More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3374 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3374  methyltransferase GidB  100 
 
 		 242 aa  473  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38010  glucose-inhibited division protein B  66.5 
 
 		 210 aa  271  9e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2553  methyltransferase GidB  57.58 
 
 		 210 aa  231  8.000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000314957  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3722  methyltransferase GidB  55.56 
 
 		 228 aa  211  9e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000000027143  hitchhiker  0.00000187347 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23430  16S rRNA methyltransferase GidB  48.98 
 
 		 241 aa  176  3e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4220  methyltransferase GidB  52.63 
 
 		 212 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31930  glucose-inhibited division protein B  48.39 
 
 		 221 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4980  methyltransferase GidB  48.96 
 
 		 210 aa  169  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3932  16S rRNA methyltransferase GidB  44.39 
 
 		 216 aa  165  8e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000765398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9385  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell division-like protein  53.01 
 
 		 236 aa  164  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3590  methyltransferase GidB  51.58 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9051  16S rRNA methyltransferase GidB  48.34 
 
 		 245 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0166723  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3112  16S rRNA methyltransferase GidB  53.8 
 
 		 237 aa  162  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26699  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6482  methyltransferase GidB  50.54 
 
 		 213 aa  162  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0936076 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0051  16S rRNA methyltransferase GidB  38.3 
 
 		 255 aa  162  6e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4167  16S rRNA methyltransferase GidB  46.7 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39750  glucose-inhibited division protein B  47.74 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7094  methyltransferase GidB  54.32 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4695  methyltransferase GidB  48.35 
 
 		 250 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0675107  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4508  methyltransferase GidB  46.7 
 
 		 254 aa  151  8.999999999999999e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1441  16S rRNA methyltransferase GidB  41.04 
 
 		 221 aa  148  7e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26990  glucose-inhibited division protein B  50 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5106  16S rRNA methyltransferase GidB  47.55 
 
 		 242 aa  146  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000203893 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4238  methyltransferase GidB  50 
 
 		 239 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4588  16S rRNA methyltransferase GidB  42.65 
 
 		 242 aa  142  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.188204  hitchhiker  0.000465387 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4863  methyltransferase GidB  58.87 
 
 		 236 aa  138  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0314819  normal  0.0271689 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2156  methyltransferase GidB  46.82 
 
 		 222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5410  methyltransferase GidB  43.22 
 
 		 262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4859  methyltransferase GidB  47.68 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5408  16S rRNA methyltransferase GidB  45.99 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  45.99 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894552  normal  0.113174 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5784  16S rRNA methyltransferase GidB  45.45 
 
 		 225 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0206259 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0833  16S rRNA methyltransferase GidB  47.75 
 
 		 227 aa  132  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6073  16S rRNA methyltransferase GidB  44 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7334  16S rRNA methyltransferase GidB  39.51 
 
 		 306 aa  128  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5091  methyltransferase GidB  47.59 
 
 		 223 aa  126  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13954  16S rRNA methyltransferase GidB  42.02 
 
 		 224 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4542  16S rRNA methyltransferase GidB  43.86 
 
 		 265 aa  124  9e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  30.41 
 
 		 239 aa  99.8  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  29.82 
 
 		 239 aa  98.2  9e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2817  methyltransferase GidB  38.6 
 
 		 221 aa  96.7  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3213  methyltransferase GidB  38.6 
 
 		 221 aa  96.7  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  31.18 
 
 		 242 aa  95.1  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4009  methyltransferase GidB  35.37 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00213525  hitchhiker  0.00000000363002 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5025  methyltransferase GidB  35.48 
 
 		 221 aa  94  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.692099 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  33.12 
 
 		 210 aa  93.6  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  33.53 
 
 		 237 aa  93.6  3e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  33.76 
 
 		 208 aa  92.4  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0112  cell division SAM-dependent methyltransferase  30.25 
 
 		 242 aa  92.4  6e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  33.11 
 
 		 240 aa  92  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  34.44 
 
 		 242 aa  91.3  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  36.53 
 
 		 236 aa  87.8  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  38.46 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0209  16S rRNA methyltransferase GidB  34.25 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.444443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  29.44 
 
 		 241 aa  87.8  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  33.56 
 
 		 205 aa  86.7  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  31.52 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2126  16S rRNA methyltransferase GidB  29.53 
 
 		 204 aa  86.3  4e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  32.73 
 
 		 239 aa  86.7  4e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0197  16S rRNA methyltransferase GidB  28.76 
 
 		 204 aa  86.3  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0042  methyltransferase GidB  37.97 
 
 		 219 aa  85.5  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  28.18 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  30.77 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  29.88 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  27.61 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  31.55 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0223  methyltransferase GidB  37.19 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2336  methyltransferase GidB  34.48 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000208151  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3327  16S rRNA methyltransferase GidB  32.91 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0247343  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1822  16S rRNA methyltransferase GidB  33.96 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0205  16S rRNA methyltransferase GidB  35.19 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2754  methyltransferase GidB  32.79 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  0.648083 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  29.81 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  30.13 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  29.81 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  29.81 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  29.81 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  29.81 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  29.81 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  31.21 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2803  16S rRNA methyltransferase GidB  28.1 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4056  methyltransferase GidB  33.79 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4197  16S rRNA methyltransferase GidB  30.63 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000264563 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2035  16S rRNA methyltransferase GidB  36.88 
 
 		 221 aa  81.6  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00382628  normal  0.306355 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  31.21 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  33.94 
 
 		 236 aa  81.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  29.81 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  30.43 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2949  16S rRNA methyltransferase GidB  28.1 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5609  16S rRNA methyltransferase GidB  29.19 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  35.62 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1084  methyltransferase GidB  29.66 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5275  16S rRNA methyltransferase GidB  29.81 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  31.14 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826958  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4146  methyltransferase GidB  33.1 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5326  16S rRNA methyltransferase GidB  29.19 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_12955  predicted protein  43.86 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0221  methyltransferase GidB  36.67 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3967  16S rRNA methyltransferase GidB  38.17 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0752  methyltransferase GidB  30 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>