296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1507 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  99.53 
 
 
490 aa  877    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1507  D-mannonate oxidoreductase  100 
 
 
452 aa  934    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  99.53 
 
 
490 aa  877    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  69.81 
 
 
497 aa  629  1e-179  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  70.69 
 
 
493 aa  624  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  66.75 
 
 
498 aa  599  1e-170  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  63.59 
 
 
495 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  64.05 
 
 
495 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  63.18 
 
 
488 aa  566  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  61.76 
 
 
488 aa  555  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  61.76 
 
 
488 aa  555  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  61.76 
 
 
488 aa  555  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  62 
 
 
488 aa  556  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  62.47 
 
 
488 aa  558  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  61.76 
 
 
488 aa  555  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  61.76 
 
 
488 aa  555  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  61.76 
 
 
488 aa  553  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  61.59 
 
 
488 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  61.59 
 
 
488 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  61.36 
 
 
488 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  61.36 
 
 
488 aa  547  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  60.89 
 
 
488 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  59.76 
 
 
486 aa  533  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  60.8 
 
 
490 aa  531  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  59.53 
 
 
486 aa  532  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1935  fructuronate reductase  60.94 
 
 
487 aa  534  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  59.53 
 
 
486 aa  529  1e-149  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  59.53 
 
 
486 aa  528  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1039  Mannitol dehydrogenase domain protein  58.53 
 
 
488 aa  525  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  59.29 
 
 
486 aa  526  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  59.29 
 
 
486 aa  527  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  59.29 
 
 
486 aa  527  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  59.06 
 
 
486 aa  525  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  59.29 
 
 
486 aa  526  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0805  Mannitol dehydrogenase domain protein  58.49 
 
 
488 aa  522  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2638  Mannitol dehydrogenase domain protein  61.86 
 
 
490 aa  523  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  59.52 
 
 
486 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  59.52 
 
 
486 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  59.05 
 
 
486 aa  501  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  59.29 
 
 
486 aa  502  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  59.05 
 
 
486 aa  501  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  59.52 
 
 
486 aa  504  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  59.29 
 
 
486 aa  503  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  59.29 
 
 
486 aa  503  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  56.47 
 
 
487 aa  500  1e-140  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.59872 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3566  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  57.04 
 
 
490 aa  485  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  57.35 
 
 
490 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  57.58 
 
 
490 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  57.58 
 
 
490 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  57.35 
 
 
490 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  57.58 
 
 
490 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3245  D-mannonate oxidoreductase  48.25 
 
 
490 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3321  D-mannonate oxidoreductase  48.25 
 
 
490 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3329  D-mannonate oxidoreductase  48.25 
 
 
490 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.824696  normal  0.499886 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0789  mannitol dehydrogenase family protein  65.28 
 
 
358 aa  402  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000484963  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3426  D-mannonate oxidoreductase  48.02 
 
 
490 aa  405  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156108 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3302  mannitol dehydrogenase  49.88 
 
 
490 aa  391  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.059304 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  49.64 
 
 
493 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  47.61 
 
 
489 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  47.72 
 
 
486 aa  362  8e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  47.8 
 
 
464 aa  359  6e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  47.56 
 
 
455 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  51.19 
 
 
459 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  41.55 
 
 
492 aa  356  3.9999999999999996e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2979  mannitol dehydrogenase-like protein  45.48 
 
 
485 aa  355  1e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  45 
 
 
497 aa  340  5e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  44.63 
 
 
496 aa  336  5e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  46.17 
 
 
478 aa  333  4e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  42.21 
 
 
491 aa  333  4e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3741  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  62.88 
 
 
263 aa  330  2e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  42.2 
 
 
494 aa  329  7e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  43.47 
 
 
493 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.69 
 
 
491 aa  325  9e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4352  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  43.25 
 
 
484 aa  324  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000397508 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  43.51 
 
 
492 aa  322  7e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  42.21 
 
 
491 aa  322  7e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  45.31 
 
 
505 aa  317  3e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4472  fructuronate reductase  41.49 
 
 
491 aa  317  4e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.194992  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2703  D-mannonate oxidoreductase  39.95 
 
 
493 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00357534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2436  mannitol dehydrogenase  39.55 
 
 
493 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114445  hitchhiker  0.00481039 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4022  Mannitol dehydrogenase domain  43.64 
 
 
485 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  42.17 
 
 
499 aa  311  2e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.62 
 
 
497 aa  310  4e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.903405  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  42.11 
 
 
497 aa  310  5e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  41.84 
 
 
490 aa  307  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1282  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.42 
 
 
528 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.91311  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3866  fructuronate reductase  43.32 
 
 
471 aa  303  5.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.154848 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  39.9 
 
 
491 aa  300  5e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0905  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.37 
 
 
493 aa  297  3e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2636  mannitol dehydrogenase  39.23 
 
 
490 aa  296  4e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  42.72 
 
 
510 aa  295  9e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0643  mannitol dehydrogenase-like protein  38.64 
 
 
497 aa  291  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.319971  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4205  Mannitol dehydrogenase domain  40.72 
 
 
520 aa  290  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07170  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  41.91 
 
 
451 aa  291  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564088  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0300  Mannitol dehydrogenase domain  39.37 
 
 
497 aa  289  6e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.781691  normal  0.116256 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5134  fructuronate reductase  42.33 
 
 
491 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4601  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.33 
 
 
487 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0872414  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.35 
 
 
509 aa  288  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2094  mannitol dehydrogenase family protein  45.45 
 
 
489 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1999  mannitol dehydrogenase family protein  45.45 
 
 
489 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>