25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_33329 on replicon NC_009363
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009363  OSTLU_33329  predicted protein  100 
 
 
664 aa  1333    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.335485 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04613  37S ribosomal protein Rsm22 (AFU_orthologue; AFUA_2G02290)  33.33 
 
 
855 aa  120  7e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00390  3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferase, putative  30.25 
 
 
1030 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2693  ribosomal small subunit Rsm22  28.83 
 
 
326 aa  94.7  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000108375  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1532  Ribosomal small subunit Rsm22  26.3 
 
 
336 aa  86.7  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2135  Ribosomal small subunit Rsm22  26.18 
 
 
332 aa  82  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3641  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3030  hypothetical protein  28.89 
 
 
318 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.93082 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4984  Ribosomal small subunit Rsm22  29.18 
 
 
322 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.839069  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2609  hypothetical protein  27.7 
 
 
348 aa  77  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782998  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3744  rRNA methylase-like protein  31.68 
 
 
338 aa  74.7  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000177024 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43745  predicted protein  27.16 
 
 
585 aa  74.3  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0989203  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1138  ribosomal small subunit Rsm22  31.01 
 
 
354 aa  74.3  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.169783  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3231  methyltransferase type 12  23.33 
 
 
356 aa  73.6  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.822547  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1586  hypothetical protein  24.16 
 
 
325 aa  72  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1065  hypothetical protein  29.6 
 
 
327 aa  71.2  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350622  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3860  Ribosomal small subunit Rsm22  25.74 
 
 
327 aa  69.7  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.713494  normal  0.163136 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4375  hypothetical protein  33.33 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.623348  normal  0.0519493 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2411  methyltransferase type 12  29 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.321714  normal  0.120209 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1193  hypothetical protein  34.51 
 
 
327 aa  65.1  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.867096  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4032  methyltransferase type 11  32.23 
 
 
321 aa  62.8  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.541283  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86479  mitochondrial ribosome small subunit component  24 
 
 
708 aa  59.7  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.161976  normal  0.448427 
 
 
-
 
NC_004310  BR1574  hypothetical protein  32.68 
 
 
321 aa  58.2  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1520  hypothetical protein  32.68 
 
 
321 aa  58.2  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2317  hypothetical protein  33.93 
 
 
326 aa  55.1  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1591  ribosomal small subunit Rsm22  32.2 
 
 
323 aa  54.3  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0197095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>