More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0224 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0224  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  100 
 
 
353 aa  722    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.724621  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0195  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  98.3 
 
 
353 aa  707    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0503  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  74.86 
 
 
351 aa  547  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0802438  normal  0.0327306 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03169  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  74.49 
 
 
351 aa  538  9.999999999999999e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1237  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  66.76 
 
 
354 aa  466  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2008  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  65.8 
 
 
366 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0752  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  65.8 
 
 
360 aa  467  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4166  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  67.46 
 
 
361 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.167438  normal  0.0625555 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1380  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  65.52 
 
 
356 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.724349  hitchhiker  0.000724393 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3491  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  66.28 
 
 
354 aa  460  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.370229 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5900  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  65.01 
 
 
352 aa  454  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0553  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  65.4 
 
 
355 aa  456  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68170  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  65.29 
 
 
352 aa  455  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0640014  decreased coverage  0.00283529 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0537  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  64.52 
 
 
353 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.433038  normal  0.0400591 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0715  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  64.74 
 
 
353 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256455  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4022  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  65.1 
 
 
360 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1275  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  65.1 
 
 
356 aa  449  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2735  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  65.5 
 
 
354 aa  451  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0682  dTDP-glucose 4,6-dehydratase protein  65.2 
 
 
354 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2596  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  64.81 
 
 
353 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0253  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  62.57 
 
 
352 aa  445  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.430028  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0842  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  64.81 
 
 
353 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0136971 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0712  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  64.04 
 
 
354 aa  443  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1780  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  64.35 
 
 
355 aa  443  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.629198  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3994  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  66.17 
 
 
355 aa  441  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.353509  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0389  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  65.1 
 
 
353 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0871  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  65.1 
 
 
353 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.83298  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0923  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  64.22 
 
 
400 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1618  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.98 
 
 
359 aa  437  9.999999999999999e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1990  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  64.22 
 
 
353 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0338476  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2139  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  65.4 
 
 
356 aa  439  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3163  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  64.22 
 
 
400 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1852  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  64.22 
 
 
353 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.677884  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2753  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  64.22 
 
 
400 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.419146  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3105  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  64.22 
 
 
353 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311481  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3141  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  64.22 
 
 
353 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0761  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  64.22 
 
 
353 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3803  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  64.22 
 
 
350 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2319  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  63.64 
 
 
353 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.251448 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0619  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  64.52 
 
 
355 aa  437  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129356 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0640  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  64.93 
 
 
353 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3969  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  63.93 
 
 
353 aa  437  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00429727  normal  0.623158 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1469  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  63.64 
 
 
397 aa  434  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.793194  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3122  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  63.13 
 
 
364 aa  436  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0277  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  61.99 
 
 
352 aa  436  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.674919  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6725  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  65.38 
 
 
353 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15920  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  63.53 
 
 
351 aa  432  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0878  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  63.64 
 
 
353 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3727  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  63.93 
 
 
353 aa  431  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1714  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  63.93 
 
 
353 aa  431  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0751  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  63.05 
 
 
353 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143791  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1282  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  62.76 
 
 
357 aa  427  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.306583  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0926  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.94 
 
 
366 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770588  normal  0.575373 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0264  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  62.72 
 
 
353 aa  425  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.850535  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2264  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  61.45 
 
 
355 aa  422  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0540  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  62.61 
 
 
363 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0209  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.39 
 
 
350 aa  415  9.999999999999999e-116  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1785  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.09 
 
 
366 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00820304 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1489  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.35 
 
 
355 aa  415  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0698  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  62.03 
 
 
372 aa  416  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0574  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.82 
 
 
354 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.389781  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1405  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.29 
 
 
354 aa  415  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4019  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  62.43 
 
 
352 aa  413  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.68615  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0628  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  62.87 
 
 
357 aa  414  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3861  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.06 
 
 
350 aa  410  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.646368 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5396  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.59 
 
 
360 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0590  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.31 
 
 
362 aa  407  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.793551  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3843  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.71 
 
 
346 aa  405  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6255  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.47 
 
 
353 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.849165  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2317  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  62.13 
 
 
367 aa  408  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.150256 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3285  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.94 
 
 
353 aa  402  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2100  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.57 
 
 
357 aa  402  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564792  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4289  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.65 
 
 
353 aa  404  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.337575 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4935  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.08 
 
 
360 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2593  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.95 
 
 
362 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2106  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.93 
 
 
350 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0474818  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4078  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59 
 
 
346 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29374  normal  0.0761668 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2653  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.36 
 
 
360 aa  399  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3018  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  55.43 
 
 
371 aa  399  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2121  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.68 
 
 
345 aa  399  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147251  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2330  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  56.36 
 
 
361 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.129575 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2437  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  56.36 
 
 
361 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000861453 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001808  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.21 
 
 
355 aa  396  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1601  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  56.65 
 
 
361 aa  395  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1401  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  56.37 
 
 
365 aa  395  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0069994 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4115  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.77 
 
 
346 aa  396  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560376  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3844  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.75 
 
 
346 aa  398  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.919278  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3465  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.13 
 
 
360 aa  397  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.848345  normal  0.362131 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01947  dTDP-glucose 4,6 dehydratase, NAD(P)-binding  56.36 
 
 
361 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00991  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  55.46 
 
 
360 aa  391  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2323  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  56.36 
 
 
361 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00762462 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1658  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.65 
 
 
359 aa  391  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.548961  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1472  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  55.24 
 
 
356 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.239272  normal  0.402949 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1398  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  55.52 
 
 
365 aa  391  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2332  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  56.65 
 
 
361 aa  393  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000326666  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1058  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.88 
 
 
355 aa  394  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.807242  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2279  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  56.36 
 
 
361 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000978054 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3935  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.8 
 
 
358 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.259992 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1397  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.4 
 
 
358 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2719  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.4 
 
 
358 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.719616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>