24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_04613 on replicon BN001303
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001303  ANIA_04613  37S ribosomal protein Rsm22 (AFU_orthologue; AFUA_2G02290)  100 
 
 
855 aa  1768    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00390  3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferase, putative  25.77 
 
 
1030 aa  119  3e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33329  predicted protein  33.33 
 
 
664 aa  118  3.9999999999999997e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.335485 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86479  mitochondrial ribosome small subunit component  26.29 
 
 
708 aa  77.8  0.0000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.161976  normal  0.448427 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1138  ribosomal small subunit Rsm22  25.07 
 
 
354 aa  73.9  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.169783  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2693  ribosomal small subunit Rsm22  23.48 
 
 
326 aa  67  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000108375  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1532  Ribosomal small subunit Rsm22  31.13 
 
 
336 aa  66.2  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3744  rRNA methylase-like protein  24.4 
 
 
338 aa  64.3  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000177024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2135  Ribosomal small subunit Rsm22  22.94 
 
 
332 aa  63.9  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3641  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4984  Ribosomal small subunit Rsm22  24.05 
 
 
322 aa  58.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.839069  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2609  hypothetical protein  27.72 
 
 
348 aa  56.2  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782998  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1193  hypothetical protein  27.15 
 
 
327 aa  55.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.867096  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4375  hypothetical protein  26.97 
 
 
321 aa  54.3  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.623348  normal  0.0519493 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1065  hypothetical protein  24.67 
 
 
327 aa  52.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350622  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3030  hypothetical protein  27.81 
 
 
318 aa  52  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.93082 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43745  predicted protein  32.04 
 
 
585 aa  51.6  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0989203  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1591  ribosomal small subunit Rsm22  24.23 
 
 
323 aa  50.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0197095  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3231  methyltransferase type 12  24.27 
 
 
356 aa  50.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.822547  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2317  hypothetical protein  25.83 
 
 
326 aa  48.5  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1520  hypothetical protein  24.5 
 
 
321 aa  47.8  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4032  methyltransferase type 11  22.08 
 
 
321 aa  47.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.541283  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1574  hypothetical protein  24.5 
 
 
321 aa  47.8  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1586  hypothetical protein  23.44 
 
 
325 aa  45.1  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2411  methyltransferase type 12  30.17 
 
 
340 aa  44.7  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.321714  normal  0.120209 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>