30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2077 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2077  hypothetical protein  100 
 
 		 982 aa  1852    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.183603 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1399  Ribosomal small subunit Rsm22  55.44 
 
 		 973 aa  446  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2712  hypothetical protein  37.59 
 
 		 576 aa  271  5e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.837106  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1834  hypothetical protein  45.45 
 
 		 659 aa  170  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0081  hypothetical protein  29.64 
 
 		 462 aa  169  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0432  Methyltransferase type 12  36.31 
 
 		 418 aa  78.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0431  Methyltransferase type 12  36.31 
 
 		 430 aa  78.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0403  methyltransferase type 12  36.31 
 
 		 396 aa  77  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4168  ribosomal small subunit Rsm22  29.88 
 
 		 417 aa  67.8  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.202008  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1520  hypothetical protein  31.09 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1574  hypothetical protein  31.51 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1138  ribosomal small subunit Rsm22  33.33 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.169783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1591  ribosomal small subunit Rsm22  30.46 
 
 		 323 aa  62  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0197095  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2135  Ribosomal small subunit Rsm22  36.36 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1532  Ribosomal small subunit Rsm22  31.87 
 
 		 336 aa  57  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1586  hypothetical protein  29.48 
 
 		 325 aa  55.8  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4032  methyltransferase type 11  32.95 
 
 		 321 aa  55.5  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.541283  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3231  methyltransferase type 12  28.86 
 
 		 356 aa  54.7  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.822547  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3744  rRNA methylase-like protein  31.58 
 
 		 338 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000177024 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3030  hypothetical protein  28.9 
 
 		 318 aa  52.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93082 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4984  Ribosomal small subunit Rsm22  28.32 
 
 		 322 aa  52.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.839069  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2693  ribosomal small subunit Rsm22  31.21 
 
 		 326 aa  50.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000108375  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22180  hypothetical protein  34.75 
 
 		 750 aa  49.3  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.314625  normal  0.946769 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1337  hypothetical protein  40.06 
 
 		 788 aa  48.9  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1193  hypothetical protein  31.79 
 
 		 327 aa  48.9  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.867096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  34.56 
 
 		 1131 aa  48.1  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1065  hypothetical protein  33.7 
 
 		 327 aa  47.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2609  hypothetical protein  31.19 
 
 		 348 aa  46.6  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782998  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4375  hypothetical protein  42.31 
 
 		 321 aa  46.6  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.623348  normal  0.0519493 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1513  hypothetical protein  41.6 
 
 		 680 aa  45.8  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>