17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0145 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0145  hypothetical protein  100 
 
 		 467 aa  966    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.459193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2131  hypothetical protein  41.78 
 
 		 509 aa  359  5e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0805  hypothetical protein  39.34 
 
 		 446 aa  348  1e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.372154  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0767  hypothetical protein  41.29 
 
 		 496 aa  340  2e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0618  Ribosomal small subunit Rsm22  38.81 
 
 		 459 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0954  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  34.22 
 
 		 447 aa  247  4e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.539075  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2356  Methyltransferase type 12  28.84 
 
 		 470 aa  142  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.129539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1780  Methyltransferase type 12  28.78 
 
 		 481 aa  137  5e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0574181 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0272  Methyltransferase type 12  28.17 
 
 		 472 aa  126  6e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2393  Methyltransferase type 12  25.16 
 
 		 537 aa  120  3.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1423  Methyltransferase type 12  25.38 
 
 		 528 aa  103  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5894  Ribosomal small subunit Rsm22  25.98 
 
 		 394 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3231  methyltransferase type 12  25 
 
 		 356 aa  50.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.822547  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3030  hypothetical protein  24.2 
 
 		 318 aa  47.4  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93082 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4984  Ribosomal small subunit Rsm22  25.52 
 
 		 322 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.839069  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1532  Ribosomal small subunit Rsm22  25.88 
 
 		 336 aa  43.9  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2609  hypothetical protein  25.17 
 
 		 348 aa  43.1  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782998  normal  0.345897 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>