More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2493 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0120  hypothetical protein  100 
 
 		 497 aa  674    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0917  transposase  100 
 
 		 327 aa  674    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1378  putative integrase  99.69 
 
 		 325 aa  672    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1782  putative integrase  99.38 
 
 		 325 aa  672    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2179  transposase  99.69 
 
 		 325 aa  674    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2194  putative transposase  100 
 
 		 329 aa  676    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2250  putative transposase  100 
 
 		 333 aa  674    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2493  transposase, putative  100 
 
 		 325 aa  676    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2728  putative transposase  99.69 
 
 		 441 aa  676    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3709  Integrase catalytic region  82.1 
 
 		 325 aa  544  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.108327 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0344  Integrase catalytic region  81.85 
 
 		 325 aa  545  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000845152  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1631  Integrase catalytic region  58.66 
 
 		 329 aa  394  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1301  integrase catalytic subunit  58.41 
 
 		 321 aa  374  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1251  integrase catalytic subunit  58.41 
 
 		 333 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1280  integrase catalytic subunit  58.41 
 
 		 463 aa  373  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.722165  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4152  transposase ISRme5 (copy d)  58.59 
 
 		 321 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29962  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1424  integrase catalytic subunit  57.1 
 
 		 323 aa  361  8e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1401  integrase catalytic subunit  56.62 
 
 		 323 aa  358  5e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2535  integrase catalytic subunit  56.31 
 
 		 323 aa  356  3.9999999999999996e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2660  integrase catalytic subunit  56.31 
 
 		 323 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.271661 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2447  integrase catalytic subunit  57.87 
 
 		 238 aa  246  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1371  Fis family transcriptional regulator  67.46 
 
 		 179 aa  220  3e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0199142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01280  transposase  57.92 
 
 		 216 aa  218  8.999999999999998e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0995831  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00518  transposase  57.92 
 
 		 216 aa  218  8.999999999999998e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3372  integrase catalytic region  38.75 
 
 		 321 aa  202  7e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0733  transposase, putative  50.23 
 
 		 229 aa  197  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1054  integrase catalytic subunit  33.64 
 
 		 316 aa  179  7e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1353  integrase catalytic subunit  33.64 
 
 		 316 aa  179  7e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.4232  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1780  integrase catalytic subunit  33.64 
 
 		 316 aa  179  7e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0228632  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2400  integrase catalytic subunit  33.64 
 
 		 316 aa  179  7e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.61618  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0224  integrase catalytic subunit  33.64 
 
 		 316 aa  178  9e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1767  integrase catalytic subunit  33.64 
 
 		 316 aa  178  9e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7791  Integrase catalytic region  37.74 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.562755  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0554  hypothetical protein  37.58 
 
 		 314 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000279647 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0952  hypothetical protein  35.87 
 
 		 320 aa  171  1e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0366  integrase, catalytic region  36.84 
 
 		 329 aa  171  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1293  integrase, catalytic region  36.84 
 
 		 329 aa  171  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345302  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2899  integrase, catalytic region  37.28 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0219368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0308  integrase, catalytic region  36.84 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0481  integrase, catalytic region  36.84 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1097  integrase, catalytic region  36.84 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495543  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1296  integrase, catalytic region  36.84 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1717  integrase, catalytic region  36.84 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0171721  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2225  integrase, catalytic region  36.84 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00213091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2818  integrase, catalytic region  36.84 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2918  integrase, catalytic region  36.84 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2721  Integrase catalytic region  33.82 
 
 		 330 aa  170  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.562875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3258  Integrase catalytic region  34.73 
 
 		 330 aa  169  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1668  Integrase catalytic region  34.73 
 
 		 330 aa  169  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.412192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0692  Integrase catalytic region  34.73 
 
 		 330 aa  169  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229145  normal  0.133209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2422  Integrase catalytic region  33.43 
 
 		 330 aa  169  7e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1273  hypothetical protein  37.01 
 
 		 314 aa  169  8e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0999856 
 
 
-
 
NC_002978  WD0176  transposase, putative  34.37 
 
 		 320 aa  168  1e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2917  integrase, catalytic region  35.92 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1176  hypothetical protein  37.81 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.118975 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5037  Integrase catalytic region  38.33 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2291  Integrase catalytic region  34.43 
 
 		 348 aa  166  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.152349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1875  Integrase catalytic region  34.43 
 
 		 355 aa  166  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0702445 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1814  integrase catalytic subunit  35.44 
 
 		 319 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0485004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0053  integrase catalytic subunit  35.44 
 
 		 319 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3839  hypothetical protein  35.44 
 
 		 319 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0595051 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3743  hypothetical protein  35.44 
 
 		 319 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  34.6 
 
 		 463 aa  161  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0021  putative integrase  33.99 
 
 		 332 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468061 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0793  putative integrase  33.99 
 
 		 343 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.638394 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1424  transcriptional regulator, putative  40.43 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2664  transcriptional regulator, putative  39.15 
 
 		 284 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4022  Integrase catalytic region  34.14 
 
 		 330 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500717  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1222  transcriptional regulator, putative  36.08 
 
 		 293 aa  155  7e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2906  transcriptional regulator, putative  37.61 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3201  transcriptional regulator, putative  38.43 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3105  hypothetical protein  38.87 
 
 		 290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.674192  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2626  transcriptional regulator, putative  38.72 
 
 		 336 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1603  transcriptional regulator, putative  38.96 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2732  transcriptional regulator, putative  38.96 
 
 		 289 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2839  transcriptional regulator, putative  38.89 
 
 		 289 aa  150  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25530  Integrase, catalytic domain-containing protein  36.63 
 
 		 265 aa  149  8e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2665  transcriptional regulator, putative  38.53 
 
 		 289 aa  149  9e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2928  transcriptional regulator, putative  37.45 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1426  transcriptional regulator, putative  37.45 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1454  transcriptional regulator, putative  37.45 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0697104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1420  transcriptional regulator, putative  37.87 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1327  transcriptional regulator, putative  35.98 
 
 		 289 aa  146  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7134  Integrase catalytic core  35.78 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5447  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.681137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1116  transcriptional regulator, putative  36.44 
 
 		 272 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0838  integrase, catalytic region  34.5 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204021  hitchhiker  0.00436144 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0529  integrase, catalytic core  34.42 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2850  integrase, catalytic region  34.5 
 
 		 329 aa  134  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1683  hypothetical protein  36.33 
 
 		 275 aa  132  7.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3474  hypothetical protein  38.12 
 
 		 206 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.180544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0122  integrase, catalytic region  36.36 
 
 		 221 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1128  integrase catalytic subunit  33.15 
 
 		 280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1518  hypothetical protein  54.26 
 
 		 101 aa  105  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2980  hypothetical protein  28.09 
 
 		 274 aa  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653613  normal  0.40333 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2557  integrase, catalytic region  37.11 
 
 		 188 aa  98.2  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.805017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1515  integrase catalytic region  37.21 
 
 		 178 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8690  putative integrase  38.16 
 
 		 157 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3549  integrase catalytic region  31.36 
 
 		 216 aa  85.1  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.032093 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6859  integrase catalytic region  28.48 
 
 		 316 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0984063  normal  0.439407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>