242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5553 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5553  ABC-type metal ion transport system periplasmic component/surface antigen-like protein  100 
 
 		 110 aa  229  7.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0797112  normal  0.635326 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3391  NLPA lipoprotein  83.64 
 
 		 283 aa  97.8  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0852  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  83.64 
 
 		 279 aa  97.4  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00818473  hitchhiker  0.0030003 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3027  NLPA lipoprotein  81.82 
 
 		 257 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.15305  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4929  NLPA lipoprotein  81.82 
 
 		 279 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.7748  normal  0.886888 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5339  NLPA lipoprotein  81.82 
 
 		 279 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4537  NLPA lipoprotein  83.64 
 
 		 279 aa  97.1  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163083  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1441  putative D-methionine-binding lipoprotein metQ  81.82 
 
 		 279 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.404367  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1864  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  81.82 
 
 		 248 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00940719  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0446  methionine ABC transporter periiplasmic amino-acid binding protein  81.82 
 
 		 279 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4689  NLPA lipoprotein  80 
 
 		 286 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53578  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5218  NLPA lipoprotein  80 
 
 		 286 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.431973 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0856  putative D-methionine-binding lipoprotein metQ  81.82 
 
 		 279 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.672009  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2172  putative D-methionine-binding lipoprotein metQ  81.82 
 
 		 279 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.410212  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0544  methionine ABC transporter periiplasmic amino-acid binding protein  81.82 
 
 		 279 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0309  NLPA lipoprotein  78.18 
 
 		 276 aa  94  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2364  NLPA lipoprotein  51.43 
 
 		 264 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0111009  hitchhiker  0.00286659 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2086  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  67.27 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.557351  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1783  NLPA lipoprotein  44.59 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2913  hypothetical protein  39.36 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.828858  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34280  hypothetical protein  36.89 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.595717  decreased coverage  0.00469522 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4224  NLPA lipoprotein  53.45 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00732544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0221  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  60 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542967  hitchhiker  0.00586587 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0237  NLPA lipoprotein  60 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0245  NLPA lipoprotein  60 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.590029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4991  NLPA lipoprotein  60 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31510  NLPA lipoprotein  41.89 
 
 		 273 aa  64.7  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0866594  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0236  NLPA lipoprotein  58 
 
 		 266 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.643505 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5187  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  54.9 
 
 		 262 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0351  NLPA lipoprotein  54.9 
 
 		 262 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.40138  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1777  NLPA lipoprotein  41.03 
 
 		 274 aa  60.8  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2924  NLPA lipoprotein  38.24 
 
 		 279 aa  60.1  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.112237  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1782  NLPA lipoprotein  46.3 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7233  outer membrane lipoprotein  48.21 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3077  NLPA lipoprotein  38.24 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1127  NLPA lipoprotein  54.72 
 
 		 281 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2682  NLPA lipoprotein  40.23 
 
 		 271 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0343  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  49.06 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4960  putative ABC transporter, substrate-binding protein  50.94 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0360  putative ABC transporter, substrate-binding protein  49.06 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0299  ABC transporter substrate-binding protein  49.06 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0283  lipoprotein ABC transporter substrate-binding protein  47.17 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0286  lipoprotein ABC transporter substrate-binding protein  47.17 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0387  putative ABC transporter, substrate-binding protein  47.17 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0345  putative ABC transporter, substrate-binding protein  49.06 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0314  ABC transporter substrate-binding protein  49.06 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  53.66 
 
 		 265 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0786  NLPA lipoprotein  52 
 
 		 264 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0294  NLPA lipoprotein  47.17 
 
 		 284 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0562  NLPA lipoprotein  50 
 
 		 263 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0293  NLPA lipoprotein  47.17 
 
 		 284 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2455  NLPA lipoprotein  41.67 
 
 		 273 aa  52  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1614  NLPA lipoprotein  42.37 
 
 		 261 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.141443  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001625  methionine ABC transporter substrate-binding protein  38.98 
 
 		 267 aa  51.6  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  51.16 
 
 		 263 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3221  NLPA lipoprotein  42.37 
 
 		 260 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0859  NLPA lipoprotein  31.87 
 
 		 273 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  48.84 
 
 		 278 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1176  hypothetical protein  37.31 
 
 		 259 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13010  hypothetical protein  37.31 
 
 		 259 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0867  NLPA lipoprotein  38.75 
 
 		 270 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.666915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0565  lipoprotein YaeC  51.22 
 
 		 258 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2810  NLPA lipoprotein  54.29 
 
 		 272 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3271  lipoprotein, YaeC family  53.66 
 
 		 268 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000895864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3593  lipoprotein, YaeC family  55 
 
 		 268 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000081124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3285  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  42 
 
 		 258 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5123  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  44.19 
 
 		 270 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4694  ABC transporter, substrate-binding protein  44.19 
 
 		 270 aa  47.4  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.825996  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3223  lipoprotein YaeC  56.1 
 
 		 257 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1143  YaeC family lipoprotein  46 
 
 		 262 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2654  NLPA lipoprotein  36.07 
 
 		 276 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0960  YaeC family lipoprotein  29.79 
 
 		 278 aa  47.4  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4709  ABC transporter, substrate-binding protein  46.15 
 
 		 270 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  37.93 
 
 		 272 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0113  putative ABC transporter, substrate-binding protein  46.15 
 
 		 270 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0233603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  37.93 
 
 		 272 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5090  putative ABC transporter, substrate-binding protein  46.15 
 
 		 270 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5125  putative ABC transporter, substrate-binding protein  46.15 
 
 		 270 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.213714  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  37.93 
 
 		 272 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  37.93 
 
 		 272 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  37.93 
 
 		 272 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  40.38 
 
 		 281 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3386  putative outermembrane signal peptide protein  46 
 
 		 529 aa  47.4  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000211663  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4853  ABC transporter substrate-binding protein  46.15 
 
 		 270 aa  47.4  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5220  ABC transporter substrate-binding protein  46.15 
 
 		 270 aa  47.4  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1396  YaeC family lipoprotein  28.72 
 
 		 278 aa  47  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760284  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0099  ABC transporter, substrate-binding protein  41.38 
 
 		 281 aa  47  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2102  lipoprotein YaeC  34.18 
 
 		 275 aa  47  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000812987  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5122  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  48.72 
 
 		 268 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0114  putative ABC transporter, substrate-binding protein  48.72 
 
 		 268 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0830208  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4708  ABC transporter, substrate-binding protein  48.72 
 
 		 268 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0328  NLPA lipoprotein  30.23 
 
 		 260 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.255227 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5219  ABC transporter substrate-binding protein  48.72 
 
 		 268 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  38.46 
 
 		 271 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5124  putative ABC transporter, substrate-binding protein  48.72 
 
 		 268 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5089  putative ABC transporter, substrate-binding protein  48.72 
 
 		 268 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5126  putative ABC transporter, substrate-binding protein  48.72 
 
 		 268 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.668941  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1773  NLPA lipoprotein  50 
 
 		 270 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861841 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0648  NLPA lipoprotein  33.33 
 
 		 273 aa  46.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5127  putative ABC transporter, substrate-binding protein  46.15 
 
 		 270 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.46965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>