22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0805 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0805  hypothetical protein  100 
 
 		 446 aa  909    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.372154  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0767  hypothetical protein  45.54 
 
 		 496 aa  409  1e-113  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2131  hypothetical protein  45.24 
 
 		 509 aa  380  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0618  Ribosomal small subunit Rsm22  44.37 
 
 		 459 aa  361  1e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0145  hypothetical protein  39.34 
 
 		 467 aa  348  1e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.459193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0954  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  34.87 
 
 		 447 aa  272  7e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.539075  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2356  Methyltransferase type 12  29.14 
 
 		 470 aa  141  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.129539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0272  Methyltransferase type 12  29.43 
 
 		 472 aa  138  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1780  Methyltransferase type 12  27.4 
 
 		 481 aa  127  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0574181 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2393  Methyltransferase type 12  26.23 
 
 		 537 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1423  Methyltransferase type 12  26.9 
 
 		 528 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5894  Ribosomal small subunit Rsm22  30.43 
 
 		 394 aa  74.3  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0403  methyltransferase type 12  41.03 
 
 		 396 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4168  ribosomal small subunit Rsm22  38.67 
 
 		 417 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.202008  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2712  hypothetical protein  24.39 
 
 		 576 aa  46.6  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.837106  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0431  Methyltransferase type 12  40.26 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0432  Methyltransferase type 12  32.19 
 
 		 418 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2339  methyltransferase type 11  30.39 
 
 		 191 aa  45.8  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.755854  normal  0.422901 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1546  NodS  29.23 
 
 		 283 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1509  Methyltransferase type 11  22.52 
 
 		 186 aa  43.9  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3030  hypothetical protein  24.14 
 
 		 318 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93082 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7789  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 276 aa  43.5  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.527057 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>