More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4280 on replicon NC_009431
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009431  Rsph17025_4280  hypothetical protein  100 
 
 		 506 aa  973    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3794  hypothetical protein  38.76 
 
 		 491 aa  260  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.516461  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28160  hypothetical protein  34.64 
 
 		 328 aa  151  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3046  hypothetical protein  38.27 
 
 		 319 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0326711  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3997  hypothetical protein  33.53 
 
 		 333 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.937914  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1836  hypothetical protein  33.53 
 
 		 333 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000267985 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2599  hypothetical protein  32.33 
 
 		 327 aa  147  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.733501  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1665  hypothetical protein  35.22 
 
 		 332 aa  147  5e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3579  hypothetical protein  31.61 
 
 		 333 aa  147  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3172  hypothetical protein  31.42 
 
 		 333 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.102896  normal  0.287439 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30360  hypothetical protein  32.33 
 
 		 327 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3401  hypothetical protein  33.84 
 
 		 334 aa  146  9e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.51245 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3342  glycosyl transferase, putative  31.61 
 
 		 333 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.534413  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3602  hypothetical protein  33.23 
 
 		 333 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1670  hypothetical protein  36.2 
 
 		 323 aa  142  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0478591  normal  0.302071 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1161  hypothetical protein  30.77 
 
 		 327 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.18822  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2812  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 		 337 aa  123  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2381  hypothetical protein  31.16 
 
 		 331 aa  121  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148789  normal  0.0161209 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2530  hypothetical protein  27.16 
 
 		 361 aa  109  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001604  glycosyl transferase family 3  31.13 
 
 		 317 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05584  hypothetical protein  30.19 
 
 		 317 aa  103  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03656  hypothetical protein  28.53 
 
 		 331 aa  101  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0848  hypothetical protein  28.84 
 
 		 334 aa  91.7  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1873  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 		 376 aa  90.5  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.597248  hitchhiker  0.00000310641 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1809  glycosyl transferase family protein  31.69 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2358  Anthranilate phosphoribosyltransferase  34.01 
 
 		 346 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0253  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 		 336 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.186746 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0017  LysR family transcriptional regulator  58.23 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0908  anthranilate phosphoribosyltransferase  26.9 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000806391  hitchhiker  0.0000000035937 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2882  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 		 304 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3501  LysR family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 301 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.356591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0234  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1507  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 		 392 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0378  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1046  anthranilate phosphoribosyltransferase  32.24 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3531  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 		 301 aa  73.2  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4870  LysR family transcriptional regulator  54.65 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.01712 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2085  LysR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0073681  normal  0.210389 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4363  LysR family transcriptional regulator  51.76 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4003  LysR family transcriptional regulator  51.76 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3409  LysR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155989  normal  0.11434 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3520  LysR family transcriptional regulator  51.76 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.677616 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3382  LysR family transcriptional regulator  55.13 
 
 		 295 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3916  LysR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 323 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.993386  normal  0.61928 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0997  transcriptional regulator, LysR family  51.95 
 
 		 302 aa  68.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1403  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.508618 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1528  LysR family transcriptional regulator  55.13 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1253  anthranilate phosphoribosyltransferase  26.67 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1626  LysR family transcriptional regulator  51.39 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.11884 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1859  LysR family transcriptional regulator  51.39 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0738691 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0274  glycosyl transferase family protein  29.9 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.226663 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1659  LysR family transcriptional regulator  55.13 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.337839  normal  0.66809 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3422  LysR family transcriptional regulator  56.41 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1273  anthranilate phosphoribosyltransferase  26.78 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1483  anthranilate phosphoribosyltransferase  26.78 
 
 		 341 aa  66.2  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1811  transcriptional regulator, LysR family  55.13 
 
 		 297 aa  66.6  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.193528  hitchhiker  0.00243987 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2417  LysR family transcriptional regulator  51.28 
 
 		 306 aa  66.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000194873  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0978  LysR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 298 aa  65.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024266 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2005  transcriptional regulator, LysR family  53.85 
 
 		 298 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.140319 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29911  hypothetical protein  29.35 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1567  anthranilate phosphoribosyltransferase  25.96 
 
 		 339 aa  65.1  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.315366  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0327  glycosyl transferase family protein  30.15 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  56.45 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6857  LysR family transcriptional regulator  49.35 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.561705  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2247  LysR family transcriptional regulator  50.65 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4332  hypothetical protein  28.93 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3329  LysR family transcriptional regulator  53.95 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4401  anthranilate phosphoribosyltransferase  30.49 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0950615 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4833  LysR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.939705 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2331  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0852797  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1755  LysR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2842  glycosyl transferase family protein  30.15 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1003  glycosyl transferase family protein  25.4 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4218  transcriptional regulator, LysR family  51.35 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2767  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.645356  normal  0.0391357 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00078  leucine transcriptional activator  44.29 
 
 		 314 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3523  transcriptional regulator, LysR family  44.29 
 
 		 314 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2321  putative transcriptional regulator  46.75 
 
 		 319 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3581  leucine transcriptional activator  44.29 
 
 		 314 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.313803  hitchhiker  0.000946626 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1290  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 		 321 aa  63.2  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.127601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0867  glycosyl transferase family protein  27.51 
 
 		 320 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0078  leucine transcriptional activator  44.29 
 
 		 314 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0081  leucine transcriptional activator  44.29 
 
 		 314 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.669516  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0081  leucine transcriptional activator  44.29 
 
 		 314 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0623  leucine transcriptional activator  46.27 
 
 		 314 aa  62.8  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0252202 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0732  anthranilate phosphoribosyltransferase  26.36 
 
 		 352 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2352  transcriptional regulator, LysR family protein  50.72 
 
 		 314 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000117377  decreased coverage  0.00000015924 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0949  glycosyl transferase family protein  27.51 
 
 		 320 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0069  leucine transcriptional activator  44.29 
 
 		 314 aa  62.8  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0399  LysR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 319 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0504  anthranilate phosphoribosyltransferase  33.15 
 
 		 349 aa  62.8  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00077  hypothetical protein  44.29 
 
 		 314 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_28937  anthranilate phosphoribosyltransferase  28.88 
 
 		 357 aa  63.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0103177  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3138  transcriptional regulator, LysR family protein  53.97 
 
 		 316 aa  62.8  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27318  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14230  predicted protein  28.88 
 
 		 357 aa  63.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.105496  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2814  anthranilate phosphoribosyltransferase  30.6 
 
 		 333 aa  62.8  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1340  anthranilate phosphoribosyltransferase  30.67 
 
 		 339 aa  62.8  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.728969  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0124  leucine transcriptional activator  44.29 
 
 		 314 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.442889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3148  LysR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 309 aa  62  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.774562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3403  leucine transcriptional activator  48.39 
 
 		 318 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>