1704 genes were found for organism Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 18    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Bphy_5543  CDS  NC_010625  644  4231  -  3588  2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase  YP_001861665  hitchhiker  0.00134881  normal  0.730812  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5544  CDS  NC_010625  4334  5239  +  906  LysR family transcriptional regulator  YP_001861666  normal  1  normal  0.899335  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5545  CDS  NC_010625  5811  7349  +  1539  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_001861667  normal  1  normal  0.857112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5546  CDS  NC_010625  7346  7696  -  351  hypothetical protein  YP_001861668  normal  1  normal  0.659324  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5547  CDS  NC_010625  7836  8864  -  1029  LacI family transcription regulator  YP_001861669  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5548  CDS  NC_010625  9009  9551  +  543  carbohydrate kinase  YP_001861670  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5549  CDS  NC_010625  9617  10969  +  1353  major facilitator transporter  YP_001861671  normal  0.408354  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5550  CDS  NC_010625  11066  12295  +  1230  porin  YP_001861672  normal  0.117112  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5551  CDS  NC_010625  12617  13294  -  678  hypothetical protein  YP_001861673  normal  0.0205377  normal  0.899335  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5552  CDS  NC_010625  14145  14597  +  453  UspA domain-containing protein  YP_001861674  normal  0.0358862  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5553  CDS  NC_010625  14922  15254  +  333  ABC-type metal ion transport system periplasmic component/surface antigen-like protein  YP_001861675  normal  0.0797112  normal  0.635326  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5554  CDS  NC_010625  15377  16732  -  1356  Na+/H+ antiporter NhaA  YP_001861676  normal  0.477487  normal  0.958846  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5555  CDS  NC_010625  17165  18850  +  1686  sulfatase  YP_001861677  normal  0.708907  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5556  CDS  NC_010625  18932  19996  +  1065  putative nonspecific acid phosphatase, NapD-like protein  YP_001861678  normal  0.61312  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5557    NC_010625  20048  21333  +  1286      normal  0.244143  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5558  CDS  NC_010625  21355  22125  +  771  hypothetical protein  YP_001861679  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5559  CDS  NC_010625  22209  22985  -  777  hypothetical protein  YP_001861680  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5560  CDS  NC_010625  23476  24297  +  822  integrase family protein  YP_001861681  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5561  CDS  NC_010625  24543  24815  -  273  hypothetical protein  YP_001861682  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5562  CDS  NC_010625  25127  27529  -  2403  PQQ-dependent dehydrogenase glucose/quinate/shikimate family protein  YP_001861683  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5563  CDS  NC_010625  27907  28749  +  843  hypothetical protein  YP_001861684  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5564  CDS  NC_010625  28755  29645  +  891  hypothetical protein  YP_001861685  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5565  CDS  NC_010625  29645  30502  +  858  MltA-interacting MipA family protein  YP_001861686  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5566  CDS  NC_010625  30689  31639  -  951  LysR family transcriptional regulator  YP_001861687  normal  0.0372777  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5567  CDS  NC_010625  31675  33747  -  2073  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  YP_001861688  normal  0.749864  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5568  CDS  NC_010625  33820  34437  -  618  glutathione S-transferase domain-containing protein  YP_001861689  normal  0.446565  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5569  CDS  NC_010625  34584  36476  -  1893  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  YP_001861690  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5570  CDS  NC_010625  36709  37326  -  618  ThiJ/PfpI domain-containing protein  YP_001861691  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5571  CDS  NC_010625  37414  38748  +  1335  transcriptional regulator  YP_001861692  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5572  CDS  NC_010625  38769  40235  -  1467  general substrate transporter  YP_001861693  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5573  CDS  NC_010625  40733  41401  +  669  hypothetical protein  YP_001861694  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5574  CDS  NC_010625  41629  42531  +  903  LysR family transcriptional regulator  YP_001861695  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5575  CDS  NC_010625  42785  43990  +  1206  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  YP_001861696  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5576  CDS  NC_010625  44220  44600  -  381  hypothetical protein  YP_001861697  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5577  CDS  NC_010625  44869  45624  +  756  NmrA family protein  YP_001861698  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5578  CDS  NC_010625  45837  46670  +  834  amidohydrolase 2  YP_001861699  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5579  CDS  NC_010625  47137  48378  +  1242  protein serine/threonine phosphatase  YP_001861700  normal  0.79883  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5580  CDS  NC_010625  48382  48945  +  564  hypothetical protein  YP_001861701  normal  0.338865  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5581  CDS  NC_010625  48964  49359  +  396  putative lipoprotein  YP_001861702  normal  0.565778  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5582  CDS  NC_010625  49362  50087  +  726  diguanylate cyclase  YP_001861703  normal  0.503288  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5583  CDS  NC_010625  50130  50267  -  138  hypothetical protein  YP_001861704  normal  0.583033  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5584  CDS  NC_010625  50449  51027  +  579  NnrU family protein  YP_001861705  normal  0.14562  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5585  CDS  NC_010625  51032  51928  -  897  LysR family transcriptional regulator  YP_001861706  normal  0.462735  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5586  CDS  NC_010625  52127  52543  +  417  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  YP_001861707  normal  0.799446  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5587  CDS  NC_010625  52547  52915  +  369  succinate dehydrogenase, hydrophobic membrane anchor protein  YP_001861708  normal  0.749147  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5588  CDS  NC_010625  52920  54695  +  1776  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  YP_001861709  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5589  CDS  NC_010625  54727  55431  +  705  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  YP_001861710  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5590  CDS  NC_010625  55431  55703  +  273  hypothetical protein  YP_001861711  normal  0.678134  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5591  CDS  NC_010625  55996  57555  +  1560  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_001861712  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5592  CDS  NC_010625  57817  59520  +  1704  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_001861713  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5593  CDS  NC_010625  59525  59818  -  294  hypothetical protein  YP_001861714  normal  0.974751  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5594  CDS  NC_010625  59928  60893  +  966  AraC family transcriptional regulator  YP_001861715  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5595  CDS  NC_010625  60962  61903  -  942  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  YP_001861716  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5596  CDS  NC_010625  62010  63035  -  1026  monosaccharide-transporting ATPase  YP_001861717  normal  0.496226  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5597  CDS  NC_010625  63055  64566  -  1512  ABC transporter related  YP_001861718  normal  0.609428  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5598  CDS  NC_010625  64614  65375  -  762  GntR family transcriptional regulator  YP_001861719  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5599  CDS  NC_010625  65526  66824  +  1299  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  YP_001861720  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5600  CDS  NC_010625  66851  67573  +  723  haloacid dehalogenase, type II  YP_001861721  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5601  CDS  NC_010625  67629  68657  -  1029  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  YP_001861722  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5602  CDS  NC_010625  68689  69114  -  426  OsmC family protein  YP_001861723  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5603  CDS  NC_010625  69308  69874  -  567  TetR family transcriptional regulator  YP_001861724  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5604  CDS  NC_010625  70911  73229  +  2319  hypothetical protein  YP_001861725  normal  0.152191  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5605    NC_010625  73456  73578  +  123      normal  0.0961591  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5606  CDS  NC_010625  73999  75456  +  1458  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  YP_001861726  normal  0.195097  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5607  CDS  NC_010625  75453  75950  -  498  hypothetical protein  YP_001861727  normal  0.368142  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5608  CDS  NC_010625  76150  76605  +  456  signal transduction protein  YP_001861728  normal  0.606425  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5609  CDS  NC_010625  76633  77148  -  516  AraC family transcriptional regulator  YP_001861729  normal  0.519002  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5610  CDS  NC_010625  77779  78522  -  744  Asp/Glu/hydantoin racemase  YP_001861730  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5611  CDS  NC_010625  78519  79736  -  1218  hypothetical protein  YP_001861731  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5612  CDS  NC_010625  79726  82044  -  2319  putative sigma54 specific transcriptional regulator  YP_001861732  normal  1  normal  1  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5613  CDS  NC_010625  82509  83792  -  1284  methionine gamma-lyase  YP_001861733  normal  1  normal  0.523956  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5614  CDS  NC_010625  83838  84530  -  693  phosphoesterase PA-phosphatase related  YP_001861734  normal  0.287083  normal  0.473985  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5615  CDS  NC_010625  84862  86520  -  1659  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  YP_001861735  normal  0.480647  normal  0.330507  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5616  CDS  NC_010625  86939  87889  -  951  response regulator receiver modulated CheW protein  YP_001861736  normal  1  normal  0.375026  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5617  CDS  NC_010625  88060  88917  -  858  abortive infection protein  YP_001861737  normal  1  normal  0.351592  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5618  CDS  NC_010625  89285  90571  +  1287  major facilitator transporter  YP_001861738  normal  1  normal  0.287687  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5619  CDS  NC_010625  90669  91598  +  930  LysR family transcriptional regulator  YP_001861739  normal  1  normal  0.272511  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5620  CDS  NC_010625  91783  92286  +  504  hypothetical protein  YP_001861740  normal  1  normal  0.234142  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5621  CDS  NC_010625  92331  93350  +  1020  hypothetical protein  YP_001861741  normal  1  normal  0.189741  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5622  CDS  NC_010625  93386  94852  +  1467  aldehyde dehydrogenase  YP_001861742  normal  1  normal  0.216133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5623  CDS  NC_010625  94866  95933  +  1068  iron-containing alcohol dehydrogenase  YP_001861743  normal  1  normal  0.19032  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5624  CDS  NC_010625  95964  96845  +  882  intradiol ring-cleavage dioxygenase  YP_001861744  normal  1  normal  0.187474  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5625  CDS  NC_010625  96842  97153  +  312  YCII-related  YP_001861745  normal  1  normal  0.161599  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5626  CDS  NC_010625  97150  97485  +  336  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  YP_001861746  normal  1  normal  0.164476  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5627  CDS  NC_010625  97555  98022  +  468  hypothetical protein  YP_001861747  normal  1  normal  0.17022  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5628  CDS  NC_010625  98390  100144  +  1755  sulfate transporter  YP_001861748  normal  1  normal  0.292466  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5629  CDS  NC_010625  100866  106898  +  6033  GAF sensor hybrid histidine kinase  YP_001861749  normal  1  normal  0.117507  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5630  CDS  NC_010625  106908  109052  +  2145  histidine kinase  YP_001861750  normal  1  normal  0.11737  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5631  CDS  NC_010625  109143  109445  -  303  hypothetical protein  YP_001861751  normal  1  normal  0.101691  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5632  CDS  NC_010625  109644  110252  -  609  L(+)-tartrate dehydratase subunit beta  YP_001861752  normal  1  normal  0.110471  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5633  CDS  NC_010625  110249  111148  -  900  tartrate dehydratase subunit alpha  YP_001861753  normal  0.648289  normal  0.17022  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5634  CDS  NC_010625  111441  111689  +  249  XRE family transcriptional regulator  YP_001861754  normal  0.909222  normal  0.150315  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5635  CDS  NC_010625  111692  113035  +  1344  HipA domain-containing protein  YP_001861755  normal  0.525846  normal  0.14054  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5636  CDS  NC_010625  113172  114086  +  915  LysR family transcriptional regulator  YP_001861756  normal  0.960553  normal  0.170882  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5637  CDS  NC_010625  114220  115548  +  1329  sodium:dicarboxylate symporter  YP_001861757  normal  0.315095  normal  0.349005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5638  CDS  NC_010625  115545  117044  +  1500  aspartate racemase  YP_001861758  normal  0.635745  normal  0.372877  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5639  CDS  NC_010625  117087  118526  +  1440  aspartate ammonia-lyase  YP_001861759  normal  0.611375  normal  0.502562  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5640  CDS  NC_010625  118645  118998  +  354  transport-associated  YP_001861760  normal  1  normal  0.527618  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5641  CDS  NC_010625  119078  120349  -  1272  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  YP_001861761  normal  1  normal  0.636346  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_5642  CDS  NC_010625  120363  121430  -  1068  glycolate oxidase FAD binding subunit  YP_001861762  normal  0.835836  normal  0.589052  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 18    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>