More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0505 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0505  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 
336 aa  644    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.198522  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  37.84 
 
 
342 aa  195  8.000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  39.27 
 
 
331 aa  194  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  40.77 
 
 
334 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  39.72 
 
 
327 aa  189  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  38.3 
 
 
334 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  37.08 
 
 
334 aa  186  6e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  39.14 
 
 
328 aa  186  6e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  37.08 
 
 
334 aa  186  6e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  40.82 
 
 
310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  41.78 
 
 
336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  39.79 
 
 
316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  39.53 
 
 
348 aa  183  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1273  inner-membrane translocator  37.41 
 
 
308 aa  183  4.0000000000000006e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  36.94 
 
 
325 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  36.89 
 
 
333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  38.46 
 
 
312 aa  179  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  35.67 
 
 
330 aa  180  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  35.67 
 
 
330 aa  180  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  35.67 
 
 
330 aa  180  4e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  41.84 
 
 
325 aa  179  4.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  36.44 
 
 
345 aa  179  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  37.7 
 
 
339 aa  179  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  39.45 
 
 
323 aa  179  5.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  38.21 
 
 
322 aa  179  7e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  38.05 
 
 
315 aa  178  9e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  40.26 
 
 
314 aa  178  9e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  37.75 
 
 
333 aa  178  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  37.04 
 
 
350 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  34.39 
 
 
345 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  34.39 
 
 
345 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  34.39 
 
 
345 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  38.34 
 
 
311 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  38.02 
 
 
311 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  38.02 
 
 
311 aa  176  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  38.02 
 
 
311 aa  176  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.53 
 
 
345 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  35.95 
 
 
350 aa  176  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2613  L-arabinose transporter permease protein  35.13 
 
 
338 aa  176  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727228  normal  0.716925 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  37.34 
 
 
320 aa  176  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  38.02 
 
 
311 aa  176  7e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  36.16 
 
 
328 aa  176  7e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  35.85 
 
 
345 aa  176  7e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  34.64 
 
 
332 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  39.01 
 
 
309 aa  174  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  34.97 
 
 
345 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  37.7 
 
 
311 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  37.7 
 
 
311 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  37.7 
 
 
311 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  35.42 
 
 
343 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  37.71 
 
 
320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  37.38 
 
 
311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  37.38 
 
 
311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  37.7 
 
 
311 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  34.47 
 
 
327 aa  174  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  36 
 
 
324 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  36.89 
 
 
337 aa  173  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  36.45 
 
 
342 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  36.45 
 
 
342 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  39.93 
 
 
314 aa  172  5e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  36.45 
 
 
342 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  36.87 
 
 
345 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  39.3 
 
 
342 aa  172  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  39.3 
 
 
342 aa  172  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  39.3 
 
 
334 aa  172  6.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  35.71 
 
 
309 aa  172  6.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  36.42 
 
 
347 aa  172  9e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  39.56 
 
 
324 aa  172  9e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  39.8 
 
 
327 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  43.82 
 
 
336 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  38.82 
 
 
322 aa  171  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  38.1 
 
 
324 aa  170  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  38.3 
 
 
327 aa  170  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  38.53 
 
 
337 aa  169  4e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  36.07 
 
 
306 aa  169  5e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3763  L-arabinose transporter permease protein  35.43 
 
 
316 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139254  normal  0.990186 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  36.3 
 
 
334 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  40.13 
 
 
313 aa  168  9e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  38.42 
 
 
353 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  40 
 
 
336 aa  168  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  34.76 
 
 
331 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3108  monosaccharide-transporting ATPase  34.84 
 
 
313 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0985733  hitchhiker  0.000124889 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  38.42 
 
 
353 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  39.01 
 
 
322 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  36.69 
 
 
343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  36.12 
 
 
346 aa  166  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  37.13 
 
 
348 aa  166  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  36.42 
 
 
346 aa  166  6.9999999999999995e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  38.46 
 
 
835 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  37.11 
 
 
311 aa  165  8e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  38.54 
 
 
338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1626  L-arabinose transporter permease protein  35.74 
 
 
339 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  36.46 
 
 
333 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  36.39 
 
 
343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  37.54 
 
 
310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  37.54 
 
 
310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0947  inner-membrane translocator  37.54 
 
 
319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  33.44 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4227  monosaccharide-transporting ATPase  36.25 
 
 
326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  39.79 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>