283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0602 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0602  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 256 aa  489  1e-137  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2861  hypothetical protein  29.33 
 
 		 306 aa  97.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.759766  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3532  alpha/beta hydrolase fold  32.6 
 
 		 298 aa  95.1  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.961307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1674  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 		 302 aa  94.7  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0685799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1656  alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 		 304 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1677  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 356 aa  91.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2178 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3910  alpha/beta hydrolase fold  34.87 
 
 		 300 aa  90.1  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.838844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0819  alpha/beta hydrolase fold  31.95 
 
 		 312 aa  89  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3711  alpha/beta hydrolase fold  31.49 
 
 		 297 aa  87.8  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0466568  normal  0.241762 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13990  Alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 		 319 aa  87.4  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1534  alpha/beta hydrolase  29.21 
 
 		 294 aa  87  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2222  alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 		 301 aa  85.1  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1064  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0317  carboxylesterase  31.37 
 
 		 292 aa  82  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4348  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 331 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1684  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1675  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0263497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3587  alpha/beta hydrolase fold protein  29.3 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  28.84 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.532072 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3355  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 		 313 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4543  Alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 		 343 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1064  alpha/beta fold family hydrolase  29.89 
 
 		 378 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0748  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.725868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1105  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272273  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3165  alpha/beta hydrolase fold  31.84 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.358272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2007  alpha/beta hydrolase fold protein  29.15 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1303  alpha/beta hydrolase fold protein  28.72 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2821  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2371  alpha/beta hydrolase  30.37 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1094  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.817765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1254  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000251211  normal  0.0110016 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0113  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17910  alpha/beta family hydrolase  27.92 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4178  hydrolase, alpha/beta fold family  26.04 
 
 		 330 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1674  alpha/beta hydrolase fold protein  29.45 
 
 		 300 aa  72  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0555007  normal  0.342209 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2357  alpha/beta hydrolase fold protein  30.2 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0142155  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1557  putative hydrolase  27.61 
 
 		 328 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2804  alpha/beta fold family hydrolase  27.72 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3915  Alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.226333 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1191  alpha/beta fold family hydrolase  23.34 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.556136 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3170  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1199  alpha/beta hydrolase fold  23.34 
 
 		 345 aa  69.3  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.43894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0034  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0686733  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3444  alpha/beta hydrolase fold protein  31.8 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0648786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2896  Alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 		 304 aa  67  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.144018 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  27.76 
 
 		 318 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598088  hitchhiker  0.00401352 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0068  streptothricin acetyltransferase Sat-1  23.64 
 
 		 336 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.470432  normal  0.337184 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0133  streptothricin acetyltransferase Sat-1  23.64 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5112  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4056  alpha/beta hydrolase fold  32.54 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  32.85 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1240  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.17737 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6846  Alpha/beta hydrolase  26.95 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.525505 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1255  alpha/beta hydrolase fold  25.76 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000653812  decreased coverage  0.00236014 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2370  alpha/beta hydrolase fold protein  25.62 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2714  alpha/beta hydrolase fold protein  27.9 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216364  normal  0.0171077 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2195  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  37.37 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  36.88 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  26.32 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2514  alpha/beta hydrolase fold protein  26.16 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0953  alpha/beta hydrolase fold  24.36 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147862  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0971  alpha/beta hydrolase fold  24.36 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5168  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 		 281 aa  58.5  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.464131 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2551  alpha/beta fold family hydrolase  30.3 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.27575  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2507  carboxylesterase  30.3 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322402  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2738  alpha/beta fold family hydrolase  30.3 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.754882  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5437  alpha/beta hydrolase fold  24.7 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204018  hitchhiker  0.00818802 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0974  alpha/beta hydrolase fold  23.64 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0413085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2746  hydrolase, alpha/beta fold family  29.55 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000102872 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5059  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2792  hydrolase, alpha/beta fold family  29.55 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00232409  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2473  carboxylesterase  30.3 
 
 		 287 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.283047  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20960  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.87 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  35.66 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  35.66 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  36.43 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0203  alpha/beta hydrolase fold protein  36.29 
 
 		 304 aa  55.5  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.281288 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0354  alpha/beta hydrolase fold protein  26.95 
 
 		 355 aa  55.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0338222  normal  0.0930183 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  31.06 
 
 		 270 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2771  alpha/beta fold family hydrolase  29.55 
 
 		 356 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000257271  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 		 270 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0429  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 		 282 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1098  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.625731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2542  hydrolase, alpha/beta fold family  29.55 
 
 		 284 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  28.47 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  34.13 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1683  hydrolase  28.14 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000746451  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1204  alpha/beta fold family hydrolase  26.55 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.106082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  33.8 
 
 		 281 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  30.08 
 
 		 265 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  35.11 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2544  alpha/beta hydrolase fold  22.15 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0251  alpha/beta hydrolase fold protein  30.18 
 
 		 307 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  33.78 
 
 		 270 aa  53.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  33.07 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 		 270 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1171  alpha/beta hydrolase fold  25.66 
 
 		 278 aa  53.1  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000278776  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1315  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 		 290 aa  52.4  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>