161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7134 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7134  Integrase catalytic core  100 
 
 		 303 aa  633    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1293  integrase, catalytic region  82.96 
 
 		 329 aa  384  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345302  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0308  integrase, catalytic region  82.96 
 
 		 316 aa  382  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0366  integrase, catalytic region  82.51 
 
 		 329 aa  383  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0481  integrase, catalytic region  82.96 
 
 		 316 aa  382  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1097  integrase, catalytic region  82.96 
 
 		 316 aa  382  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495543  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1296  integrase, catalytic region  82.96 
 
 		 316 aa  382  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1717  integrase, catalytic region  82.96 
 
 		 316 aa  382  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0171721  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2818  integrase, catalytic region  82.96 
 
 		 316 aa  382  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2899  integrase, catalytic region  82.96 
 
 		 327 aa  382  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0219368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2918  integrase, catalytic region  82.96 
 
 		 316 aa  382  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2225  integrase, catalytic region  82.51 
 
 		 316 aa  380  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00213091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2917  integrase, catalytic region  73.71 
 
 		 321 aa  340  2e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_002978  WD0176  transposase, putative  70.85 
 
 		 320 aa  335  7.999999999999999e-91  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0838  integrase, catalytic region  82.26 
 
 		 286 aa  318  7e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204021  hitchhiker  0.00436144 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2850  integrase, catalytic region  82.26 
 
 		 329 aa  318  9e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0053  integrase catalytic subunit  67.26 
 
 		 319 aa  308  9e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1814  integrase catalytic subunit  67.26 
 
 		 319 aa  308  9e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0485004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3743  hypothetical protein  67.26 
 
 		 319 aa  308  9e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3839  hypothetical protein  67.26 
 
 		 319 aa  308  9e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0595051 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5447  Integrase catalytic region  74.87 
 
 		 277 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.681137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3258  Integrase catalytic region  67.09 
 
 		 330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1668  Integrase catalytic region  67.09 
 
 		 330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.412192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2422  Integrase catalytic region  67.09 
 
 		 330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0692  Integrase catalytic region  67.09 
 
 		 330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229145  normal  0.133209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2721  Integrase catalytic region  67.09 
 
 		 330 aa  303  3.0000000000000004e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.562875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  63.75 
 
 		 463 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1875  Integrase catalytic region  66.67 
 
 		 355 aa  300  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0702445 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2291  Integrase catalytic region  66.67 
 
 		 348 aa  299  4e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.152349 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0122  integrase, catalytic region  72.77 
 
 		 221 aa  293  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3474  hypothetical protein  72.13 
 
 		 206 aa  278  7e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.180544 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1273  hypothetical protein  58.04 
 
 		 314 aa  272  7e-72  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0999856 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1176  hypothetical protein  58.04 
 
 		 284 aa  268  1e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.118975 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0554  hypothetical protein  58.04 
 
 		 314 aa  267  1e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000279647 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0952  hypothetical protein  57.27 
 
 		 320 aa  263  2e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0224  integrase catalytic subunit  60.09 
 
 		 316 aa  253  3e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1054  integrase catalytic subunit  60.09 
 
 		 316 aa  253  3e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1353  integrase catalytic subunit  60.09 
 
 		 316 aa  253  3e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.4232  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1767  integrase catalytic subunit  60.09 
 
 		 316 aa  253  3e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1780  integrase catalytic subunit  60.09 
 
 		 316 aa  253  3e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0228632  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2400  integrase catalytic subunit  60.09 
 
 		 316 aa  253  3e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.61618  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25530  Integrase, catalytic domain-containing protein  55.75 
 
 		 265 aa  248  6e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3372  integrase catalytic region  56.52 
 
 		 321 aa  247  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2557  integrase, catalytic region  73.75 
 
 		 188 aa  243  3.9999999999999997e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.805017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1515  integrase catalytic region  68.9 
 
 		 178 aa  231  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0529  integrase, catalytic core  58.2 
 
 		 259 aa  207  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0142  integrase, catalytic region  81.82 
 
 		 111 aa  188  8e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1251  integrase catalytic subunit  39.47 
 
 		 333 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1280  integrase catalytic subunit  39.47 
 
 		 463 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.722165  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1301  integrase catalytic subunit  39.47 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4152  transposase ISRme5 (copy d)  39.47 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29962  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1631  Integrase catalytic region  38.66 
 
 		 329 aa  142  6e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2660  integrase catalytic subunit  42.31 
 
 		 323 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.271661 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3709  Integrase catalytic region  36.47 
 
 		 325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.108327 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0344  Integrase catalytic region  36.47 
 
 		 325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000845152  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1401  integrase catalytic subunit  40.17 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1424  integrase catalytic subunit  40.17 
 
 		 323 aa  129  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2535  integrase catalytic subunit  39.48 
 
 		 323 aa  126  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0021  putative integrase  37.66 
 
 		 332 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468061 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0793  putative integrase  36.03 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.638394 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0917  transposase  33.77 
 
 		 327 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1378  putative integrase  33.77 
 
 		 325 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1782  putative integrase  33.77 
 
 		 325 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2179  transposase  34.22 
 
 		 325 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2194  putative transposase  34.22 
 
 		 329 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2250  putative transposase  33.77 
 
 		 333 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2493  transposase, putative  34.22 
 
 		 325 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0120  hypothetical protein  33.77 
 
 		 497 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2728  putative transposase  34.22 
 
 		 441 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1128  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 280 aa  119  9e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7791  Integrase catalytic region  32.14 
 
 		 323 aa  113  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.562755  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2839  integrase, catalytic region  83.33 
 
 		 153 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5037  Integrase catalytic region  32.02 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01280  transposase  39.36 
 
 		 216 aa  97.1  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0995831  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00518  transposase  39.36 
 
 		 216 aa  97.1  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2447  integrase catalytic subunit  40.3 
 
 		 238 aa  89.7  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4022  Integrase catalytic region  28.83 
 
 		 330 aa  89  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500717  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1371  Fis family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 179 aa  87.8  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0199142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3549  integrase catalytic region  44.66 
 
 		 216 aa  87.8  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.032093 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2839  transcriptional regulator, putative  42.62 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1327  transcriptional regulator, putative  30.8 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2732  transcriptional regulator, putative  42.62 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2665  transcriptional regulator, putative  42.62 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1603  transcriptional regulator, putative  41.8 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1424  transcriptional regulator, putative  27.48 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3201  transcriptional regulator, putative  27.23 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1276  hypothetical protein  64.52 
 
 		 114 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2906  transcriptional regulator, putative  39.67 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1222  transcriptional regulator, putative  24.8 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1454  transcriptional regulator, putative  37.82 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0697104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1420  transcriptional regulator, putative  37.82 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2928  transcriptional regulator, putative  37.82 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1426  transcriptional regulator, putative  37.82 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8690  putative integrase  33.07 
 
 		 157 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2664  transcriptional regulator, putative  26.34 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2626  transcriptional regulator, putative  33.13 
 
 		 336 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0458  integrase catalytic subunit  30.14 
 
 		 338 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33450  integrase, catalytic core  50 
 
 		 185 aa  71.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1116  transcriptional regulator, putative  39.17 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0733  transposase, putative  32.68 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>