18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0272 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0272  Methyltransferase type 12  100 
 
 
472 aa  940    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2356  Methyltransferase type 12  58.9 
 
 
470 aa  505  9.999999999999999e-143  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.129539  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2393  Methyltransferase type 12  48.79 
 
 
537 aa  456  1e-127  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1780  Methyltransferase type 12  51.28 
 
 
481 aa  431  1e-119  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0574181 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1423  Methyltransferase type 12  47.34 
 
 
528 aa  423  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0767  hypothetical protein  25.94 
 
 
496 aa  158  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2131  hypothetical protein  27.71 
 
 
509 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0805  hypothetical protein  29.43 
 
 
446 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.372154  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0145  hypothetical protein  28.17 
 
 
467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.459193  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0618  Ribosomal small subunit Rsm22  26.84 
 
 
459 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0954  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  26.51 
 
 
447 aa  123  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.539075  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5894  Ribosomal small subunit Rsm22  27.34 
 
 
394 aa  61.6  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5022  methyltransferase type 11  29.77 
 
 
353 aa  47  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.371366  normal  0.128681 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1672  Methyltransferase type 12  25.47 
 
 
265 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2762  putative methyltransferase  37.39 
 
 
288 aa  43.9  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.778358 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1301  Generic methyltransferase  34.38 
 
 
248 aa  43.5  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2948  hypothetical protein  34.38 
 
 
248 aa  43.5  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3074  hypothetical protein  34.38 
 
 
248 aa  43.5  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>