28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3860 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3860  Ribosomal small subunit Rsm22  100 
 
 		 327 aa  633  1e-180  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.713494  normal  0.163136 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1586  hypothetical protein  40.24 
 
 		 325 aa  210  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3030  hypothetical protein  41.04 
 
 		 318 aa  208  9e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93082 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2135  Ribosomal small subunit Rsm22  47.19 
 
 		 332 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1520  hypothetical protein  40.31 
 
 		 321 aa  203  3e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2693  ribosomal small subunit Rsm22  40.31 
 
 		 326 aa  202  6e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000108375  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1574  hypothetical protein  41.61 
 
 		 321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3231  methyltransferase type 12  40.33 
 
 		 356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.822547  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1591  ribosomal small subunit Rsm22  39.82 
 
 		 323 aa  195  7e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0197095  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2609  hypothetical protein  40.14 
 
 		 348 aa  193  4e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782998  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1532  Ribosomal small subunit Rsm22  34.88 
 
 		 336 aa  192  9e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4375  hypothetical protein  44 
 
 		 321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.623348  normal  0.0519493 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4032  methyltransferase type 11  39.81 
 
 		 321 aa  189  5.999999999999999e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.541283  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2411  methyltransferase type 12  42.63 
 
 		 340 aa  188  9e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.321714  normal  0.120209 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4984  Ribosomal small subunit Rsm22  40.91 
 
 		 322 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.839069  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1065  hypothetical protein  39.09 
 
 		 327 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1193  hypothetical protein  38.62 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.867096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2317  hypothetical protein  44.33 
 
 		 326 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3744  rRNA methylase-like protein  34.97 
 
 		 338 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000177024 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1138  ribosomal small subunit Rsm22  32.93 
 
 		 354 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.169783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33329  predicted protein  31.74 
 
 		 664 aa  67.8  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.335485 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43745  predicted protein  24.55 
 
 		 585 aa  61.2  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0989203  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5894  Ribosomal small subunit Rsm22  31.4 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00390  3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferase, putative  32.97 
 
 		 1030 aa  55.1  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1399  Ribosomal small subunit Rsm22  31.65 
 
 		 973 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3565  ribosomal small subunit Rsm22  30.32 
 
 		 346 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0396648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2712  hypothetical protein  30.56 
 
 		 576 aa  49.3  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.837106  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1834  hypothetical protein  43.64 
 
 		 659 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>