19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0618 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0618  Ribosomal small subunit Rsm22  100 
 
 		 459 aa  957    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2131  hypothetical protein  43.49 
 
 		 509 aa  381  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0767  hypothetical protein  42.12 
 
 		 496 aa  365  1e-99  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0805  hypothetical protein  44.37 
 
 		 446 aa  361  2e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.372154  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0145  hypothetical protein  38.81 
 
 		 467 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.459193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0954  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  36.03 
 
 		 447 aa  261  1e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.539075  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2356  Methyltransferase type 12  27.05 
 
 		 470 aa  141  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.129539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1780  Methyltransferase type 12  27.14 
 
 		 481 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0574181 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0272  Methyltransferase type 12  26.55 
 
 		 472 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1423  Methyltransferase type 12  25.81 
 
 		 528 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2393  Methyltransferase type 12  24.05 
 
 		 537 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5894  Ribosomal small subunit Rsm22  25.27 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0432  Methyltransferase type 12  30.54 
 
 		 418 aa  57  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0431  Methyltransferase type 12  31.03 
 
 		 430 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4168  ribosomal small subunit Rsm22  28.57 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.202008  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0403  methyltransferase type 12  29.06 
 
 		 396 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3744  rRNA methylase-like protein  23.95 
 
 		 338 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000177024 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1532  Ribosomal small subunit Rsm22  26.34 
 
 		 336 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1399  Ribosomal small subunit Rsm22  27.23 
 
 		 973 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>