25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1399 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1399  Ribosomal small subunit Rsm22  100 
 
 		 973 aa  1890    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2077  hypothetical protein  55.44 
 
 		 982 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.183603 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2712  hypothetical protein  42.13 
 
 		 576 aa  301  4e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.837106  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1834  hypothetical protein  48.74 
 
 		 659 aa  171  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0081  hypothetical protein  32.32 
 
 		 462 aa  168  4e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0403  methyltransferase type 12  29.24 
 
 		 396 aa  63.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0431  Methyltransferase type 12  29.41 
 
 		 430 aa  62  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0432  Methyltransferase type 12  29.06 
 
 		 418 aa  60.1  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1138  ribosomal small subunit Rsm22  32.57 
 
 		 354 aa  59.3  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.169783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4168  ribosomal small subunit Rsm22  29.55 
 
 		 417 aa  57.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.202008  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2135  Ribosomal small subunit Rsm22  33.33 
 
 		 332 aa  54.3  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3231  methyltransferase type 12  27.69 
 
 		 356 aa  53.1  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.822547  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2693  ribosomal small subunit Rsm22  29.77 
 
 		 326 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000108375  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1065  hypothetical protein  35.05 
 
 		 327 aa  52  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3744  rRNA methylase-like protein  31.03 
 
 		 338 aa  51.6  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000177024 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1591  ribosomal small subunit Rsm22  28.74 
 
 		 323 aa  51.6  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0197095  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4032  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 321 aa  50.8  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.541283  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1193  hypothetical protein  36.73 
 
 		 327 aa  50.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.867096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2609  hypothetical protein  29.1 
 
 		 348 aa  50.8  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782998  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1586  hypothetical protein  27.96 
 
 		 325 aa  50.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1520  hypothetical protein  29.31 
 
 		 321 aa  49.7  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1532  Ribosomal small subunit Rsm22  30.43 
 
 		 336 aa  49.7  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1574  hypothetical protein  33.33 
 
 		 321 aa  49.7  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4984  Ribosomal small subunit Rsm22  33.68 
 
 		 322 aa  46.6  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.839069  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3030  hypothetical protein  35.11 
 
 		 318 aa  45.8  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93082 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>