More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0461 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0461  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 353 aa  709    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.686839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33130  transcriptional regulator, LacI family  65.37 
 
 		 361 aa  414  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.260263  normal  0.79569 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3001  transcriptional regulator, LacI family  60.7 
 
 		 343 aa  389  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0366  transcriptional regulator, LacI family  59.7 
 
 		 344 aa  390  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3319  transcriptional regulator, LacI family  60.98 
 
 		 337 aa  380  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419074  normal  0.0675752 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1983  transcriptional regulator, LacI family  57.94 
 
 		 345 aa  376  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.597613  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2659  transcriptional regulator, LacI family  55.06 
 
 		 339 aa  358  9e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.34431  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1824  transcriptional regulator, LacI family  54.57 
 
 		 347 aa  352  5e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.021809  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2344  transcriptional regulator, LacI family  55.29 
 
 		 349 aa  350  2e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  normal  0.408649 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2320  LacI family transcriptional regulator  52.74 
 
 		 340 aa  338  7e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316441  normal  0.202359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6831  LacI family transcription regulator  51.95 
 
 		 337 aa  332  8e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2046  LacI family transcription regulator  48.94 
 
 		 344 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1873  LacI family response repressor  42.68 
 
 		 368 aa  287  2e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.845568  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1620  LacI family transcription regulator  45.9 
 
 		 337 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3338  transcriptional regulator, LacI family  48.5 
 
 		 341 aa  269  5.9999999999999995e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.680798  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0549  Alanine racemase  48.94 
 
 		 340 aa  263  3e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2790  LacI family transcription regulator  44.61 
 
 		 348 aa  258  8e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0181  transcriptional regulator, LacI family  46.85 
 
 		 341 aa  255  6e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844091 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4933  transcriptional regulator, LacI family  45.51 
 
 		 339 aa  255  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0794709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23440  transcriptional regulator, LacI family  44.01 
 
 		 350 aa  250  3e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.769589  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3985  transcriptional regulator, LacI family  46.95 
 
 		 338 aa  248  8e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.610149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4877  transcriptional regulator, LacI family  45.12 
 
 		 346 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00304627  normal  0.857214 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1825  transcriptional regulator, LacI family  45.35 
 
 		 346 aa  242  7.999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319362  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0971  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  42.64 
 
 		 350 aa  227  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0091  LacI family transcription regulator  40.42 
 
 		 346 aa  218  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0819  transcriptional regulator, LacI family  40.53 
 
 		 348 aa  216  5e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3482  Alanine racemase  42.41 
 
 		 359 aa  216  5.9999999999999996e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0777863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0193  transcriptional regulator, LacI family  38.86 
 
 		 340 aa  208  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3252  transcriptional regulator, LacI family  38.81 
 
 		 351 aa  205  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0502  transcriptional regulator, LacI family  40.52 
 
 		 344 aa  200  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0979375 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1125  transcriptional regulator, LacI family  39.94 
 
 		 341 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11530  transcriptional regulator, LacI family  38.92 
 
 		 331 aa  195  9e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809623 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  33.53 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  37.46 
 
 		 353 aa  192  7e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30450  transcriptional regulator  42.06 
 
 		 349 aa  191  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.158752  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0069  transcriptional regulator, LacI family  39.7 
 
 		 342 aa  191  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01670  transcriptional regulator  36.13 
 
 		 348 aa  191  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4415  transcriptional regulator, LacI family  38.58 
 
 		 342 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.42 
 
 		 339 aa  184  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0113  transcriptional regulator, LacI family  37.92 
 
 		 350 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  34.53 
 
 		 339 aa  182  5.0000000000000004e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2720  transcriptional regulator, LacI family  38.17 
 
 		 337 aa  177  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.687845  normal  0.476409 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31 
 
 		 330 aa  177  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.04 
 
 		 335 aa  176  5e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  31.31 
 
 		 331 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  35.29 
 
 		 346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  34.34 
 
 		 348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0168  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.05 
 
 		 347 aa  173  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  35 
 
 		 346 aa  173  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3586  transcriptional regulator, LacI family  36.34 
 
 		 333 aa  172  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  33.63 
 
 		 330 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  36.04 
 
 		 337 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  32.73 
 
 		 336 aa  172  9e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  35.15 
 
 		 332 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  32.73 
 
 		 337 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  30.66 
 
 		 386 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1789  DNA-binding transcriptional repressor PurR  34.74 
 
 		 341 aa  172  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0286691 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0186  transcriptional regulator, LacI family  36.36 
 
 		 330 aa  171  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01629  DNA-binding transcriptional repressor, hypoxanthine-binding  35.44 
 
 		 341 aa  170  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.847977  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1857  DNA-binding transcriptional repressor PurR  35.44 
 
 		 341 aa  170  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000046163  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1982  transcriptional regulator, LacI family  35.44 
 
 		 341 aa  170  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0168569  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4310  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.67 
 
 		 341 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4494  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.67 
 
 		 341 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1538  DNA-binding transcriptional repressor PurR  35.44 
 
 		 341 aa  170  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0686294  normal  0.0781462 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1526  DNA-binding transcriptional repressor PurR  36.04 
 
 		 341 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2372  DNA-binding transcriptional repressor PurR  35.44 
 
 		 341 aa  170  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000002203  normal  0.181026 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4426  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.67 
 
 		 341 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1971  DNA-binding transcriptional repressor PurR  35.44 
 
 		 341 aa  170  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000994316 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4340  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.67 
 
 		 341 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.302828  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01618  hypothetical protein  35.44 
 
 		 341 aa  170  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.850711  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4424  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.67 
 
 		 341 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1913  DNA-binding transcriptional repressor PurR  36.04 
 
 		 341 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000592501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  30.56 
 
 		 342 aa  170  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1563  DNA-binding transcriptional repressor PurR  36.04 
 
 		 341 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00208837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1738  DNA-binding transcriptional repressor PurR  35.44 
 
 		 341 aa  170  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.20958e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1744  DNA-binding transcriptional repressor PurR  36.34 
 
 		 341 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000285436  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  31.14 
 
 		 332 aa  170  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1540  DNA-binding transcriptional repressor PurR  36.34 
 
 		 341 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000065632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0182  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.45 
 
 		 347 aa  170  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1873  DNA-binding transcriptional repressor PurR  35.14 
 
 		 341 aa  169  7e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000326079  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  31.14 
 
 		 332 aa  169  9e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2403  transcriptional regulator, LacI family  38.62 
 
 		 379 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00011763  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  31.33 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  31.12 
 
 		 331 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  30.84 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  31.14 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  30.84 
 
 		 332 aa  168  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  30.84 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  30.84 
 
 		 332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  30.84 
 
 		 332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  29.29 
 
 		 347 aa  167  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  32.65 
 
 		 342 aa  167  4e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.06 
 
 		 342 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3918  LacI family transcription regulator  37.35 
 
 		 351 aa  166  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.06 
 
 		 342 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  30.93 
 
 		 335 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1683  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.23 
 
 		 341 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03819  DNA-binding transcriptional dual regulator  31.25 
 
 		 341 aa  166  8e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4084  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.25 
 
 		 341 aa  166  8e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4470  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.25 
 
 		 341 aa  166  8e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>