51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0065 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp0065  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  159  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2034  XRE family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 83 aa  79  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.194194 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3847  helix-turn-helix domain-containing protein  43.82 
 
 		 93 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0496  XRE family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0567  XRE family transcriptional regulator  48.19 
 
 		 82 aa  73.6  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.102591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0378  helix-turn-helix domain-containing protein  50 
 
 		 93 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0365  helix-turn-helix domain-containing protein  50 
 
 		 93 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0306  transciptional regulator  50 
 
 		 93 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.93162  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0367  XRE family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 93 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4613  helix-turn-helix domain protein  44.44 
 
 		 89 aa  70.5  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.590277  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4245  helix-turn-helix domain protein  39.19 
 
 		 84 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4032  helix-turn-helix domain protein  41.77 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.964235  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003247  putative transcription regulator protein  40.48 
 
 		 88 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1915  XRE family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 80 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.799088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1709  DNA-binding transcriptional regulator HipB  41.46 
 
 		 94 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2138  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 88 aa  62  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0287483  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2149  DNA-binding transcriptional regulator HipB  42.11 
 
 		 88 aa  62  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1591  DNA-binding transcriptional regulator HipB  42.11 
 
 		 94 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01470  DNA-binding transcriptional regulator  42.11 
 
 		 88 aa  62  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01480  hypothetical protein  42.11 
 
 		 88 aa  62  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1801  DNA-binding transcriptional regulator HipB  42.03 
 
 		 83 aa  60.5  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2898  transcriptional regulator, XRE family  37.97 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3100  transcriptional regulator, XRE family  43.4 
 
 		 97 aa  51.2  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000473627  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2176  transcriptional regulator, XRE family  43.4 
 
 		 97 aa  51.2  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1476  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1505  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.139126  normal  0.0361039 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1252  putative transcription regulator protein  33.33 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11984  transcriptional regulator  41.18 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001517  predicted transcriptional regulator  32.84 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000562754  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1447  putative transcription regulator protein  28.21 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4302  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.397769  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0889  putative transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2236  putative transcriptionl regulator HipB  30.91 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.74282  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2151  putative transcriptionl regulator HipB  30.91 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.690845  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1592  HipB domain-containing protein  31.48 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0681  putative transcriptionl regulator HipB  31.48 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3380  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.738813  hitchhiker  0.00256975 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3478  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2003  HipB domain-containing protein  31.48 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1872  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.765913  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0386  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000617682 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0634  HipB domain-containing protein  31.48 
 
 		 136 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.29949  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0390  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 104 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3350  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3247  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2442  XRE family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 86 aa  41.2  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0094  transcriptional regulator, XRE family  23.08 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.850445  normal  0.0181777 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4541  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4384  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5820  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.790408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 175 aa  40.4  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>