependent peptidase  24.73 
 
 
427 aa  55.1  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0931  peptidase M16 domain-containing protein  22.32 
 
 
428 aa  55.1  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.557944  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1069  peptidase M16 domain-containing protein  22.31 
 
 
435 aa  54.7  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.421262  hitchhiker  0.00357472 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1020  peptidase M16 domain protein  21.22 
 
 
429 aa  53.9  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  23.87 
 
 
476 aa  53.9  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  24.87 
 
 
919 aa  54.3  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  21.08 
 
 
514 aa  54.3  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0236  peptidase M16 domain protein  24.34 
 
 
937 aa  54.3  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0946575 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0304  peptidase M16 domain-containing protein  38.36 
 
 
483 aa  54.3  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  21.55 
 
 
443 aa  54.3  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>