More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_28160 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_28160  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  662    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3401  hypothetical protein  74.39 
 
 
334 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.51245 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3342  glycosyl transferase, putative  74.01 
 
 
333 aa  502  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.534413  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2599  hypothetical protein  75.23 
 
 
327 aa  502  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.733501  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2381  hypothetical protein  75.61 
 
 
331 aa  499  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148789  normal  0.0161209 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30360  hypothetical protein  75.54 
 
 
327 aa  500  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3172  hypothetical protein  73.23 
 
 
333 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.102896  normal  0.287439 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3602  hypothetical protein  74.31 
 
 
333 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1836  hypothetical protein  73.7 
 
 
333 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000267985 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3997  hypothetical protein  73.7 
 
 
333 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.937914  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3579  hypothetical protein  72.48 
 
 
333 aa  488  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1665  hypothetical protein  50.9 
 
 
332 aa  285  5e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2812  glycosyl transferase family protein  40.56 
 
 
337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2530  hypothetical protein  39.3 
 
 
361 aa  215  8e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1161  hypothetical protein  37.23 
 
 
327 aa  209  7e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.18822  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03656  hypothetical protein  36.02 
 
 
331 aa  205  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1670  hypothetical protein  37.81 
 
 
323 aa  185  8e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0478591  normal  0.302071 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05584  hypothetical protein  33.54 
 
 
317 aa  176  4e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001604  glycosyl transferase family 3  33.97 
 
 
317 aa  176  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3046  hypothetical protein  40.07 
 
 
319 aa  174  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0326711  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4280  hypothetical protein  34.64 
 
 
506 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1507  glycosyl transferase family protein  35.89 
 
 
392 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0848  hypothetical protein  33.46 
 
 
334 aa  143  4e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2882  glycosyl transferase family protein  33.74 
 
 
304 aa  136  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1873  glycosyl transferase family protein  32.93 
 
 
376 aa  135  8e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.597248  hitchhiker  0.00000310641 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3531  glycosyl transferase family protein  30.32 
 
 
301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2320  glycosyl transferase family protein  35.84 
 
 
318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.101648  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1809  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 
408 aa  126  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2767  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 
390 aa  120  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.645356  normal  0.0391357 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3280  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 
301 aa  119  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114088  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3794  hypothetical protein  25.7 
 
 
491 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.516461  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0253  glycosyl transferase family protein  34.74 
 
 
336 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.186746 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0378  glycosyl transferase family protein  35.68 
 
 
339 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2331  glycosyl transferase family protein  30.11 
 
 
309 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0852797  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2842  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 
309 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0234  glycosyl transferase family protein  34.27 
 
 
336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2104  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 
308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0754859  normal  0.466514 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1403  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 
301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.508618 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2293  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 
307 aa  112  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.129801  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0327  glycosyl transferase family protein  34.93 
 
 
336 aa  109  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1003  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
302 aa  109  8.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0274  glycosyl transferase family protein  32.54 
 
 
329 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.226663 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2494  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 
322 aa  107  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2358  Anthranilate phosphoribosyltransferase  31.69 
 
 
346 aa  106  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0815  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 
329 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303571  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0575  glycosyl transferase family protein  34.3 
 
 
323 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.596232  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4143  glycosyl transferase family protein  33.82 
 
 
323 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0867  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 
320 aa  100  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2690  glycosyl transferase family protein  32 
 
 
309 aa  100  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.335373 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1467  glycosyl transferase family protein  27.71 
 
 
319 aa  100  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0949  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 
320 aa  100  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2882  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 
322 aa  100  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00767  hypothetical protein  28.09 
 
 
320 aa  100  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2842  Glycosyl transferase, family 3-like protein  28.09 
 
 
320 aa  100  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00784  hypothetical protein  28.09 
 
 
320 aa  100  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2843  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 
320 aa  100  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0855  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 
320 aa  100  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2369  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
316 aa  99.8  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1580  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 
322 aa  99.4  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1290  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
321 aa  99.4  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.127601  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0858  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
324 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3296  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 
304 aa  97.8  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0655575  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0885  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
324 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0949  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
324 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0917  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
324 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0824  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 
320 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.993844 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2552  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 
320 aa  96.7  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0970  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 
324 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2729  glycosyl transferase family protein  32.85 
 
 
332 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3133  glycosyl transferase family protein  32.71 
 
 
326 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0738  glycosyl transferase family protein  33.18 
 
 
354 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2916  glycosyl transferase family protein  32.71 
 
 
326 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2397  glycosyl transferase family protein  29.54 
 
 
322 aa  91.7  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1487  glycosyl transferase family protein  32.71 
 
 
326 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2871  glycosyl transferase family protein  32.85 
 
 
332 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0102  glycosyl transferase family protein  32.71 
 
 
326 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0555  glycosyl transferase family protein  32.71 
 
 
326 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0570  glycosyl transferase family protein  32.71 
 
 
326 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0490  glycosyl transferase family protein  31.75 
 
 
369 aa  90.5  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2822  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 
324 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0461  glycosyl transferase family protein  32.23 
 
 
354 aa  88.6  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0305  glycosyl transferase family protein  32.87 
 
 
322 aa  89  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2197  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 
324 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2811  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 
324 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1594  glycosyl transferase family protein  27.09 
 
 
319 aa  86.3  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1780  glycosyl transferase family protein  27.09 
 
 
319 aa  86.3  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.301488 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1487  glycosyl transferase family protein  27.09 
 
 
319 aa  85.9  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6141  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 
324 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4332  hypothetical protein  29.51 
 
 
350 aa  84  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3637  hypothetical protein  26.14 
 
 
351 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2471  hypothetical protein  25.76 
 
 
351 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3065  anthranilate phosphoribosyltransferase  27.95 
 
 
359 aa  77.4  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00243568  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0504  anthranilate phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 
349 aa  77  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0158  anthranilate phosphoribosyltransferase  31.19 
 
 
376 aa  77  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.523516  normal  0.0330567 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0908  anthranilate phosphoribosyltransferase  27.95 
 
 
344 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000806391  hitchhiker  0.0000000035937 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0374  anthranilate phosphoribosyltransferase  29.57 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.250133 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0258  anthranilate phosphoribosyltransferase  27.54 
 
 
345 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1680  hypothetical protein  26.59 
 
 
357 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.99598 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1586  Anthranilate phosphoribosyltransferase  26.73 
 
 
361 aa  73.9  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09271  anthranilate phosphoribosyltransferase  27.54 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.162631  normal  0.0292256 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>