50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1276 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1276  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  236  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5447  Integrase catalytic region  70.77 
 
 		 277 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.681137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7134  Integrase catalytic core  64.52 
 
 		 303 aa  80.5  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0366  integrase, catalytic region  62.9 
 
 		 329 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2918  integrase, catalytic region  62.9 
 
 		 316 aa  78.6  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1293  integrase, catalytic region  62.9 
 
 		 329 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345302  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2899  integrase, catalytic region  62.9 
 
 		 327 aa  78.6  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0219368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2850  integrase, catalytic region  62.9 
 
 		 329 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0308  integrase, catalytic region  62.9 
 
 		 316 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2818  integrase, catalytic region  62.9 
 
 		 316 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1717  integrase, catalytic region  62.9 
 
 		 316 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0171721  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1296  integrase, catalytic region  62.9 
 
 		 316 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2225  integrase, catalytic region  62.9 
 
 		 316 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00213091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1097  integrase, catalytic region  62.9 
 
 		 316 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495543  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0838  integrase, catalytic region  62.9 
 
 		 286 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204021  hitchhiker  0.00436144 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0481  integrase, catalytic region  62.9 
 
 		 316 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791017  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0176  transposase, putative  60.32 
 
 		 320 aa  78.2  0.00000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  62.9 
 
 		 463 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0122  integrase, catalytic region  62.9 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2917  integrase, catalytic region  61.29 
 
 		 321 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2422  Integrase catalytic region  59.68 
 
 		 330 aa  71.2  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1668  Integrase catalytic region  59.68 
 
 		 330 aa  71.2  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.412192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0692  Integrase catalytic region  59.68 
 
 		 330 aa  71.2  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229145  normal  0.133209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2721  Integrase catalytic region  59.68 
 
 		 330 aa  71.2  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.562875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0554  hypothetical protein  59.02 
 
 		 314 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000279647 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3258  Integrase catalytic region  59.68 
 
 		 330 aa  71.2  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1176  hypothetical protein  44.57 
 
 		 284 aa  70.5  0.000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.118975 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0952  hypothetical protein  54.84 
 
 		 320 aa  70.1  0.000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2291  Integrase catalytic region  59.02 
 
 		 348 aa  68.6  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.152349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1875  Integrase catalytic region  59.02 
 
 		 355 aa  68.6  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0702445 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3743  hypothetical protein  52.38 
 
 		 319 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3839  hypothetical protein  52.38 
 
 		 319 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0595051 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1814  integrase catalytic subunit  52.38 
 
 		 319 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0485004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0053  integrase catalytic subunit  52.38 
 
 		 319 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3474  hypothetical protein  52.38 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.180544 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1273  hypothetical protein  54.84 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0999856 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0529  integrase, catalytic core  50 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0142  integrase, catalytic region  77.14 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0224  integrase catalytic subunit  46.77 
 
 		 316 aa  58.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1054  integrase catalytic subunit  46.77 
 
 		 316 aa  58.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2400  integrase catalytic subunit  46.77 
 
 		 316 aa  58.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.61618  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1780  integrase catalytic subunit  46.77 
 
 		 316 aa  58.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0228632  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1767  integrase catalytic subunit  46.77 
 
 		 316 aa  58.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1353  integrase catalytic subunit  46.77 
 
 		 316 aa  58.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.4232  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1128  integrase catalytic subunit  41.79 
 
 		 280 aa  57.4  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25530  Integrase, catalytic domain-containing protein  42.86 
 
 		 265 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3372  integrase catalytic region  41.94 
 
 		 321 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1515  integrase catalytic region  64.71 
 
 		 178 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2557  integrase, catalytic region  70.37 
 
 		 188 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.805017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3549  integrase catalytic region  44.44 
 
 		 216 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.032093 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>