More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1836 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3997  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  678    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.937914  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1836  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  678    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000267985 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3602  hypothetical protein  96.4 
 
 		 333 aa  657    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3401  hypothetical protein  89.16 
 
 		 334 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.51245 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3579  hypothetical protein  79.28 
 
 		 333 aa  540  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3172  hypothetical protein  77.48 
 
 		 333 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.102896  normal  0.287439 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3342  glycosyl transferase, putative  77.18 
 
 		 333 aa  528  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.534413  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2381  hypothetical protein  77.91 
 
 		 331 aa  497  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148789  normal  0.0161209 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28160  hypothetical protein  73.7 
 
 		 328 aa  493  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30360  hypothetical protein  73.09 
 
 		 327 aa  488  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2599  hypothetical protein  72.78 
 
 		 327 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.733501  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1665  hypothetical protein  50.3 
 
 		 332 aa  304  1.0000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2812  glycosyl transferase family protein  40.48 
 
 		 337 aa  220  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1161  hypothetical protein  37.15 
 
 		 327 aa  211  1e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.18822  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2530  hypothetical protein  36.25 
 
 		 361 aa  205  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03656  hypothetical protein  35.09 
 
 		 331 aa  195  7e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001604  glycosyl transferase family 3  37.19 
 
 		 317 aa  194  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05584  hypothetical protein  36.88 
 
 		 317 aa  189  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3046  hypothetical protein  38.92 
 
 		 319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0326711  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1670  hypothetical protein  38.51 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0478591  normal  0.302071 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0848  hypothetical protein  36.4 
 
 		 334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4280  hypothetical protein  33.53 
 
 		 506 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1507  glycosyl transferase family protein  35.83 
 
 		 392 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1873  glycosyl transferase family protein  31.87 
 
 		 376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.597248  hitchhiker  0.00000310641 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0253  glycosyl transferase family protein  36.62 
 
 		 336 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.186746 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0234  glycosyl transferase family protein  36.11 
 
 		 336 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2320  glycosyl transferase family protein  36.73 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.101648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2767  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 		 390 aa  124  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.645356  normal  0.0391357 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1809  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 		 408 aa  123  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2882  glycosyl transferase family protein  33.07 
 
 		 304 aa  119  9e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1003  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0378  glycosyl transferase family protein  36.15 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3794  hypothetical protein  27.03 
 
 		 491 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.516461  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3531  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 		 301 aa  112  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0274  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 		 329 aa  109  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.226663 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2358  Anthranilate phosphoribosyltransferase  32.37 
 
 		 346 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0327  glycosyl transferase family protein  34.68 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3280  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2690  glycosyl transferase family protein  34.36 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.335373 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1403  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 		 301 aa  103  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.508618 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0867  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 		 320 aa  102  9e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00767  hypothetical protein  29.79 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2842  Glycosyl transferase, family 3-like protein  29.79 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0949  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2843  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0824  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.993844 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00784  hypothetical protein  29.79 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0855  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4143  glycosyl transferase family protein  36.06 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0575  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.596232  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2842  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 		 309 aa  100  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0970  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 		 324 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2552  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 		 320 aa  99  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1290  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 		 321 aa  98.6  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.127601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0885  glycosyl transferase family protein  30.38 
 
 		 324 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0949  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 		 324 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0858  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 		 324 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0917  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 		 324 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2331  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 		 309 aa  97.4  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0852797  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2293  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.129801  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2494  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 		 322 aa  95.1  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0815  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 		 329 aa  93.2  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303571  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1467  glycosyl transferase family protein  28.8 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2104  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 		 308 aa  91.7  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0754859  normal  0.466514 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2822  glycosyl transferase family protein  32.24 
 
 		 324 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2197  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 		 324 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2811  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 		 324 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4332  hypothetical protein  30.89 
 
 		 350 aa  87  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2369  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 		 316 aa  87  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2729  glycosyl transferase family protein  30.12 
 
 		 332 aa  87  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2871  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 		 332 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1580  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 		 322 aa  86.7  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3637  hypothetical protein  28.85 
 
 		 351 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2882  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 		 322 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2471  hypothetical protein  28.06 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0490  glycosyl transferase family protein  30.37 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3296  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0655575  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3133  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0738  glycosyl transferase family protein  32.29 
 
 		 354 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1487  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2916  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0102  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0570  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0555  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6141  glycosyl transferase family protein  29.51 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0461  glycosyl transferase family protein  30.18 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1594  glycosyl transferase family protein  25.96 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1487  glycosyl transferase family protein  25.96 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1780  glycosyl transferase family protein  25.96 
 
 		 319 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.301488 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2660  hypothetical protein  29.96 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0870271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18281  hypothetical protein  27.16 
 
 		 352 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1160  anthranilate phosphoribosyltransferase  31.14 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0305  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2892  Anthranilate phosphoribosyltransferase  26 
 
 		 355 aa  75.9  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0374  anthranilate phosphoribosyltransferase  28.74 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.250133 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1598  hypothetical protein  28.05 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.267194 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2397  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3100  anthranilate phosphoribosyltransferase  35.03 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0513  Anthranilate phosphoribosyltransferase  26.61 
 
 		 355 aa  74.3  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29911  hypothetical protein  27.97 
 
 		 368 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>