More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0113 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0113  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 350 aa  679    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0819  transcriptional regulator, LacI family  63.34 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3252  transcriptional regulator, LacI family  45.16 
 
 		 351 aa  267  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0181  transcriptional regulator, LacI family  48.97 
 
 		 341 aa  255  8e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844091 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23440  transcriptional regulator, LacI family  43.67 
 
 		 350 aa  240  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.769589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3482  Alanine racemase  44.77 
 
 		 359 aa  228  8e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0777863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0971  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  42.23 
 
 		 350 aa  223  4e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0091  LacI family transcription regulator  41.13 
 
 		 346 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01670  transcriptional regulator  41.98 
 
 		 348 aa  220  3e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2320  LacI family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 340 aa  219  6e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316441  normal  0.202359 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2046  LacI family transcription regulator  39.42 
 
 		 344 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1824  transcriptional regulator, LacI family  42.48 
 
 		 347 aa  216  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.021809  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0549  Alanine racemase  42.03 
 
 		 340 aa  213  3.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2790  LacI family transcription regulator  39.02 
 
 		 348 aa  209  4e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6831  LacI family transcription regulator  43.19 
 
 		 337 aa  209  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0069  transcriptional regulator, LacI family  42.29 
 
 		 342 aa  207  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3841  transcriptional regulator, LacI family  37.94 
 
 		 346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.455211 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4918  transcriptional regulator, LacI family  37.94 
 
 		 346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2659  transcriptional regulator, LacI family  39.53 
 
 		 339 aa  197  3e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.34431  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02195  transcription regulator transcription regulator protein  38.35 
 
 		 355 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.479594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3338  transcriptional regulator, LacI family  42.11 
 
 		 341 aa  196  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.680798  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1620  LacI family transcription regulator  40.7 
 
 		 337 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0193  transcriptional regulator, LacI family  40.57 
 
 		 340 aa  194  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2344  transcriptional regulator, LacI family  39.94 
 
 		 349 aa  193  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  normal  0.408649 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1825  transcriptional regulator, LacI family  44.6 
 
 		 346 aa  192  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319362  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  37.39 
 
 		 353 aa  192  8e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3001  transcriptional regulator, LacI family  38.9 
 
 		 343 aa  191  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3319  transcriptional regulator, LacI family  39.94 
 
 		 337 aa  189  8e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419074  normal  0.0675752 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3985  transcriptional regulator, LacI family  39.47 
 
 		 338 aa  186  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.610149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  36.52 
 
 		 368 aa  185  8e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  39.6 
 
 		 339 aa  185  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11530  transcriptional regulator, LacI family  40.23 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809623 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1983  transcriptional regulator, LacI family  40.36 
 
 		 345 aa  184  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.597613  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0461  transcriptional regulator, LacI family  37.92 
 
 		 353 aa  183  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.686839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  34.82 
 
 		 348 aa  183  5.0000000000000004e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33130  transcriptional regulator, LacI family  37.72 
 
 		 361 aa  182  6e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.260263  normal  0.79569 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0366  transcriptional regulator, LacI family  38.29 
 
 		 344 aa  182  9.000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4933  transcriptional regulator, LacI family  39.05 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0794709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0186  transcriptional regulator, LacI family  42.22 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2445  LacI family transcription regulator  36.58 
 
 		 337 aa  179  5.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0948  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.28 
 
 		 337 aa  179  8e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.849116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1662  LacI family transcription regulator  36.1 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0907  LacI family transcription regulator  37.91 
 
 		 341 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3715  transcriptional regulator, LacI family  40.65 
 
 		 341 aa  175  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.335783  hitchhiker  0.00243488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4415  transcriptional regulator, LacI family  38.73 
 
 		 342 aa  173  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3586  transcriptional regulator, LacI family  38.46 
 
 		 333 aa  172  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  36.39 
 
 		 336 aa  172  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1873  LacI family response repressor  36.67 
 
 		 368 aa  172  7.999999999999999e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.845568  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2403  transcriptional regulator, LacI family  37.91 
 
 		 379 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00011763  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2311  transcriptional regulator, LacI family  32.14 
 
 		 335 aa  169  8e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000106518  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1329  transcriptional regulator, LacI family  39.17 
 
 		 341 aa  169  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.315575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  37.35 
 
 		 332 aa  169  8e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  33.72 
 
 		 335 aa  168  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  34.86 
 
 		 335 aa  169  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.05 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.49 
 
 		 335 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3272  LacI family transcription regulator  34.42 
 
 		 352 aa  166  8e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  29.89 
 
 		 341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0276  LacI family transcription regulator  35.82 
 
 		 347 aa  164  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4877  transcriptional regulator, LacI family  37.39 
 
 		 346 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00304627  normal  0.857214 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0502  transcriptional regulator, LacI family  39.83 
 
 		 344 aa  164  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0979375 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1769  LacI family transcription regulator  33.24 
 
 		 339 aa  162  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  36.08 
 
 		 337 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  37.03 
 
 		 335 aa  162  8.000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3423  transcriptional regulator, LacI family  36.31 
 
 		 366 aa  162  8.000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0558625 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  32.25 
 
 		 361 aa  162  9e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  35.24 
 
 		 340 aa  162  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1125  transcriptional regulator, LacI family  37.69 
 
 		 341 aa  160  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0262  LacI family transcription regulator  35.06 
 
 		 344 aa  161  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3513  LacI family transcription regulator  34.97 
 
 		 338 aa  161  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.98216  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1111  LacI family transcription regulator  31.09 
 
 		 339 aa  160  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.61 
 
 		 335 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0937  LacI family transcription regulator  31.96 
 
 		 337 aa  160  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.266523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2268  transcriptional regulator, LacI family  32.1 
 
 		 339 aa  160  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.580288  hitchhiker  0.000512159 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  29.77 
 
 		 339 aa  159  6e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.94 
 
 		 336 aa  159  7e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  32.34 
 
 		 340 aa  159  7e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  36.84 
 
 		 340 aa  159  9e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1073  regulatory protein, LacI  31.69 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  34.93 
 
 		 355 aa  158  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4424  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.1 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4494  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.1 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  36.42 
 
 		 338 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  35.8 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2720  transcriptional regulator, LacI family  37.46 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.687845  normal  0.476409 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4426  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.1 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4310  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.1 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4340  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.1 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.302828  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.31 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2892  transcriptional regulator, LacI family  36.52 
 
 		 340 aa  157  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207309  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.47 
 
 		 336 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  33.14 
 
 		 335 aa  156  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  33.23 
 
 		 386 aa  156  6e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1876  LacI family transcription regulator  29.02 
 
 		 345 aa  156  6e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0282  LacI family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 342 aa  156  6e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.727359 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  35.51 
 
 		 346 aa  155  7e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  31.21 
 
 		 342 aa  155  8e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>