63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4284 on replicon NC_009431
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3767  hypothetical protein  99.48 
 
 		 387 bp  743    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4284    100 
 
 		 980 bp  1943    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.500601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1814  integrase catalytic subunit  91.27 
 
 		 960 bp  539  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0485004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0053  integrase catalytic subunit  91.27 
 
 		 960 bp  539  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3474  hypothetical protein  91.27 
 
 		 621 bp  539  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.180544 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3743  hypothetical protein  91.27 
 
 		 960 bp  539  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3839  hypothetical protein  91.27 
 
 		 960 bp  539  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0595051 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3472  hypothetical protein  88.75 
 
 		 513 bp  262  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.119399 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5325  hypothetical protein  84.81 
 
 		 594 bp  176  7.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.969651  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1952    88.2 
 
 		 2579 bp  168  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1157    82.61 
 
 		 396 bp  139  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2917  integrase, catalytic region  81.93 
 
 		 966 bp  131  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2291  Integrase catalytic region  87.5 
 
 		 1047 bp  127  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.152349 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0252  transposase (class I)  83.16 
 
 		 252 bp  127  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3258  Integrase catalytic region  87.5 
 
 		 993 bp  127  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2747    87.5 
 
 		 1062 bp  127  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0487379 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2721  Integrase catalytic region  87.5 
 
 		 993 bp  127  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.562875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2676    87.5 
 
 		 672 bp  127  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.394302  normal  0.345661 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0676    87.5 
 
 		 1031 bp  127  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000495528 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0692  Integrase catalytic region  87.5 
 
 		 993 bp  127  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229145  normal  0.133209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1668  Integrase catalytic region  87.5 
 
 		 993 bp  127  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.412192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1875  Integrase catalytic region  87.5 
 
 		 1068 bp  127  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0702445 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2422  Integrase catalytic region  87.5 
 
 		 993 bp  127  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5447  Integrase catalytic region  90.7 
 
 		 834 bp  107  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.681137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2557  integrase, catalytic region  81.34 
 
 		 567 bp  105  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.805017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0366  integrase, catalytic region  90.36 
 
 		 990 bp  101  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2918  integrase, catalytic region  90.36 
 
 		 951 bp  101  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1296  integrase, catalytic region  90.36 
 
 		 951 bp  101  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1717  integrase, catalytic region  90.36 
 
 		 951 bp  101  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0171721  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2225  integrase, catalytic region  90.36 
 
 		 951 bp  101  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00213091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2818  integrase, catalytic region  90.36 
 
 		 951 bp  101  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2839  integrase, catalytic region  90.36 
 
 		 462 bp  101  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2850  integrase, catalytic region  90.36 
 
 		 990 bp  101  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1293  integrase, catalytic region  90.36 
 
 		 990 bp  101  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345302  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1097  integrase, catalytic region  90.36 
 
 		 951 bp  101  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495543  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2899  integrase, catalytic region  90.36 
 
 		 984 bp  101  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0219368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0838  integrase, catalytic region  90.36 
 
 		 861 bp  101  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204021  hitchhiker  0.00436144 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0481  integrase, catalytic region  90.36 
 
 		 951 bp  101  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0308  integrase, catalytic region  90.36 
 
 		 951 bp  101  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  90.91 
 
 		 1392 bp  83.8  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0142  integrase, catalytic region  86.52 
 
 		 336 bp  81.8  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25530  Integrase, catalytic domain-containing protein  97.73 
 
 		 798 bp  79.8  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2536    80.95 
 
 		 950 bp  79.8  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0443  integrase, catalytic region  94 
 
 		 252 bp  75.8  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.818125 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0122  integrase, catalytic region  81.12 
 
 		 666 bp  69.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1128  integrase catalytic subunit  92.16 
 
 		 843 bp  69.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7134  Integrase catalytic core  85.37 
 
 		 912 bp  67.9  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1435    91.84 
 
 		 590 bp  65.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33450  integrase, catalytic core  93.18 
 
 		 558 bp  63.9  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2999    93.18 
 
 		 405 bp  63.9  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.932196  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1101  putative transposase  80.74 
 
 		 162 bp  61.9  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.32913 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1959    94.74 
 
 		 336 bp  60  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1960    94.74 
 
 		 519 bp  60  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0610    94.74 
 
 		 397 bp  60  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1515  integrase catalytic region  83.53 
 
 		 537 bp  58  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7987    87.5 
 
 		 927 bp  56  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4969    87.27 
 
 		 114 bp  54  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0537521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2781    83.78 
 
 		 579 bp  52  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0781  transposase (class I)  88 
 
 		 366 bp  52  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.550975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5272    87.04 
 
 		 630 bp  52  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1438    96.67 
 
 		 312 bp  52  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2630    93.75 
 
 		 225 bp  48.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.764838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5165    96.43 
 
 		 513 bp  48.1  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190666  normal  0.220641 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>