16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0954 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0954  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  100 
 
 		 447 aa  925    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.539075  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0767  hypothetical protein  35.06 
 
 		 496 aa  282  1e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0805  hypothetical protein  34.87 
 
 		 446 aa  273  3e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.372154  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2131  hypothetical protein  37.56 
 
 		 509 aa  268  2e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0618  Ribosomal small subunit Rsm22  36.03 
 
 		 459 aa  261  1e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0145  hypothetical protein  34.22 
 
 		 467 aa  247  3e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.459193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0272  Methyltransferase type 12  26.09 
 
 		 472 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2356  Methyltransferase type 12  25 
 
 		 470 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.129539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1780  Methyltransferase type 12  23.23 
 
 		 481 aa  96.7  8e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0574181 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5894  Ribosomal small subunit Rsm22  25.93 
 
 		 394 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2393  Methyltransferase type 12  20 
 
 		 537 aa  72  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1423  Methyltransferase type 12  21.41 
 
 		 528 aa  69.7  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2712  hypothetical protein  25.18 
 
 		 576 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.837106  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3030  hypothetical protein  24.69 
 
 		 318 aa  47.4  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93082 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3678  methyltransferase small  29.41 
 
 		 260 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121234  normal  0.182138 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2077  hypothetical protein  22 
 
 		 982 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.183603 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>