More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0538 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_0599  aminotransferase class I and II  99.75 
 
 
410 aa  835    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.188208  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0538  putative aspartate aminotransferase  100 
 
 
403 aa  835    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1058  putative aspartate aminotransferase  99.75 
 
 
410 aa  835    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0685472 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4025  aminotransferase class I and II  34.65 
 
 
389 aa  219  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1457  aminotransferase class I and II  35.45 
 
 
400 aa  210  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  33.7 
 
 
386 aa  208  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  34.75 
 
 
380 aa  205  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4172  aminotransferase  33.88 
 
 
389 aa  203  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000308334  normal  0.06554 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  31.37 
 
 
380 aa  201  3e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  34.2 
 
 
389 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1589  aminotransferase class I and II  35 
 
 
388 aa  192  1e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.570274  normal  0.997375 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  33.06 
 
 
388 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  31.73 
 
 
387 aa  186  6e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  30.14 
 
 
390 aa  186  7e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  33.71 
 
 
390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  34.48 
 
 
388 aa  181  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  32.97 
 
 
392 aa  181  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  35.24 
 
 
386 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1427  hypothetical protein  31.43 
 
 
402 aa  179  4.999999999999999e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  29.75 
 
 
392 aa  179  7e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  32.53 
 
 
388 aa  178  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  32.76 
 
 
375 aa  178  1e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  31.95 
 
 
391 aa  178  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  31.71 
 
 
397 aa  177  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  34.55 
 
 
402 aa  177  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  30.93 
 
 
392 aa  176  5e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  31.07 
 
 
410 aa  176  8e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  33.24 
 
 
388 aa  176  8e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  31.5 
 
 
394 aa  175  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4403  aminotransferase class I and II  33.06 
 
 
405 aa  175  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  30.95 
 
 
379 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  30.95 
 
 
397 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5434  aminotransferase class I and II  29.48 
 
 
392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3160  aminotransferase class I and II  30.33 
 
 
410 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  31.28 
 
 
393 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  30.95 
 
 
397 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  32.61 
 
 
388 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0207  aspartate aminotransferase  32.79 
 
 
376 aa  173  5.999999999999999e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  30.73 
 
 
393 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2382  aspartate aminotransferase  32.35 
 
 
388 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  32.76 
 
 
396 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  33.99 
 
 
390 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  33.05 
 
 
396 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  31.62 
 
 
392 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  29.71 
 
 
379 aa  170  3e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  31.54 
 
 
389 aa  170  3e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2331  aspartate aminotransferase  32.08 
 
 
388 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  29.6 
 
 
412 aa  170  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4119  aminotransferase  29.63 
 
 
400 aa  170  5e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  31.34 
 
 
392 aa  169  6e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  33.05 
 
 
387 aa  169  1e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2478  aspartate aminotransferase  30.52 
 
 
377 aa  168  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  31.65 
 
 
386 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  32.48 
 
 
396 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  32.06 
 
 
385 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  31.76 
 
 
404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  31.95 
 
 
391 aa  167  4e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  30.88 
 
 
400 aa  167  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  32.48 
 
 
396 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  32.48 
 
 
396 aa  166  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  32.48 
 
 
396 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  32.48 
 
 
396 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  30.45 
 
 
395 aa  166  5e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  30.57 
 
 
396 aa  166  5e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  32.19 
 
 
396 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  32.48 
 
 
396 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1747  aminotransferase, class I and II  31.67 
 
 
396 aa  166  6.9999999999999995e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  31.43 
 
 
387 aa  166  9e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  28.94 
 
 
400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1173  L-aspartate aminotransferase  29.01 
 
 
392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.241415 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  31.11 
 
 
407 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  29.46 
 
 
390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2022  aspartate aminotransferase  31.1 
 
 
393 aa  165  2.0000000000000002e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.776343  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  30.65 
 
 
387 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1232  aminotransferase  31.56 
 
 
399 aa  164  3e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2905  L-aspartate aminotransferase  29.68 
 
 
395 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.512789  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  30.37 
 
 
387 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2185  aminotransferase class I and II  29.17 
 
 
396 aa  163  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.909298  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  29.18 
 
 
395 aa  162  9e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  30.17 
 
 
385 aa  162  9e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6257  aminotransferase class I and II  29.79 
 
 
399 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110785  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  29.39 
 
 
401 aa  162  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  30.38 
 
 
398 aa  161  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  31.83 
 
 
386 aa  161  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  30.48 
 
 
396 aa  161  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2661  aspartate aminotransferase  27.16 
 
 
402 aa  161  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.975518  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  30.09 
 
 
398 aa  161  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  31.22 
 
 
396 aa  161  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  31.05 
 
 
396 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  30.09 
 
 
398 aa  160  4e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  31.43 
 
 
402 aa  160  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  29.86 
 
 
397 aa  160  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  29.56 
 
 
444 aa  160  5e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0513  aminotransferase  30.06 
 
 
392 aa  159  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  29.5 
 
 
385 aa  159  6e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3721  aspartate aminotransferase  28.61 
 
 
396 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.764242 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  30.36 
 
 
399 aa  159  8e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  29.18 
 
 
387 aa  159  9e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0863  aspartate aminotransferase  28.88 
 
 
393 aa  159  9e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.252217  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2042  aminotransferase, class I and II  28.76 
 
 
396 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.366261  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>