34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0781 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0781  transposase (class I)  100 
 
 		 121 aa  250  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.550975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2917  integrase, catalytic region  43.64 
 
 		 321 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7134  Integrase catalytic core  36.36 
 
 		 303 aa  64.3  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0366  integrase, catalytic region  36.94 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2225  integrase, catalytic region  35.45 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00213091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0308  integrase, catalytic region  35.45 
 
 		 316 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2918  integrase, catalytic region  35.45 
 
 		 316 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2899  integrase, catalytic region  35.45 
 
 		 327 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0219368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2818  integrase, catalytic region  35.45 
 
 		 316 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1296  integrase, catalytic region  35.45 
 
 		 316 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1293  integrase, catalytic region  36.94 
 
 		 329 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345302  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1097  integrase, catalytic region  35.45 
 
 		 316 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495543  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0481  integrase, catalytic region  35.45 
 
 		 316 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1717  integrase, catalytic region  35.45 
 
 		 316 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0171721  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0053  integrase catalytic subunit  34 
 
 		 319 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1814  integrase catalytic subunit  34 
 
 		 319 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0485004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3743  hypothetical protein  34 
 
 		 319 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3839  hypothetical protein  34 
 
 		 319 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0595051 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3474  hypothetical protein  34 
 
 		 206 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.180544 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0838  integrase, catalytic region  36.89 
 
 		 286 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204021  hitchhiker  0.00436144 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2850  integrase, catalytic region  35.24 
 
 		 329 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2557  integrase, catalytic region  33.64 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.805017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  36.96 
 
 		 463 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0176  transposase, putative  35.23 
 
 		 320 aa  47.8  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0122  integrase, catalytic region  35.96 
 
 		 221 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5447  Integrase catalytic region  30.1 
 
 		 277 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.681137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0142  integrase, catalytic region  32.58 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0692  Integrase catalytic region  30.77 
 
 		 330 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229145  normal  0.133209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1668  Integrase catalytic region  30.77 
 
 		 330 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.412192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2422  Integrase catalytic region  30.77 
 
 		 330 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2721  Integrase catalytic region  30.77 
 
 		 330 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.562875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3258  Integrase catalytic region  30.77 
 
 		 330 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1515  integrase catalytic region  28.85 
 
 		 178 aa  40.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1273  hypothetical protein  28.83 
 
 		 314 aa  40  0.01  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0999856 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>