35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_4168 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_4168  ribosomal small subunit Rsm22  100 
 
 		 417 aa  790    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.202008  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0403  methyltransferase type 12  74.08 
 
 		 396 aa  501  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0432  Methyltransferase type 12  74.22 
 
 		 418 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0431  Methyltransferase type 12  73.9 
 
 		 430 aa  495  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5894  Ribosomal small subunit Rsm22  34.72 
 
 		 394 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2077  hypothetical protein  29.03 
 
 		 982 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.183603 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1138  ribosomal small subunit Rsm22  30.28 
 
 		 354 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.169783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2712  hypothetical protein  29.41 
 
 		 576 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.837106  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0805  hypothetical protein  33.17 
 
 		 446 aa  73.9  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.372154  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2131  hypothetical protein  30.77 
 
 		 509 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2135  Ribosomal small subunit Rsm22  31.84 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4984  Ribosomal small subunit Rsm22  30.23 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.839069  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1399  Ribosomal small subunit Rsm22  29.51 
 
 		 973 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0618  Ribosomal small subunit Rsm22  28.57 
 
 		 459 aa  71.6  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1065  hypothetical protein  29.77 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4032  methyltransferase type 11  28.22 
 
 		 321 aa  67  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.541283  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1532  Ribosomal small subunit Rsm22  26.94 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3744  rRNA methylase-like protein  28.3 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000177024 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1520  hypothetical protein  27.22 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4375  hypothetical protein  29.11 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.623348  normal  0.0519493 
 
 
-
 
NC_004310  BR1574  hypothetical protein  27.22 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1193  hypothetical protein  30.51 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.867096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2693  ribosomal small subunit Rsm22  26.79 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000108375  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2609  hypothetical protein  28.95 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782998  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3030  hypothetical protein  27.34 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93082 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1591  ribosomal small subunit Rsm22  26.77 
 
 		 323 aa  59.3  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0197095  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2411  methyltransferase type 12  30.12 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.321714  normal  0.120209 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0954  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  25.62 
 
 		 447 aa  52.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.539075  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0145  hypothetical protein  25.43 
 
 		 467 aa  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.459193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3231  methyltransferase type 12  26.9 
 
 		 356 aa  47.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.822547  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2356  Methyltransferase type 12  27.44 
 
 		 470 aa  46.6  0.0009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.129539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3565  ribosomal small subunit Rsm22  34.91 
 
 		 346 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0396648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1586  hypothetical protein  28.24 
 
 		 325 aa  44.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0081  hypothetical protein  22.13 
 
 		 462 aa  43.9  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0767  hypothetical protein  22.22 
 
 		 496 aa  43.9  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>