21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43745 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_43745  predicted protein  100 
 
 		 585 aa  1209    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0989203  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1532  Ribosomal small subunit Rsm22  30.43 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2609  hypothetical protein  25.47 
 
 		 348 aa  73.6  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782998  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4032  methyltransferase type 11  29.08 
 
 		 321 aa  69.3  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.541283  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33329  predicted protein  27.16 
 
 		 664 aa  66.6  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.335485 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3744  rRNA methylase-like protein  28.97 
 
 		 338 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000177024 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3231  methyltransferase type 12  23 
 
 		 356 aa  63.5  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.822547  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4984  Ribosomal small subunit Rsm22  26.6 
 
 		 322 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.839069  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1586  hypothetical protein  28.66 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1138  ribosomal small subunit Rsm22  28.65 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.169783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1193  hypothetical protein  28.83 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.867096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3030  hypothetical protein  23.98 
 
 		 318 aa  54.3  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93082 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4375  hypothetical protein  28.06 
 
 		 321 aa  53.9  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.623348  normal  0.0519493 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2693  ribosomal small subunit Rsm22  32.97 
 
 		 326 aa  53.9  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000108375  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2411  methyltransferase type 12  26.73 
 
 		 340 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.321714  normal  0.120209 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1065  hypothetical protein  27.22 
 
 		 327 aa  51.6  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350622  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04613  37S ribosomal protein Rsm22 (AFU_orthologue; AFUA_2G02290)  32.04 
 
 		 855 aa  51.2  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1520  hypothetical protein  25.87 
 
 		 321 aa  48.5  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1574  hypothetical protein  25.87 
 
 		 321 aa  48.1  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1591  ribosomal small subunit Rsm22  25.38 
 
 		 323 aa  45.8  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0197095  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2712  hypothetical protein  38.18 
 
 		 576 aa  43.5  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.837106  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>