45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0403 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_0403  methyltransferase type 12  100 
 
 		 396 aa  755    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0431  Methyltransferase type 12  97.7 
 
 		 430 aa  631  1e-180  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0432  Methyltransferase type 12  97.45 
 
 		 418 aa  628  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4168  ribosomal small subunit Rsm22  75.06 
 
 		 417 aa  521  1e-147  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.202008  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5894  Ribosomal small subunit Rsm22  35.67 
 
 		 394 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2077  hypothetical protein  31.4 
 
 		 982 aa  90.1  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.183603 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2712  hypothetical protein  31.23 
 
 		 576 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.837106  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2131  hypothetical protein  34.2 
 
 		 509 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0805  hypothetical protein  36.73 
 
 		 446 aa  79.7  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.372154  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1138  ribosomal small subunit Rsm22  32 
 
 		 354 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.169783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2609  hypothetical protein  29.62 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782998  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4032  methyltransferase type 11  29.14 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.541283  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1399  Ribosomal small subunit Rsm22  29.5 
 
 		 973 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4984  Ribosomal small subunit Rsm22  30.5 
 
 		 322 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.839069  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0618  Ribosomal small subunit Rsm22  30.05 
 
 		 459 aa  73.2  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2411  methyltransferase type 12  31.52 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.321714  normal  0.120209 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1065  hypothetical protein  28.74 
 
 		 327 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3744  rRNA methylase-like protein  30.98 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000177024 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3030  hypothetical protein  28.12 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93082 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2135  Ribosomal small subunit Rsm22  30.23 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1532  Ribosomal small subunit Rsm22  27.41 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1520  hypothetical protein  29.45 
 
 		 321 aa  67  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1574  hypothetical protein  29.45 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2693  ribosomal small subunit Rsm22  29.17 
 
 		 326 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000108375  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4375  hypothetical protein  28.82 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.623348  normal  0.0519493 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1193  hypothetical protein  29.62 
 
 		 327 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.867096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0767  hypothetical protein  22.69 
 
 		 496 aa  62  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3231  methyltransferase type 12  28.84 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.822547  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0954  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  26.64 
 
 		 447 aa  54.7  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.539075  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1591  ribosomal small subunit Rsm22  26.42 
 
 		 323 aa  53.9  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0197095  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2356  Methyltransferase type 12  28.97 
 
 		 470 aa  52.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.129539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0145  hypothetical protein  28.22 
 
 		 467 aa  52.4  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.459193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43745  predicted protein  27.1 
 
 		 585 aa  47.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0989203  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1586  hypothetical protein  28.74 
 
 		 325 aa  47  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3860  Ribosomal small subunit Rsm22  31.8 
 
 		 327 aa  46.6  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.713494  normal  0.163136 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2226  dimethyladenosine transferase  34.55 
 
 		 288 aa  46.2  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.587183 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3565  ribosomal small subunit Rsm22  36.79 
 
 		 346 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0396648  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0081  hypothetical protein  22.02 
 
 		 462 aa  44.3  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  31.65 
 
 		 218 aa  44.3  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.12 
 
 		 230 aa  43.9  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0515  Methyltransferase type 12  29.45 
 
 		 235 aa  43.5  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0774  HemK family modification methylase  33.92 
 
 		 283 aa  43.5  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0850729 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.79 
 
 		 209 aa  43.5  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23730  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 306 aa  43.5  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1546  NodS  32.74 
 
 		 283 aa  42.7  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377082  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>