More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3579 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3579  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  684    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3342  glycosyl transferase, putative  78.68 
 
 		 333 aa  548  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.534413  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3172  hypothetical protein  78.08 
 
 		 333 aa  547  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.102896  normal  0.287439 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3997  hypothetical protein  79.28 
 
 		 333 aa  540  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.937914  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1836  hypothetical protein  79.28 
 
 		 333 aa  540  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000267985 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3602  hypothetical protein  78.68 
 
 		 333 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3401  hypothetical protein  76.81 
 
 		 334 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.51245 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30360  hypothetical protein  73.7 
 
 		 327 aa  497  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2599  hypothetical protein  73.39 
 
 		 327 aa  494  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.733501  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2381  hypothetical protein  75.77 
 
 		 331 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148789  normal  0.0161209 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28160  hypothetical protein  72.48 
 
 		 328 aa  488  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1665  hypothetical protein  50 
 
 		 332 aa  300  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2530  hypothetical protein  38.32 
 
 		 361 aa  228  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2812  glycosyl transferase family protein  38.37 
 
 		 337 aa  215  9e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03656  hypothetical protein  37.15 
 
 		 331 aa  208  8e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1161  hypothetical protein  36.34 
 
 		 327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.18822  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05584  hypothetical protein  33.97 
 
 		 317 aa  190  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001604  glycosyl transferase family 3  34.19 
 
 		 317 aa  189  7e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1670  hypothetical protein  38.7 
 
 		 323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0478591  normal  0.302071 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3046  hypothetical protein  39.31 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0326711  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0848  hypothetical protein  31.21 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1507  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 		 392 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4280  hypothetical protein  31.61 
 
 		 506 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1873  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 		 376 aa  134  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.597248  hitchhiker  0.00000310641 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3794  hypothetical protein  28 
 
 		 491 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.516461  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1809  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 		 408 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2320  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 		 318 aa  126  5e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.101648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3531  glycosyl transferase family protein  31.15 
 
 		 301 aa  122  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2882  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 		 304 aa  122  8e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3280  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 		 301 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2767  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 		 390 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.645356  normal  0.0391357 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0253  glycosyl transferase family protein  32.86 
 
 		 336 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.186746 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1403  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 		 301 aa  114  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.508618 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2358  Anthranilate phosphoribosyltransferase  32.23 
 
 		 346 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0815  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 		 329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303571  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2842  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1003  glycosyl transferase family protein  30.4 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0234  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 		 336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2331  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 		 309 aa  109  6e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0852797  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2494  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 		 322 aa  107  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0378  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 339 aa  106  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2293  glycosyl transferase family protein  32.33 
 
 		 307 aa  106  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.129801  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0327  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0274  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.226663 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2104  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0754859  normal  0.466514 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1580  glycosyl transferase family protein  30.38 
 
 		 322 aa  99.4  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1467  glycosyl transferase family protein  28 
 
 		 319 aa  99  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0824  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 		 320 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.993844 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00767  hypothetical protein  29.36 
 
 		 320 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2842  Glycosyl transferase, family 3-like protein  29.36 
 
 		 320 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0867  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 		 320 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2843  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 		 320 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0855  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 		 320 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00784  hypothetical protein  29.36 
 
 		 320 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0949  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 		 320 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2397  glycosyl transferase family protein  32.22 
 
 		 322 aa  97.1  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2882  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 		 322 aa  96.3  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2369  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 316 aa  95.9  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0858  glycosyl transferase family protein  27.61 
 
 		 324 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0885  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 		 324 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2690  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.335373 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0917  glycosyl transferase family protein  29.54 
 
 		 324 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0949  glycosyl transferase family protein  29.54 
 
 		 324 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2552  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 		 320 aa  93.6  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0970  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 		 324 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1290  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 		 321 aa  91.3  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.127601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1594  glycosyl transferase family protein  27.42 
 
 		 319 aa  89.7  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0575  glycosyl transferase family protein  33.63 
 
 		 323 aa  89.7  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.596232  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1487  glycosyl transferase family protein  27.42 
 
 		 319 aa  89.4  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1780  glycosyl transferase family protein  27.42 
 
 		 319 aa  89.4  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.301488 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3637  hypothetical protein  27.91 
 
 		 351 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1762  Anthranilate phosphoribosyltransferase  27.71 
 
 		 350 aa  85.9  8e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2471  hypothetical protein  27.52 
 
 		 351 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3296  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0655575  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4143  glycosyl transferase family protein  32.21 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1598  hypothetical protein  27.48 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.267194 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2892  Anthranilate phosphoribosyltransferase  26.8 
 
 		 355 aa  83.6  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4332  hypothetical protein  27.41 
 
 		 350 aa  83.2  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3133  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 326 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0102  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 326 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2916  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 326 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1487  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 326 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0738  glycosyl transferase family protein  31.7 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1160  anthranilate phosphoribosyltransferase  30.43 
 
 		 348 aa  82.4  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0555  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0570  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0490  glycosyl transferase family protein  29.92 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2822  glycosyl transferase family protein  30.37 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1189  anthranilate phosphoribosyltransferase  32.57 
 
 		 346 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0318107  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2729  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0305  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2197  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2811  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1680  hypothetical protein  28.34 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.99598 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2871  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0461  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 		 354 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0088  glycosyl transferase family 3  27.41 
 
 		 368 aa  76.6  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.826373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0513  Anthranilate phosphoribosyltransferase  26 
 
 		 355 aa  75.9  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1586  Anthranilate phosphoribosyltransferase  26.37 
 
 		 361 aa  75.9  0.0000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6141  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 		 324 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>