17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0767 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0767  hypothetical protein  100 
 
 
496 aa  1015    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2131  hypothetical protein  41.87 
 
 
509 aa  436  1e-121  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0805  hypothetical protein  45.54 
 
 
446 aa  409  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.372154  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0618  Ribosomal small subunit Rsm22  42.12 
 
 
459 aa  365  1e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0145  hypothetical protein  41.29 
 
 
467 aa  340  2e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.459193  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0954  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  35.06 
 
 
447 aa  282  1e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.539075  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1780  Methyltransferase type 12  25.71 
 
 
481 aa  160  3e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0574181 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2356  Methyltransferase type 12  25.81 
 
 
470 aa  157  4e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.129539  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0272  Methyltransferase type 12  25.54 
 
 
472 aa  152  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1423  Methyltransferase type 12  23.96 
 
 
528 aa  121  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2393  Methyltransferase type 12  21.64 
 
 
537 aa  117  6e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5894  Ribosomal small subunit Rsm22  23.43 
 
 
394 aa  55.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2609  hypothetical protein  25.81 
 
 
348 aa  46.2  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782998  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1586  hypothetical protein  26.54 
 
 
325 aa  45.4  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4375  hypothetical protein  23.81 
 
 
321 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.623348  normal  0.0519493 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4032  methyltransferase type 11  24.12 
 
 
321 aa  43.9  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.541283  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0431  Methyltransferase type 12  23.95 
 
 
430 aa  43.5  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>