22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5580 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_5580  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  388  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.338865  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2260  hypothetical protein  58.76 
 
 
190 aa  222  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209186  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2928  hypothetical protein  56.74 
 
 
190 aa  209  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3039  hypothetical protein  54.01 
 
 
193 aa  207  9e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.57913  normal  0.53806 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1433  hypothetical protein  48.82 
 
 
186 aa  176  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3327  hypothetical protein  48.88 
 
 
184 aa  175  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3126  hypothetical protein  49.72 
 
 
183 aa  175  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0983  hypothetical protein  47.75 
 
 
184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2935  hypothetical protein  47.46 
 
 
201 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1789  hypothetical protein  35.2 
 
 
184 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.721327  normal  0.0153035 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4583  hypothetical protein  34.44 
 
 
184 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1010  hypothetical protein  35.67 
 
 
184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1586  hypothetical protein  34 
 
 
210 aa  106  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.693113 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1476  hypothetical protein  31.58 
 
 
197 aa  105  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2358  hypothetical protein  28.8 
 
 
181 aa  97.1  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3046  hypothetical protein  30 
 
 
190 aa  93.6  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1552  hypothetical protein  27.56 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67291  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4268  hypothetical protein  26.35 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02140  hypothetical protein  27.01 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.541168 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0251  hypothetical protein  27.01 
 
 
180 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1844  hypothetical protein  31.61 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.944484  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2113  hypothetical protein  26.99 
 
 
176 aa  55.5  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>