16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5558 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_5558  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  520  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6673  hypothetical protein  68.25 
 
 
254 aa  323  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4845  hypothetical protein  55.56 
 
 
261 aa  276  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.754626  normal  0.106217 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6680  hypothetical protein  51.57 
 
 
255 aa  249  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2086  hypothetical protein  46.43 
 
 
255 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51673  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2485  hypothetical protein  44.49 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.698671 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1372  hypothetical protein  46.45 
 
 
223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.515412  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4705  hypothetical protein  42.51 
 
 
287 aa  193  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731007  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0582  hypothetical protein  41.88 
 
 
194 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1867  hypothetical protein  29.74 
 
 
267 aa  88.6  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.715843  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2757  hypothetical protein  29.48 
 
 
254 aa  87.4  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6119  hypothetical protein  29.44 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.620805  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5305  hypothetical protein  23.94 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452589  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2308  hypothetical protein  23.94 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3416  hypothetical protein  26.18 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16382  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2642  hypothetical protein  27.15 
 
 
278 aa  52.4  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.52745  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>