22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2393 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2393  Methyltransferase type 12  100 
 
 
537 aa  1073    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1423  Methyltransferase type 12  71.93 
 
 
528 aa  733    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1780  Methyltransferase type 12  52.39 
 
 
481 aa  497  1e-139  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0574181 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2356  Methyltransferase type 12  51.58 
 
 
470 aa  478  1e-133  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.129539  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0272  Methyltransferase type 12  48.79 
 
 
472 aa  443  1e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2131  hypothetical protein  28.05 
 
 
509 aa  139  8.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0618  Ribosomal small subunit Rsm22  24.47 
 
 
459 aa  120  7.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0145  hypothetical protein  24.73 
 
 
467 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.459193  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0767  hypothetical protein  22.06 
 
 
496 aa  118  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0805  hypothetical protein  26.36 
 
 
446 aa  117  5e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.372154  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0954  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  19.79 
 
 
447 aa  68.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.539075  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5894  Ribosomal small subunit Rsm22  33.94 
 
 
394 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4032  methyltransferase type 11  31.69 
 
 
321 aa  51.2  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.541283  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0623  methyltransferase type 12  36.29 
 
 
249 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766953 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5022  methyltransferase type 11  25.77 
 
 
353 aa  45.8  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.371366  normal  0.128681 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  29.29 
 
 
274 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  27.34 
 
 
348 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0740  methyltransferase type 11  34.21 
 
 
249 aa  44.3  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2696  Methyltransferase type 12  26.95 
 
 
358 aa  44.3  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.362393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3870  methyltransferase type 12  26.95 
 
 
357 aa  43.9  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0596  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 
357 aa  43.9  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.579149 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3965  amino acid adenylation domain protein  29.87 
 
 
1889 aa  43.5  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>