45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0432 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0432  Methyltransferase type 12  100 
 
 
418 aa  798    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0431  Methyltransferase type 12  98.77 
 
 
430 aa  768    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0403  methyltransferase type 12  97.45 
 
 
396 aa  632  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4168  ribosomal small subunit Rsm22  75.18 
 
 
417 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.202008  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5894  Ribosomal small subunit Rsm22  36.52 
 
 
394 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2077  hypothetical protein  31.58 
 
 
982 aa  91.3  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.183603 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1138  ribosomal small subunit Rsm22  32 
 
 
354 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.169783  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2712  hypothetical protein  31.58 
 
 
576 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.837106  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0805  hypothetical protein  35.2 
 
 
446 aa  79.3  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.372154  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2609  hypothetical protein  30.19 
 
 
348 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782998  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2131  hypothetical protein  34.07 
 
 
509 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4032  methyltransferase type 11  28.83 
 
 
321 aa  76.6  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.541283  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2411  methyltransferase type 12  32.82 
 
 
340 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.321714  normal  0.120209 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4984  Ribosomal small subunit Rsm22  30.12 
 
 
322 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.839069  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3744  rRNA methylase-like protein  30.98 
 
 
338 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000177024 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0618  Ribosomal small subunit Rsm22  30.54 
 
 
459 aa  72.8  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2135  Ribosomal small subunit Rsm22  31.34 
 
 
332 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3641  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1065  hypothetical protein  28.35 
 
 
327 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350622  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1399  Ribosomal small subunit Rsm22  29.09 
 
 
973 aa  69.7  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1574  hypothetical protein  28.62 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1520  hypothetical protein  28.62 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3030  hypothetical protein  28.41 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.93082 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4375  hypothetical protein  28.22 
 
 
321 aa  67  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.623348  normal  0.0519493 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1532  Ribosomal small subunit Rsm22  27.41 
 
 
336 aa  66.6  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2693  ribosomal small subunit Rsm22  28.82 
 
 
326 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000108375  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0767  hypothetical protein  22.69 
 
 
496 aa  61.2  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1193  hypothetical protein  29.23 
 
 
327 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.867096  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3231  methyltransferase type 12  28.84 
 
 
356 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.822547  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0954  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  25.94 
 
 
447 aa  55.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.539075  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1591  ribosomal small subunit Rsm22  26.07 
 
 
323 aa  54.3  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0197095  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0145  hypothetical protein  28.22 
 
 
467 aa  52  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.459193  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2356  Methyltransferase type 12  29.44 
 
 
470 aa  50.4  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.129539  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43745  predicted protein  27.75 
 
 
585 aa  49.3  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0989203  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1586  hypothetical protein  29.52 
 
 
325 aa  46.6  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  31.21 
 
 
218 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2252  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.89 
 
 
310 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3860  Ribosomal small subunit Rsm22  30.08 
 
 
327 aa  45.8  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.713494  normal  0.163136 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2223  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.24 
 
 
310 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.38 
 
 
230 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0081  hypothetical protein  22.32 
 
 
462 aa  44.3  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2226  dimethyladenosine transferase  33.64 
 
 
288 aa  43.9  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.587183 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0515  Methyltransferase type 12  29.45 
 
 
235 aa  43.9  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3565  ribosomal small subunit Rsm22  32.08 
 
 
346 aa  43.5  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0396648  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0246  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  36.15 
 
 
287 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0486812  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0774  HemK family modification methylase  32.96 
 
 
283 aa  43.1  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0850729 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>