More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3274 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3274  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  450  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.644217  normal  0.18395 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0036  two component transcriptional regulator, winged helix family  69.03 
 
 		 229 aa  304  7e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0041  two component transcriptional regulator  67.53 
 
 		 237 aa  301  8.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0057  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.81 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3495  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 		 221 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972301  normal  0.0200045 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0642  DNA-binding response regulator  43.86 
 
 		 291 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.743353  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6288  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.81 
 
 		 224 aa  172  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0171319  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0813  DNA-binding response regulator  43.48 
 
 		 247 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0618873  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  43.48 
 
 		 220 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0809  DNA-binding response regulator  43.48 
 
 		 247 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0271  DNA-binding response regulator  43.48 
 
 		 247 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2671  DNA-binding response regulator  43.48 
 
 		 247 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0018  DNA-binding response regulator  43.48 
 
 		 247 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2405  DNA-binding response regulator  43.48 
 
 		 250 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0552978  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0526  two component transcriptional regulator  43.86 
 
 		 229 aa  170  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0788787  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.61 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5980  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 273 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5325  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 221 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.48 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3359  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.17 
 
 		 231 aa  169  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0670  two component transcriptional regulator  42.42 
 
 		 266 aa  169  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3296  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.54 
 
 		 260 aa  169  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0174877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  42.61 
 
 		 223 aa  169  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  41.3 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4163  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 223 aa  169  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2042  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 		 282 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143055  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2700  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 		 282 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.469389  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2574  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 		 242 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0465  two component transcriptional regulator  43.42 
 
 		 229 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2682  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 		 242 aa  168  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2653  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 		 242 aa  168  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0439  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 253 aa  168  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5097  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361428  normal  0.112132 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1764  DNA-binding response regulator  43.48 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0727  two component transcriptional regulator  45.02 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0429  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  41.59 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.199286  decreased coverage  0.000258733 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0649  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3589  two component transcriptional regulator  42.48 
 
 		 221 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3931  two component transcriptional regulator  42.48 
 
 		 221 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1802  two component transcriptional regulator  43.61 
 
 		 227 aa  165  5e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  43.81 
 
 		 218 aa  165  5e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  41.56 
 
 		 220 aa  165  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2526  two component transcriptional regulator  42.48 
 
 		 221 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0210  DNA-binding response regulator  42.04 
 
 		 225 aa  164  6.9999999999999995e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0630  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 223 aa  164  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 		 220 aa  164  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0454  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.04 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.04 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1724  DNA-binding response regulator TctD  43.29 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0825207  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7369  two component transcriptional regulator  45.13 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175011  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0498  two component transcriptional regulator  41.23 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3012  two component transcriptional regulator  43.1 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642179 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1581  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  40.53 
 
 		 223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2401  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 		 227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1180  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 221 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  45.54 
 
 		 220 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03384  response regulator  40.35 
 
 		 221 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000742618  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4259  two component transcriptional regulator  42.17 
 
 		 225 aa  162  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  43.04 
 
 		 220 aa  161  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5197  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.92 
 
 		 223 aa  161  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47869  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3516  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 222 aa  161  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.796525  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0876  two component transcriptional regulator  41.81 
 
 		 224 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478428 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3341  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.35 
 
 		 225 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219699 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3187  two component transcriptional regulator  43.1 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4687  two component transcriptional regulator  42.36 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000526997  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1127  DNA-binding response regulator TctD  43.29 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1501  DNA-binding response regulator TctD  43.29 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412982  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4432  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2277  DNA-binding response regulator TctD  43.29 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003617  DNA-binding response regulator  41.41 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.831618  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3958  two component transcriptional regulator  41.92 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0314218 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3643  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.35 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1037  transcriptional regulatory protein TctD  43.29 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1358  two component response regulator  39.21 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0114  DNA-binding response regulator TctD  43.29 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4638  two component transcriptional regulator  41.81 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0952  DNA-binding response regulator TctD  43.29 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3228  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.39 
 
 		 236 aa  159  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3950  two component transcriptional regulator  41.48 
 
 		 224 aa  159  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3067  two component transcriptional regulator  41.15 
 
 		 224 aa  159  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0801  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 221 aa  159  4e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0203691 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0057  two component transcriptional regulator  46.93 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6108  two component response regulator  39.91 
 
 		 226 aa  159  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.655098  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3389  two component transcriptional regulator  41.35 
 
 		 234 aa  158  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1459  two component transcriptional regulator  43.61 
 
 		 223 aa  158  7e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0357  two component transcriptional regulator  41.48 
 
 		 226 aa  158  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2735  two component transcriptional regulator  41.59 
 
 		 219 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1187  two component transcriptional regulatory protein  41.15 
 
 		 223 aa  158  8e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  44.3 
 
 		 219 aa  158  8e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0136  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 220 aa  158  9e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5130  OmpR/winged helix family two component transcriptional regulator  42.04 
 
 		 223 aa  157  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.76336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1307  two component transcriptional regulator  40.79 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0973239 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0277  two component transcriptional regulator  46.35 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.344057 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3552  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.39 
 
 		 236 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.65 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2126  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.26 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245988  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1433  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0310  two component transcriptional regulator  42.29 
 
 		 223 aa  155  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0894  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 222 aa  156  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3437  two component transcriptional regulator  41.92 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>