114 genes were found for organism Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Rsph17025_4244  CDS  NC_009431  434  3787  +  3354  hypothetical protein  YP_001170399  normal  1  normal  0.172375  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4245  CDS  NC_009431  4321  5172  -  852  hypothetical protein  YP_001170400  normal  0.317932  normal  0.160972  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4246  CDS  NC_009431  5264  6952  -  1689  hypothetical protein  YP_001170401  normal  0.2464  normal  0.120296  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4247    NC_009431  7582  8185  +  604      normal  1  normal  0.0950105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4248  CDS  NC_009431  8130  8759  -  630  hypothetical protein  YP_001170402  normal  1  normal  0.142678  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4249  CDS  NC_009431  8832  9728  +  897  chromosome replication initiation inhibitor protein  YP_001170403  normal  0.373423  normal  0.150215  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4250  CDS  NC_009431  9835  10848  -  1014  hypothetical protein  YP_001170404  normal  0.0554768  normal  0.153083  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4251  CDS  NC_009431  10911  11801  -  891  SH3 type 3 domain-containing protein  YP_001170405  normal  0.0287131  normal  0.237743  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4252  CDS  NC_009431  12042  13280  +  1239  hypothetical protein  YP_001170406  normal  0.271244  normal  0.169706  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4253  CDS  NC_009431  13587  13880  -  294  hypothetical protein  YP_001170407  normal  0.0727736  normal  0.410035  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4254  CDS  NC_009431  14081  14584  +  504  hypothetical protein  YP_001170408  normal  0.0887371  normal  0.428287  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4255  CDS  NC_009431  14699  15466  +  768  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  YP_001170409  normal  0.337254  normal  0.605714  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4256  CDS  NC_009431  15507  16301  +  795  hypothetical protein  YP_001170410  normal  0.124137  normal  0.459101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4257    NC_009431  16457  16665  +  209      normal  0.23856  normal  0.995329  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4258  CDS  NC_009431  16859  17065  -  207  hypothetical protein  YP_001170411  normal  0.321323  normal  0.982609  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4259  CDS  NC_009431  17317  17691  -  375  hypothetical protein  YP_001170412  normal  0.116623  normal  0.995329  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4260  CDS  NC_009431  18160  18840  +  681  periplasmic binding protein  YP_001170413  normal  0.0815099  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4261  CDS  NC_009431  18993  19229  -  237  hypothetical protein  YP_001170414  normal  0.286206  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4262    NC_009431  19443  19889  +  447      normal  0.72981  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4263  CDS  NC_009431  19952  20290  -  339  hypothetical protein  YP_001170415  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4264  CDS  NC_009431  20413  21294  +  882  transport system permease protein  YP_001170416  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4265  CDS  NC_009431  21414  22238  +  825  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  YP_001170417  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4266  CDS  NC_009431  22231  23175  +  945  hypothetical protein  YP_001170418  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4267  CDS  NC_009431  23172  23930  +  759  hypothetical protein  YP_001170419  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4268  CDS  NC_009431  24084  26018  -  1935  GntR domain-containing protein  YP_001170420  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4269  CDS  NC_009431  26220  26834  -  615  hypothetical protein  YP_001170421  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4270  CDS  NC_009431  26874  27569  -  696  hypothetical protein  YP_001170422  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4271  CDS  NC_009431  27662  28411  +  750  hypothetical protein  YP_001170423  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4272  CDS  NC_009431  28687  30324  +  1638  hypothetical protein  YP_001170424  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4273  CDS  NC_009431  30389  32872  +  2484  hypothetical protein  YP_001170425  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4274  CDS  NC_009431  33049  34155  -  1107  hypothetical protein  YP_001170426  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4275  CDS  NC_009431  34213  34653  -  441  nucleoside diphosphate kinase regulator  YP_001170427  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4276  CDS  NC_009431  34690  34989  +  300  hypothetical protein  YP_001170428  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4277  CDS  NC_009431  35335  37002  +  1668  hypothetical protein  YP_001170429  normal  0.280884  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4278  CDS  NC_009431  37146  37901  +  756  hypothetical protein  YP_001170430  normal  0.50077  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4279  CDS  NC_009431  37982  40792  +  2811  diguanylate phosphodiesterase  YP_001170431  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4280  CDS  NC_009431  40917  42437  -  1521  hypothetical protein  YP_001170432  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4281  CDS  NC_009431  42507  44609  +  2103  hypothetical protein  YP_001170433  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4282  CDS  NC_009431  44882  46186  -  1305  hypothetical protein  YP_001170434  normal  0.789831  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4283  CDS  NC_009431  46176  46604  -  429  hypothetical protein  YP_001170435  normal  0.171315  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4284    NC_009431  47090  48069  +  980      normal  0.500601  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4285  CDS  NC_009431  48142  48276  -  135  hypothetical protein  YP_001170436  normal  0.635974  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4286  CDS  NC_009431  48768  50831  -  2064  hypothetical protein  YP_001170437  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4287  CDS  NC_009431  51129  51287  -  159  hypothetical protein  YP_001170438  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4288  CDS  NC_009431  51284  51673  -  390  hypothetical protein  YP_001170439  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4289  CDS  NC_009431  51694  52053  -  360  hypothetical protein  YP_001170440  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4290  CDS  NC_009431  52623  52829  +  207  hypothetical protein  YP_001170441  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4291  CDS  NC_009431  52851  53222  +  372  hypothetical protein  YP_001170442  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4292  CDS  NC_009431  53310  54023  -  714  hypothetical protein  YP_001170443  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4293  CDS  NC_009431  54226  54687  -  462  hypothetical protein  YP_001170444  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4294  CDS  NC_009431  54684  55073  -  390  hypothetical protein  YP_001170445  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4295  CDS  NC_009431  55094  55495  -  402  hypothetical protein  YP_001170446  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4296  CDS  NC_009431  55613  55837  +  225  hypothetical protein  YP_001170447  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4297  CDS  NC_009431  55834  56226  +  393  hypothetical protein  YP_001170448  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4298  CDS  NC_009431  56325  57005  +  681  hypothetical protein  YP_001170449  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4299    NC_009431  57024  57248  +  225      normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4300  CDS  NC_009431  58008  58397  -  390  hypothetical protein  YP_001170450  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4301  CDS  NC_009431  58418  58828  -  411  hypothetical protein  YP_001170451  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4302  CDS  NC_009431  59141  59971  +  831  transposase IS66  YP_001170452  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4303  CDS  NC_009431  60487  60909  +  423  hypothetical protein  YP_001170453  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4304  CDS  NC_009431  60906  61259  +  354  hypothetical protein  YP_001170454  normal  0.758008  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4305  CDS  NC_009431  61328  62899  +  1572  hypothetical protein  YP_001170455  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4306  CDS  NC_009431  62900  63112  -  213  hypothetical protein  YP_001170456  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4307  CDS  NC_009431  63208  64410  +  1203  hypothetical protein  YP_001170457  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4308  CDS  NC_009431  64434  66005  -  1572  hypothetical protein  YP_001170458  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4309  CDS  NC_009431  66074  66427  -  354  hypothetical protein  YP_001170459  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4310  CDS  NC_009431  66424  66846  -  423  hypothetical protein  YP_001170460  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4311  CDS  NC_009431  66926  68647  +  1722  TOBE domain-containing protein  YP_001170461  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4312  CDS  NC_009431  68825  69622  +  798  hypothetical protein  YP_001170462  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4313  CDS  NC_009431  69646  70410  +  765  hypothetical protein  YP_001170463  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4314  CDS  NC_009431  70414  71100  +  687  hypothetical protein  YP_001170464  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4315  CDS  NC_009431  71097  72185  +  1089  hypothetical protein  YP_001170465  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4316  CDS  NC_009431  72233  73027  +  795  hypothetical protein  YP_001170466  normal  1  normal  0.931195  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4317  CDS  NC_009431  73112  73954  +  843  hypothetical protein  YP_001170467  normal  1  normal  0.922994  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4318  CDS  NC_009431  74090  75220  -  1131  hypothetical protein  YP_001170468  normal  0.598317  normal  0.713921  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4319  CDS  NC_009431  75878  76285  +  408  hypothetical protein  YP_001170469  normal  1  normal  0.458916  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4320  CDS  NC_009431  76793  77674  +  882  hypothetical protein  YP_001170470  normal  1  normal  0.264253  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4321  CDS  NC_009431  77956  79008  -  1053  hypothetical protein  YP_001170471  normal  1  normal  0.185891  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4322  CDS  NC_009431  79008  80315  -  1308  hypothetical protein  YP_001170472  normal  1  normal  0.131093  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4323  CDS  NC_009431  80677  81387  +  711  hypothetical protein  YP_001170473  normal  1  normal  0.287868  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4324  CDS  NC_009431  81666  82406  +  741  hypothetical protein  YP_001170474  normal  1  normal  0.328763  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4325  CDS  NC_009431  82447  83682  -  1236  hypothetical protein  YP_001170475  normal  1  normal  0.36321  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4326  CDS  NC_009431  83733  84401  -  669  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  YP_001170476  normal  1  normal  0.0885545  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4327  CDS  NC_009431  84398  84697  -  300  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  YP_001170477  normal  1  normal  0.0817685  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4328  CDS  NC_009431  84703  85626  +  924  hypothetical protein  YP_001170478  normal  1  normal  0.154827  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4329  CDS  NC_009431  85827  86033  -  207  hypothetical protein  YP_001170479  normal  1  normal  0.208733  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4330  CDS  NC_009431  86291  87430  -  1140  hypothetical protein  YP_001170480  normal  1  normal  0.187402  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4331  CDS  NC_009431  87729  88790  +  1062  NLPA lipoprotein  YP_001170481  normal  0.0798419  normal  0.109457  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4332  CDS  NC_009431  88780  89454  +  675  hypothetical protein  YP_001170482  normal  0.362545  normal  0.101939  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4333  CDS  NC_009431  89484  90260  +  777  hypothetical protein  YP_001170483  normal  0.325394  normal  0.0616758  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4334  CDS  NC_009431  90295  91620  -  1326  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_001170484  normal  1  normal  0.0766234  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4335  CDS  NC_009431  91688  92365  -  678  hypothetical protein  YP_001170485  normal  1  normal  0.0735993  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4336  CDS  NC_009431  92755  93624  -  870  hypothetical protein  YP_001170486  normal  1  normal  0.0474832  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4337  CDS  NC_009431  93792  95510  +  1719  carbonic anhydrase  YP_001170487  normal  1  normal  0.0331967  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4338  CDS  NC_009431  96083  97129  -  1047  hypothetical protein  YP_001170488  normal  0.589616  normal  0.0891494  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4339  CDS  NC_009431  97215  97835  +  621  hypothetical protein  YP_001170489  normal  0.257588  normal  0.0431137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4340  CDS  NC_009431  97985  98590  +  606  hypothetical protein  YP_001170490  normal  0.142326  normal  0.0705595  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4341  CDS  NC_009431  98587  99252  +  666  hypothetical protein  YP_001170491  normal  0.23123  normal  0.0434919  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4342  CDS  NC_009431  99267  101732  +  2466  hypothetical protein  YP_001170492  normal  0.161782  normal  0.0681295  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4343  CDS  NC_009431  101767  102192  +  426  hypothetical protein  YP_001170493  normal  0.0471416  normal  0.110764  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>