More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2829 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2829  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 392 aa  787    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.560566 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2318  Extracellular ligand-binding receptor  99.22 
 
 		 386 aa  769    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.522899  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3145  Extracellular ligand-binding receptor  38.08 
 
 		 399 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00633656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  38.12 
 
 		 401 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  37.54 
 
 		 400 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0821  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  37.5 
 
 		 399 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  37.5 
 
 		 399 aa  210  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  37.83 
 
 		 401 aa  209  6e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  36.36 
 
 		 401 aa  206  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2441  putative amino acid-binding periplasmic ABC transporter protein  36.81 
 
 		 336 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0270  extracellular ligand-binding receptor  34.39 
 
 		 460 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186259  normal  0.56965 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  33.24 
 
 		 371 aa  194  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  35.16 
 
 		 381 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  35.45 
 
 		 381 aa  194  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  35.16 
 
 		 402 aa  192  9e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3300  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  34.2 
 
 		 379 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0104  extracellular ligand-binding receptor  33.62 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  35.73 
 
 		 380 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3957  putative periplasmic substrate-binding protein  33.91 
 
 		 379 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877185  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0165  outative extracellular ligand binding protein  33.91 
 
 		 379 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2389  outative extracellular ligand binding protein  35.47 
 
 		 372 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3295  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.33 
 
 		 379 aa  190  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0114756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3886  Extracellular ligand-binding receptor  31.4 
 
 		 382 aa  190  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4031  putative periplasmic substrate-binding protein  33.91 
 
 		 379 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0660  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.47 
 
 		 380 aa  190  5e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.792803  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0805  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.47 
 
 		 380 aa  190  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.351699  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1102  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.47 
 
 		 380 aa  190  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391264  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2592  extracellular ligand-binding receptor  35.98 
 
 		 398 aa  189  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0214076 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0113  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 		 379 aa  190  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1178  outative extracellular ligand binding protein  35.47 
 
 		 380 aa  190  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1769  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.47 
 
 		 380 aa  190  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  33.53 
 
 		 393 aa  189  7e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4758  extracellular ligand-binding receptor  35.82 
 
 		 382 aa  189  8e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467075  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  34.84 
 
 		 376 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2966  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  33.62 
 
 		 375 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.17 
 
 		 380 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.17 
 
 		 380 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  34.88 
 
 		 380 aa  188  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  35.16 
 
 		 380 aa  189  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.17 
 
 		 380 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  35.73 
 
 		 380 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.17 
 
 		 380 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4492  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 		 388 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.531817 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  35.17 
 
 		 380 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3381  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.87 
 
 		 380 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.17 
 
 		 380 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  35.76 
 
 		 378 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3027  putative periplasmic substrate-binding protein  33.62 
 
 		 379 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1575  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.62 
 
 		 379 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0050  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.4 
 
 		 382 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.143388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3344  putative periplasmic substrate-binding protein  33.62 
 
 		 379 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3495  Extracellular ligand-binding receptor  32.12 
 
 		 381 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0115  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 		 379 aa  187  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3654  extracellular ligand-binding receptor  34.57 
 
 		 399 aa  187  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3488  extracellular ligand-binding receptor  32.37 
 
 		 383 aa  186  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3017  extracellular ligand-binding receptor  31.96 
 
 		 382 aa  186  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2941  extracellular ligand-binding receptor  33.05 
 
 		 379 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.70065  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0129  extracellular ligand-binding receptor  33.05 
 
 		 379 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0114  extracellular ligand-binding receptor  33.05 
 
 		 379 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3170  Extracellular ligand-binding receptor  31.7 
 
 		 381 aa  185  9e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2166  extracellular ligand-binding receptor  32.95 
 
 		 376 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.0643115 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6628  extracellular ligand-binding receptor  35.47 
 
 		 384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733405 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1950  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.1 
 
 		 388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.446451  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  34.58 
 
 		 391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  34.58 
 
 		 391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  34.58 
 
 		 380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7692  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.88 
 
 		 384 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  34.59 
 
 		 384 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  34.59 
 
 		 384 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2411  extracellular ligand-binding receptor  32.37 
 
 		 376 aa  182  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.32979  normal  0.572085 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6079  extracellular ligand-binding receptor  34.88 
 
 		 384 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.829496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3428  extracellular ligand-binding receptor  32.8 
 
 		 388 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2945  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.38 
 
 		 377 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3989  extracellular ligand-binding receptor  33.81 
 
 		 388 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.143637 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2553  extracellular ligand-binding receptor  32.77 
 
 		 386 aa  181  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3506  extracellular ligand-binding receptor  33.81 
 
 		 388 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3860  extracellular ligand-binding receptor  34.68 
 
 		 381 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3346  extracellular ligand-binding receptor  37.5 
 
 		 380 aa  181  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1925  extracellular ligand-binding receptor  33.62 
 
 		 377 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0315464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5995  extracellular ligand-binding receptor  34.38 
 
 		 373 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.814001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1661  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.38 
 
 		 373 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00010868  normal  0.0729717 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3339  extracellular ligand-binding receptor  31.21 
 
 		 383 aa  180  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0137407  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4271  extracellular ligand-binding receptor  32.98 
 
 		 388 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4095  extracellular ligand-binding receptor  32.98 
 
 		 388 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4242  extracellular ligand-binding receptor  34.77 
 
 		 373 aa  179  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000000756343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4261  extracellular ligand-binding receptor  34.94 
 
 		 373 aa  179  9e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5783  extracellular ligand-binding receptor  34.3 
 
 		 384 aa  179  9e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3768  extracellular ligand-binding receptor  34.77 
 
 		 373 aa  179  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000000114958  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6148  extracellular ligand-binding receptor  34.3 
 
 		 384 aa  179  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.392362 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1940  putative secreted substrate binding protein  33.91 
 
 		 375 aa  178  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15659  normal  0.0532415 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4008  extracellular ligand-binding receptor  34.09 
 
 		 373 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.746913  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4359  extracellular ligand-binding receptor  34.09 
 
 		 373 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4469  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  35.36 
 
 		 404 aa  178  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4919  extracellular ligand-binding receptor  32.37 
 
 		 376 aa  176  6e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5695  Extracellular ligand-binding receptor  35.65 
 
 		 373 aa  176  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.348726 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3300  putative amino-acid transport signal peptide protein  29.68 
 
 		 377 aa  176  7e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.69 
 
 		 373 aa  176  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.116287 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4030  extracellular ligand-binding receptor  33.72 
 
 		 386 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  33.72 
 
 		 386 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.839805 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4914  extracellular ligand-binding receptor  31.5 
 
 		 375 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.113346  normal  0.710388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>