More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3372 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3372  integrase catalytic region  100 
 
 
321 aa  665    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0308  integrase, catalytic region  56.83 
 
 
316 aa  374  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0481  integrase, catalytic region  56.83 
 
 
316 aa  374  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791017  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1097  integrase, catalytic region  56.83 
 
 
316 aa  374  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495543  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1296  integrase, catalytic region  56.83 
 
 
316 aa  374  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1717  integrase, catalytic region  56.83 
 
 
316 aa  374  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0171721  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2818  integrase, catalytic region  56.83 
 
 
316 aa  374  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2899  integrase, catalytic region  57.05 
 
 
327 aa  375  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0219368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2917  integrase, catalytic region  56.74 
 
 
321 aa  377  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2918  integrase, catalytic region  57.05 
 
 
316 aa  374  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2225  integrase, catalytic region  56.52 
 
 
316 aa  373  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00213091  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0176  transposase, putative  53.73 
 
 
320 aa  360  2e-98  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1128  integrase catalytic subunit  83.94 
 
 
280 aa  358  8e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1054  integrase catalytic subunit  54.21 
 
 
316 aa  358  8e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161609  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1353  integrase catalytic subunit  54.21 
 
 
316 aa  358  8e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.4232  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1780  integrase catalytic subunit  54.21 
 
 
316 aa  358  8e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0228632  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2400  integrase catalytic subunit  54.21 
 
 
316 aa  358  8e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.61618  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0224  integrase catalytic subunit  54.23 
 
 
316 aa  357  9.999999999999999e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1767  integrase catalytic subunit  54.23 
 
 
316 aa  357  9.999999999999999e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1814  integrase catalytic subunit  54.86 
 
 
319 aa  351  8e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0485004  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3743  hypothetical protein  54.86 
 
 
319 aa  351  8e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3839  hypothetical protein  54.86 
 
 
319 aa  351  8e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0595051 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0053  integrase catalytic subunit  54.86 
 
 
319 aa  351  8e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2721  Integrase catalytic region  55.18 
 
 
330 aa  348  1e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.562875  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2422  Integrase catalytic region  54.85 
 
 
330 aa  347  2e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3258  Integrase catalytic region  54.85 
 
 
330 aa  345  5e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0692  Integrase catalytic region  55.05 
 
 
330 aa  345  6e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229145  normal  0.133209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1668  Integrase catalytic region  55.05 
 
 
330 aa  345  6e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.412192  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  52.4 
 
 
463 aa  344  1e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2291  Integrase catalytic region  53.94 
 
 
348 aa  342  5e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.152349 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5447  Integrase catalytic region  60.84 
 
 
277 aa  342  5e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.681137  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1875  Integrase catalytic region  54.55 
 
 
355 aa  342  7e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0702445 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1293  integrase, catalytic region  56.07 
 
 
329 aa  340  1e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345302  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0366  integrase, catalytic region  55.74 
 
 
329 aa  338  5e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0952  hypothetical protein  48.71 
 
 
320 aa  310  2.9999999999999997e-83  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0554  hypothetical protein  49.03 
 
 
314 aa  303  2.0000000000000002e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000279647 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1273  hypothetical protein  49.18 
 
 
314 aa  301  9e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0999856 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25530  Integrase, catalytic domain-containing protein  53.51 
 
 
265 aa  286  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0838  integrase, catalytic region  56.47 
 
 
286 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204021  hitchhiker  0.00436144 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2850  integrase, catalytic region  56.47 
 
 
329 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1176  hypothetical protein  49.65 
 
 
284 aa  282  4.0000000000000003e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.118975 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0529  integrase, catalytic core  54.51 
 
 
259 aa  257  2e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7134  Integrase catalytic core  56.52 
 
 
303 aa  247  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0122  integrase, catalytic region  56.16 
 
 
221 aa  228  8e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3549  integrase catalytic region  55.62 
 
 
216 aa  219  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.032093 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3474  hypothetical protein  52.94 
 
 
206 aa  209  7e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.180544 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1251  integrase catalytic subunit  40.38 
 
 
333 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1301  integrase catalytic subunit  40.97 
 
 
321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4152  transposase ISRme5 (copy d)  40.97 
 
 
321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29962  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1280  integrase catalytic subunit  40.97 
 
 
463 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.722165  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0344  Integrase catalytic region  40.6 
 
 
325 aa  192  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000845152  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3709  Integrase catalytic region  40.54 
 
 
325 aa  191  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.108327 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2660  integrase catalytic subunit  39.75 
 
 
323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.271661 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1401  integrase catalytic subunit  38.12 
 
 
323 aa  186  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1424  integrase catalytic subunit  38.12 
 
 
323 aa  186  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1631  Integrase catalytic region  39.14 
 
 
329 aa  186  6e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1515  integrase catalytic region  58.79 
 
 
178 aa  185  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60322  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0917  transposase  38.92 
 
 
327 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2179  transposase  38.92 
 
 
325 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2194  putative transposase  38.75 
 
 
329 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2250  putative transposase  38.92 
 
 
333 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2493  transposase, putative  38.92 
 
 
325 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2728  putative transposase  38.92 
 
 
441 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0120  hypothetical protein  38.92 
 
 
497 aa  181  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33450  integrase, catalytic core  71.3 
 
 
185 aa  180  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1378  putative integrase  38.61 
 
 
325 aa  179  4.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1782  putative integrase  38.61 
 
 
325 aa  179  4.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2557  integrase, catalytic region  57.42 
 
 
188 aa  179  4.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.805017  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2535  integrase catalytic subunit  37.19 
 
 
323 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2839  integrase, catalytic region  53.38 
 
 
153 aa  168  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0793  putative integrase  35.62 
 
 
343 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.638394 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0021  putative integrase  35.62 
 
 
332 aa  162  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468061 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7791  Integrase catalytic region  34.67 
 
 
323 aa  156  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.562755  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3472  hypothetical protein  51.47 
 
 
170 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.119399 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5037  Integrase catalytic region  34.84 
 
 
274 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0142  integrase, catalytic region  60.36 
 
 
111 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4022  Integrase catalytic region  32.33 
 
 
330 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500717  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01280  transposase  37.96 
 
 
216 aa  116  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0995831  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00518  transposase  37.96 
 
 
216 aa  116  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2447  integrase catalytic subunit  32.38 
 
 
238 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0443  integrase, catalytic region  53.16 
 
 
83 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.818125 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3767  hypothetical protein  46.73 
 
 
128 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1371  Fis family transcriptional regulator  40.36 
 
 
179 aa  92  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0199142  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2665  transcriptional regulator, putative  28.07 
 
 
289 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1603  transcriptional regulator, putative  27.83 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8690  putative integrase  39.71 
 
 
157 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2732  transcriptional regulator, putative  27.63 
 
 
289 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2839  transcriptional regulator, putative  27.63 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1327  transcriptional regulator, putative  28.07 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2626  transcriptional regulator, putative  36.89 
 
 
336 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0733  transposase, putative  29.82 
 
 
229 aa  78.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2664  transcriptional regulator, putative  40.91 
 
 
284 aa  79  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1222  transcriptional regulator, putative  35.48 
 
 
293 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2906  transcriptional regulator, putative  36.97 
 
 
288 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3352  integrase catalytic subunit  28.52 
 
 
315 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3658  integrase catalytic subunit  28.52 
 
 
315 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4025  integrase catalytic subunit  28.52 
 
 
315 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.404893 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4445  integrase catalytic subunit  28.52 
 
 
315 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.730618 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4504  integrase catalytic subunit  28.52 
 
 
315 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.23514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4598  integrase catalytic subunit  28.52 
 
 
315 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>